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标题: 怎么查一段DNA序列是否含有重复序列？ [打印本页]
作者: echowdk    时间: 2011-11-10 16:30     标题: 怎么查一段DNA序列是否含有重复序列？

有哪个软件或者网站可以查一段已知的DNA sequence是否含有重复序列，或者更详细的序列信息？
作者: john7812x    时间: 2011-11-10 18:31

你是要确定某基因在基因组中的拷贝数吧。
. S/ f) t  H3 N. G+ l基因拷贝数可以通过：1，Southern Blot法；2，荧光定量PCR方法，等来确定。而不是生物学软件的分析。
0 M; H2 b" E* f- P# j2 J8 C) f  g  K现提供一篇用Southern Blot方法确定拷贝数的英文文献供参考，其他方法你可以到网上查。
0 `% c# l: {+ U- `
' ~, V' w8 X+ z+ O7 b Identification of ribosomal phosphoprotein P0 of Neospora caninum as a potential.pdf (1.21 MB) ! P2 Y: }: C& k, x  l9 T1 w# v

6 Z6 B' ?9 P5 p2 ^3 D4 i; h

附件: Identification of ribosomal phosphoprotein P0 of Neospora caninum as a potential.pdf (2011-11-10 18:30, 1.21 MB) / 下载次数 8
http://www.stemcell8.cn/forum.php?mod=attachment&aid=MzUzNTB8YTExOTU1MTJ8MTc0Nzc4NjUwOHww
作者: zzc2211    时间: 2011-11-11 00:01

DNA Star,我用这个，但我们干的工作可能不一样
作者: echowdk    时间: 2011-11-11 09:00

回复 john7812x 的帖子, b* f' u' Z6 H( t; S
6 Q# a3 z" h9 {' i1 t% X& }
是啊。我是想做southern blot，设计探针。原来探针设计的要求还挺高的，所以想分析一下。
作者: langziforever    时间: 2011-11-11 13:44

回复 echowdk 的帖子
3 Q- s  W, `7 \0 `/ Q
  j9 i1 f$ @# S% u* K8 y& S设计探针很多都可以的，你是想找回文序列和二级结构的吧？我们以前用DNAclub，primer5这些，都可以，你甚至可以去找一些在线设计引物的网站，都可以实现这个要求的！
作者: echowdk    时间: 2011-11-11 14:00

回复 langziforever 的帖子/ p* N& S0 T/ ]3 F) f# @- h% C$ ]
  l+ H) \+ K  s% o1 R0 \
哦，谢谢啊~
作者: yyshpy    时间: 2011-11-11 14:17

回复 john7812x 的帖子: k. ~. x8 [' Z
  W8 j: E, w) I  n
学习了



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