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标题: 帮忙翻译一下这个题目 [打印本页]

作者: trl137 时间: 2011-12-2 18:33 标题: 帮忙翻译一下这个题目

Pigs in sequence space: A 0.66X coverage pig genome survey based on shotgun sequencing

作者: trl137 时间: 2011-12-2 18:34 标题: 补充

我不太懂基因组，想知道测序深度，测序覆盖率是什么意思？文章中0.66x是什么意思？谢谢各位

作者: wang3033 时间: 2011-12-2 22:41

因该是测序的总长度是pig基因组序列长度的0.66倍。一般测序都要覆盖基因组序列长度5-10倍，基因组精确测序一般要覆盖基因组序列长度的20-25倍。

作者: changbo529 时间: 2011-12-4 01:11

用鸟枪法测量猪序列的总长度应覆盖猪基因组序列的0。66倍

作者: changbo529 时间: 2011-12-4 01:13

全基因组鸟枪法测序的主要步骤是：第一，建立高度随机、插入片段大小为1.6kb到4kb左右的基因组文库。克隆数要达到一定数量，即经过两端测序的克隆片段的碱基总数应达到基因组大小的6到10倍。第二，高效、大规模的克隆双向测序。第三，序列组装。借助Phred, Phrap, Consed 软件进行序列组装，产生一定数量的contig。第四，填补缺口。有两种待填补的缺口，一是没有相应模板DNA的物理缺口，我们通过PCR的方法进行填补；二是有模板DNA但未测到的序列缺口，我们直接在模板DNA上设计引物测序。

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