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标题: G418筛选细胞，为什mRNA水平和蛋白水平不一致呢？很是郁闷 [打印本页]

作者: 微笑流滢 时间: 2013-5-28 09:46 标题: G418筛选细胞，为什mRNA水平和蛋白水平不一致呢？很是郁闷

而且重组质粒上有His 和Myc标签，用这两种抗体检测时，对照里面也有，郁闷郁闷，问问大家有没有这种情况? 求分享，感激不尽，是我原先筛的克隆不彻底吗？需不需要进行二次筛选？& ~7 O, N, A9 A2 t0 d- ^- L0 P+ s& e

作者: yangcy-smile 时间: 2013-5-28 10:22

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首先关于不一致的问题我的理解有两种：一是RT-PCR可能就有误差，最好进行三次独立的实验。二是假如你设计的引物是针对目的基因的，RT检测的是外源加内源，蛋白检测的是外源的这个会出现不一致的情况。还有假如你用的标签在载体上，目的基因比较小，也有可能出现对照中都有的情况吧，你对照中出现的条带位置与实验组一样么？

作者: 微笑流滢 时间: 2013-5-28 10:38

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恩恩，条带都在一个位置，用了专门针对外源的引物了，可是还是不行，我上次挑了4个对照和8个过表达克隆，Western检测到几个克隆过表达目的基因，可是用RT-PCR验证了下，和蛋白水平完全不一样

作者: yangcy-smile 时间: 2013-5-28 11:04

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我有点迷糊，你做得是原核表达？

作者: 微笑流滢 时间: 2013-5-28 11:09

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呵呵，是真核表达用的pcDNA3.1(-)质粒，条带都在一个位置，所以很郁闷啊，按理说应该对照检测不到条带啊，这个先不说，关键是蛋白水平检测到的高表达克隆，他的mRNA水平很低呀呀呀呀呀

作者: yangcy-smile 时间: 2013-5-28 11:23

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确实很棘手，我也被搞迷惑了。

作者: 微笑流滢 时间: 2013-5-28 12:34

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呵呵，还是谢谢了

作者: 微笑流滢 时间: 2013-5-28 13:09

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我筛完克隆后剩下的细胞还保留着，我是再复苏起来继续筛呢？还是再重新转染呢？有什么好的建议吗？？尽管提呵，洗耳恭听

作者: yangcy-smile 时间: 2013-5-29 09:29

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我师弟在建细胞系的时候遇到过这种情况，他也是筛到最后细胞成了克隆，怎么筛也不死，但是并不都是阳性克隆。我觉得首先确定自己构建的质粒绝对正确，没有空载体的存在。然后转染建稳转时拿什么都不转的细胞来做阴性对照，只是在筛之前对转有质粒和空载体的平行细胞组进行检测，看是否表达，然后确定表达后再对平行转染质粒和没转染的用以前摸索好的G418浓度进行筛选，基本达到阴性全部死亡，阳性克隆存留，这样再对建成的稳转细胞系进行RT或者Western检测时用没转染的细胞做阴性对照即可。一点拙见，可能帮不上忙。

作者: 微笑流滢 时间: 2013-6-6 15:34

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嗯，老师也建议我这么做，太感谢了

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