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标题: microRNA名称后星号的含义是什么？ [打印本页]

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作者: ambassador    时间: 2010-5-27 14:44     标题: microRNA名称后星号的含义是什么？

请问，microRNA名称后星号的含义是什么？比如：hsa-mir-124和hsa-mir-124*，是同一家族的不同分子吗？如果是同一家族，但它们不仅序列不同，而且hsa-mir-124*中不含有hsa-mir-124的seed sequence，而用TargetScan也无法预测hsa-mir-124*的靶基因，请高手给予解答。

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作者: wuxiao101325    时间: 2010-5-27 16:57

miRNA* 是 pre-miRNA 上的一段 RNA，其位置恰好与成熟的 miRNA 相对。虽然 Dicer 在对pre-miRNA 的加工过程中能够产生RNA 双链中间体，但是这种中间体通常寿命比较短暂而不易被探测。不过，如果大量的前体均可产生并只产生一种 miRNA，则其双链中的星号链也可以成为成熟的 miRNA。

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作者: wuxiao101325    时间: 2010-5-27 17:11

最早出处：mmu-miR-28a* is a mature microRNA annotated in miRBase. The star represents that a mature microRNA is expressed from both the 5'-arm and the 3'-arm. In this case the hsa-miR-28a is expressed form the 5'-arm and the mmu-miR-28a* is expressed from the 3' mature sequence

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作者: ambassador    时间: 2010-5-27 20:27

miRNA* 是 pre-miRNA 上的一段 RNA，其位置恰好与成熟的 miRNA 相对。虽然 Dicer 在对pre-miRNA 的加工过程 ...
5 k# M4 X9 }0 `& T  s/ }8 Mwuxiao101325 发表于 2010-5-27 16:57

/ |1 a7 c# _+ c2 ~
2 B+ |1 q+ L4 A0 o% p/ W# r4 P3 G/ f  r3 y
$ N. y1 U( l5 k( f& V; r
    谢谢！有朋友在miRbase中查了下，说是针对同一个microRNA的不同序列 。
% l# J- b! e, ^+ p! r
) z0 r1 X( _, Y随便举例子：比如miR-？是针对4-16，miR-？*是针对46-60 。
( A4 }, x% L" p# f" X) f. U3 n& G2 i) w3 Q, }' K
和你所说的是同一个意思吗？

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作者: wuxiao101325    时间: 2010-5-28 07:33

回复 4# ambassador
9 x2 L5 R$ [$ Q其实我也不是很懂，不过这篇综述应该对你有所帮助
, ^0 U% Q5 d0 P" z; |( Mhttp://www.stemcell8.cn/viewthread.php?tid=21949&extra=

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作者: ambassador    时间: 2010-5-28 08:46

回复  ambassador
) k9 r9 K, n# H# I其实我也不是很懂，不过这篇综述应该对你有所帮助7 l$ }+ `6 C3 ?: N
wuxiao101325 发表于 2010-5-28 07:33

* \  N; |$ T5 p" Q, g' w6 o7 D  L4 P* }. ^

4 k8 Q2 }; j7 f    谢谢！正好前两天实验室听了陈润生弟子朱小蓬老师的一个报告，关于microRNA及Noncoding RNA的，复习一遍！

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作者: hljzyydx    时间: 2010-6-3 16:17

很简单，就是所谓的星链（我们是这么叫的），其实所谓microRNA及其miR*是相对的，microRNA经过加工后是两条链的，但是在沉默复合体中有一条是有作用的，我们习惯上叫它microRNA，而另一条叫miR*，但是有一点希望你注意，那就是miR*与microRNA并非完全匹配。。所以你根据microRNA的互补链的得到的序列不一定是miR*（个人观点）

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作者: ambassador    时间: 2010-6-6 23:02

很简单，就是所谓的星链（我们是这么叫的），其实所谓microRNA及其miR*是相对的，microRNA经过加工后是两条 ...
1 K) v4 i; v, c  thljzyydx 发表于 2010-6-3 16:17

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/ o9 ?3 r! ?" s+ w% U4 k
    哦，谢谢啊~这又是一种解释！！！
8 P- e) ]8 r+ x) X到底哪个是准确的呢？前阵子听了国外一个牛人的报告，麻州大学的翁志萍，讲的就是microRNA*，晕乎乎，整理中！有没有原文献啊~亟待解决中！

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作者: hljzyydx    时间: 2010-11-15 15:31

回复 8# ambassador 7 T8 X  s8 w! k8 e% O

; L& y  A! j3 V! Q/ M* O6 X/ ^, l; c, `
    呵呵，你可以简单的理解为互补链，因为MIR加工出来是两条链，传统认为一条是有意义的，我们叫MIR，另一条是无意义的，我们称星链，但是近年有报道MIR起作用有一些其实是通过星链起作用，而不是传统意义的MIR，所以这个话题现在才这么多人研究！就像我之前说的，星链和MIR不是完全互补的（我记得是这样，但有点记不清了）。

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作者: siyue13    时间: 2010-11-18 20:28

很简单，就是所谓的星链（我们是这么叫的），其实所谓microRNA及其miR*是相对的，microRNA经过加工后是两条 ...# _# \+ V( u6 u% ~# V
hljzyydx 发表于 2010-6-3 16:17

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) q% U' t6 j& u* ^good

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