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标题: Bisulfite genomic sequencing analyses甲基化测序的图是怎么做出来的? [打印本页]

作者: ambassador    时间: 2011-11-3 21:28     标题: Bisulfite genomic sequencing analyses甲基化测序的图是怎么做出来的?

大家好,Bisulfite genomic sequencing analyses中分析启动子区甲基化程度的分析中,这种图是怎么画出来的?
2 L" h0 i; E5 [+ ^" v, r& w Bisulfite genomic sequencing of the promoter regions of
, W( s8 d" ]5 A. N; U, Z7 M- ?$ g5 _, m- n8 x
用什么软件分析?有什么软件或者网页分析可以自动生成吗?

图片附件: [Bisulfite genomic sequencing of the promoter regions of] QQ截图20111103212439.gif (2011-11-3 21:26, 63.08 KB) / 下载次数 234
http://www.stemcell8.cn/forum.php?mod=attachment&aid=MzUwNzV8Y2YxNmVlZmR8MTc5NDUyMDAwMHww


作者: ellapan    时间: 2011-11-4 01:35

甲基化

图片附件: [甲基化] QQ截图20111103133408.png (2011-11-4 01:34, 74.65 KB) / 下载次数 290
http://www.stemcell8.cn/forum.php?mod=attachment&aid=MzUwNzl8M2ZhOWY4YmR8MTc5NDUyMDAwMHww


作者: ellapan    时间: 2011-11-4 01:36

晕 我记得这个问题我在本网上就回答了两遍了呀。 就是简单的word +powerpoint, 那些单独的圈圈你可以独立操作的,不过现在也有这种的 比较好看,我们现在采用上图这样的。
作者: ambassador    时间: 2011-11-4 09:14

ellapan 发表于 2011-11-4 01:36
1 u. w% r! u4 f& ^: A晕 我记得这个问题我在本网上就回答了两遍了呀。 就是简单的word +powerpoint, 那些单独的圈圈你可以独立操 ...
1 H. J/ ~; k8 L
不是吧?我还一位用软件自动生成的呢?如我上面那个图,为什么一组有三列?分别代表什么意思?选取多少碱基来作图呢?还是这一组就是一个序列,分为三列更好看些?
作者: exin11    时间: 2011-11-4 11:32

回复 ambassador 的帖子) Z" D$ I" p  n; q8 M& w- z% ^

9 `1 X3 W4 Z0 e这我已经发了,用软件http://www.stemcell8.cn/forum-vi ... D7%BB%F9%BB%AF.html
6 w% |$ G" u' e1 A+ n$ }0 i- ^; |别用word+ppt,跟造假似的
作者: ellapan    时间: 2011-11-5 02:54

楼上的好像有些不对题了,因为就CpG位点分析而言肯定是要用到网络资源的,而楼主提供的图明显的是自己测序结果整理后才制作出来的图。
作者: ambassador    时间: 2011-11-9 21:57

exin11 发表于 2011-11-4 11:32 7 B( ?8 K/ _+ p( Y9 X% ~1 F7 ]7 }1 X
回复 ambassador 的帖子
- f! D9 @) ^: I! h& z# m3 {5 F" A
7 Z4 h6 s  \- m5 d0 ]/ m2 s这我已经发了,用软件http://www.stemcell8.cn/forum-viewthread-tid-26601-highl ...
0 L& I; T* e* i% ~0 y3 t, i
太感谢了,我这得系统的看下了!
作者: exin11    时间: 2011-11-10 15:18

回复 ellapan 的帖子/ C" D6 @2 T  j- }0 t" q

1 T8 N1 o# T5 z7 z3 H: b7 j$ s不是的,这个测序图应该是将所测数据导入,自动生成,而不是说手工去画,你好好看看这些软件就清楚了。
作者: embryonic12    时间: 2012-9-21 19:17

回复 ellapan 的帖子
  L5 q/ z1 Y( h9 E7 @( [( }4 J" t: W* }" P+ u+ M
您好!
1 q) x2 r' D) O, ]/ X3 c恳请详细指点一下用Word+ppt如何做出最终的图,得到图后又如何单存为TIFF格式?另外您上面那个图用什么软件制得?
% N& d! v) K7 }( T" ]4 ~5 T2 D% i苟能赐教,不胜感激!
作者: ellapan    时间: 2012-10-4 04:23

回复 embryonic12 的帖子1 Z& a4 {$ u1 B3 U' |8 p; P

+ C4 S/ ]# x+ h- m  X/ C好久没过来了 这个就是在ppt画圈圈 然后选择有无背景(实心和空心圈),另外exin11 建议你可以参考下,我已经好久不做甲基化这块了 ! X/ _/ W) I" Q4 j





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