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隐秘的 CRISPR 军备竞赛
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作者:
yinfuhua
时间:
2017-3-30 23:46
标题:
隐秘的 CRISPR 军备竞赛
隐秘的 CRISPR 军备竞赛
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来源:生物通 / 作者: / 2017-03-30
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许多细菌都能对抗病毒感染。它们有一个 RNA 介导的 “免疫系统”,叫做 CRISPR Cas。利用 CRISPR 的天然属性(降解病毒 RNA),科学家们几乎能去除任何生物中的任何基因。
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CRISPR 系统中,最赫赫有名的无疑当属 CRISPR-Cas9。然而,共计 19 种不同类型的 CRISPR Cas,每一种都可能具备独特的遗传工程优势。它们是一个庞大的未开发的基因组编辑工具。我们越了解这些系统的构造,便越能更好的利用它们。
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细菌 CRISPR 系统的核心部分是一个复杂的监控复合体,它能够识别病毒 DNA 然后捣毁它们。
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但病毒也会反击。它们会利用一些 anti-CRISPR 蛋白使监控复合体丧失能力。
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在此之前,没有人知道病毒的 anti-CRISPR 蛋白是如何工作的。来自 Scripps 研究所 (TSRI) 的 Gabriel C. Lander 团队和蒙大拿州立大学的 Blake Wiedenheft 合作发表了一篇文章,第一次描述了 anti-CRISPR 蛋白的附着方式,揭示了它们攻占细菌防御系统的过程。
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anti-CRISPR 蛋白不仅能够锁定细菌识别、攻击病毒基因组的能力,甚至还玩起了模仿秀,欺骗 CRISPR,使其脱靶!
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这些微小的精密系统的相互作用,简直是一场进化军备竞赛,Lander 说。
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无声的战斗
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研究人员通过低温电子显微镜(Eryo-EM)的高分辨率成像技术,发现了 CRISPR 和 anti-CRISPR 系统中一些不为人知的现象。
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首先研究人员看到了 CRISPR 监控复合体分析病毒遗传物质弱点的方式。复合体内的蛋白质像手一样,紧紧抓住围绕在周围的 CRISPR RNA,并暴露出一些特别的细菌 RNA 区域,这些区域负责扫描病毒 DNA,快速寻找它们能够识别的基因序列。一旦 CRISPR 复合体鉴定出病毒 DNA 靶标,这个 “监控机” 立即开始招募其他负责捣毁病毒基因组的分子。
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接下来研究人员开始分析病毒的 anti-CRISPR 蛋白质如何麻痹细菌监控复合体。他们发现,有一种类型的 anti-CRISPR 蛋白默默的附着在 CRISPR RNA 的暴露区域,以 “身体” 遮挡的方式阻止 CRISPR 系统对其扫描。
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科学家们解释道,这些 anti-CRISPR 蛋白异常聪明。因为它们竟然找到了 CRISPR 监控系统中最关键的部分。如果强行阻止 anti-CRISPR 蛋白的附着,整个 CRISPR 系统甚至有可能 “翻车”。 除非改变 DNA 识别机制,否则细菌的 CRISPR 系统将无法阻止病毒的 “聪明” 防御。
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还有一种 anti-CRISPR 蛋白,对 CRISPR 使用了不同的计谋。通过分析它的位置和所带的负电荷,研究人员认为这种 anti-CRISPR 蛋白能够模仿 DNA。愚弄 CRISPR 来与它们结合,吸引火力,解救病毒 DNA。
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一个完美的开关
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研究人员相信,这些新的发现将提示我们构建更加复杂和高效的基因编辑工具。比如,在 CRISPR 系统中添加 anti-CRISPR 蛋白,以便随时阻断基因的降解。或者,通过调控 anti-CRISPR 蛋白的表达控制基因编辑的起始。
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原文标题:Structure Reveals Mechanisms of Viral Suppressors that Intercept a CRISPR RNA-Guided Surveillance Complex
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