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标题:
重磅:生物学家必备知识-RPKM和RMA的定量关系
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作者:
Tlexander
时间:
2016-8-13 08:57
标题:
重磅:生物学家必备知识-RPKM和RMA的定量关系
小编发现生物学家特别关系基因的表达情况，但一般而言目前的表达数据主要有两种（芯片和测序），芯片数据采用的是RMA值表示表达的高低，但是测序数据常常采用RPKM表示。问题来了，那么RMA和PPKM在数值上的经验关系如何呢？
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根据经验：
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0<RPKM<0.1被认为是不表达，
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0.1<RPKM<1被认为是非常低表达，
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1<RPKM<10被认为是低表达，
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10<RPKM<100被认为是中等表达
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100<RPKM<1000被认为是中高表达
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1000<RPKM 被认为是高表达
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现在清楚怎么解读测序数据的表达结果了吧，再举个例子：
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如图所示的这个基因UBQLN2 在大脑中呈现明显的高表达，在其他组织中是中高表达。在刚刚发表的Cell文章中，显示UBQLN2的功能缺失直接导致老年痴呆症，如此以来，大家就都明白了吧。
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转自微信号：表观遗传学快讯
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