小编发现生物学家特别关系基因的表达情况,但一般而言目前的表达数据主要有两种(芯片和测序),芯片数据采用的是RMA值表示表达的高低,但是测序数据常常采用RPKM表示。问题来了,那么RMA和PPKM在数值上的经验关系如何呢? 8 P, A$ T7 X) D U8 u1 } " [( L: J7 a) |! }, F$ X, u: R4 Z8 f[attach]79552[/attach]" x! h6 a7 w& A9 u2 E
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根据经验:7 I, m. x' b$ l' L( T6 f
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现在清楚怎么解读测序数据的表达结果了吧,再举个例子:9 w9 ]0 |4 L3 b
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如图所示的这个基因UBQLN2 在大脑中呈现明显的高表达,在其他组织中是中高表达。在刚刚发表的Cell文章中,显示UBQLN2的功能缺失直接导致老年痴呆症,如此以来,大家就都明白了吧。 8 T { `; g; ]( \0 x/ L 0 q2 F$ Z, @8 a$ T. i( o% |转自微信号:表观遗传学快讯 4 \$ A! j @ n; o$ l3 Q5 M3 C % A1 m( i" Q' h, a4 M # V: g, O$ \, ~9 E, E