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标题: 瞬转后用puro/nero杀哪个好点 [打印本页]

作者: hyde    时间: 2011-11-13 09:38     标题: 瞬转后用puro/nero杀哪个好点

电转后细胞用puro杀总是养不活^^
3 S, l: ~% M9 o" z2 d% A( _考虑过用nero,但时间太长质粒还能起作用吗?
作者: 懵懂干细胞    时间: 2011-11-13 10:08

puromycin ? 你用多大的浓度啊?细胞数目怎么样? 细胞少的话用药浓度就低一点,这个条件自己慢慢摸一下!
作者: xiangchou812    时间: 2011-11-13 10:30

我最近刚做了一下puro的筛选梯度,在山羊成纤维上做的,感觉浓度在0.2-0.4vg/ml之间。
作者: shylook    时间: 2011-11-13 12:12

puro 不过得做下梯度摸好浓度7 L, x; i- p" o: j9 e
nero不行 细胞很容易产生抗性
作者: jj.jianjia    时间: 2011-11-13 12:31

我用lipofectamine转染fibroblast,用2ug/ml 的puromycin,每次都几乎没有活口。难道是浓度太高了?
作者: hyde    时间: 2011-11-13 20:44

我用5u/ml 的puro杀感觉都有活口的,但细胞长的像薄饼,扩不出来的……(电转的),细胞原来是100万/ml
3 E2 J# M7 v0 p+ ?% |9 M& C4 j7 O有些paper用的nero,杀十几天的……% i, J0 N2 w# c$ C" @* U' Y% ]# @
求有成功经验者给予指教……
作者: zzc2211    时间: 2011-11-14 01:10

我是做肿瘤,不同细胞对puro的耐受不同,从25ng-500ng/ml都有,首先摸一下耐药浓度,48孔板,倍比稀释,可选加药后7天左右全部死亡的浓度做筛选,同样也是筛选7天左右。也有偷懒的办法,1ug/ml,3-4天或2ug/ml,2天。但个人经验后者不如前者,一筛全死的情况常有,而同样的细胞用第一种方法能够筛出来。理论上讲不过去,但我研究的蛋白就是如此。可能受转染效率,目的蛋白功能,细胞密度等等的影响吧。建议楼主还是摸浓度后再做。有时候偷懒的办法更费事。
作者: zzc2211    时间: 2011-11-14 01:14

另外转染后,细胞传10代,质粒一般没问题。超过此时间就难讲了。如果研究knockdown,理论上用高浓度,短时间的迅速筛选好一些吧。往往理论和实际操作有出入。
作者: jj.jianjia    时间: 2011-11-14 01:39

回复 zzc2211 的帖子" y8 }# R; e- K3 y  E$ Z
9 p6 n3 O- f) d, ~: |" M  U: Y8 U% |
我买的puromycin说明书上让尝试1ug-10ug/ml的浓度,3-5天筛选期。
' o  ]. f# ?2 b  K% d  c再问个问题:过完筛选期之后是不是就立刻去掉puromycin?多几天时间细胞也是会死的?
作者: hormone008    时间: 2011-11-14 09:40

最好用嘌呤霉素puromycin,效果好于G418,G418要很久细胞才开始大量死亡,假阳性也很多。相反,puromycin就在这两点上好于NEO$ C: j1 X+ a- ^9 Y# F& N: R
抗性!3 `2 V5 \0 O+ F3 c

作者: linzi214    时间: 2011-11-14 09:42

嘌呤霉素是抑制细胞有丝分裂的,应该是接种细胞的时候就加进去
作者: hyde    时间: 2011-11-14 12:44

药杀是每天都要换液吗?
. q  u$ b  C" N8 ?7 o1 E5 H# P8 C# y电转后几天开始杀比较好……试过2、3天的,有时候感觉药杀后细胞的荧光增强了……是不是质粒整合进去了(用线性化质粒)
作者: hyde    时间: 2011-11-14 12:46

感觉(不加质粒)电转的细胞和不电转的细胞进行药杀效果不太一样…………摸药浓度是不是应该用前者
作者: bobo198666    时间: 2011-11-14 15:09

puro好于G418,在筛细胞之前要测个puro浓度梯度,三天内逐渐把细胞杀死为最佳浓度,一班是0.7ug/ml,筛细胞后两天加药两天正常培养基,前后一周的时间久出克隆了
作者: zzc2211    时间: 2011-11-14 21:13

回复 jj.jianjia 的帖子
$ O" v2 {1 K: z( E2 h# g7 T" U8 E# s
筛选之后最好低剂量维持筛选,维持浓度可以倍比稀释摸一下,puro一般维持浓度在50-200ng/ml,细胞不会死。我们做慢病毒感染,不利于细胞原来体系的目的片段有可能被去除。即使低剂量维持,往往knockdown后传代10次,也不能确保功能维持。我们最终目的是研究功能,慢病毒感染后,多冻几支,每只能用3-4周,时间久了,和刚感染后的时间点相比功能有改变,就丢掉。因研究的目的蛋白不同,做法可不一样。根据蛋白在细胞的功能重要性,有些蛋白不维持也可。
作者: bobo198666    时间: 2011-11-14 22:22

puro比G418好,G418假阳性很多,如果是puro筛需要加两天药,撤两天药,G418可以一直加药
作者: jj.jianjia    时间: 2011-11-16 07:49

综合各位的回复,总结如下:0 y! E" P. T* |
1. 转化前先摸索浓度: 加药后7天全部死亡为标准,或者1ug/ml,3-4天或2ug/ml,2天;前者可能细胞存活率高于后者,+ F; }3 G6 _% C2 d) b' b* u. v- U
   不同细胞耐受性不一样,xiangchou812:山羊成纤维-0.2-0.4ug/ml;- q( {% }2 F; m4 T' g+ V
                                         zzc2211: 肿瘤细胞-0.025-0.5ug/ml;
( C8 O0 G: k' W: u5 N9 X                                         bobo198666: 0.7ug/ml ;" g4 `+ Z. F# O8 ?6 ]4 h* o+ O
2. 转化后两天之后加入puro筛选,加两天药,停两天,一周左右出克隆;  B$ H- o, Y8 h; \
3. 筛选之后最好低剂量维持筛选,维持浓度可以倍比稀释摸一下,puro一般维持浓度在50-200ng/ml,
: P  v4 O1 \( {: T4. 10代之后,效果变差。
作者: jj.jianjia    时间: 2011-11-16 07:51

不过还有个问题:我做浓度梯度摸索的时候,到第五天,puro浓度为1ug/ml的孔中,细胞死了大部分但是还有大约1%的贴壁,这种情况下,算是死了吗?2.5ug/ml的孔就基本上一个不剩了。所以我选用了2.5ug/ml的浓度。这个浓度还是太高了?
作者: jj.jianjia    时间: 2011-11-16 07:51

不过还有个问题:我做浓度梯度摸索的时候,到第五天,puro浓度为1ug/ml的孔中,细胞死了大部分但是还有大约1%的贴壁,这种情况下,算是死了吗?2.5ug/ml的孔就基本上一个不剩了。所以我选用了2.5ug/ml的浓度。这个浓度还是太高了?




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