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标题: 主成分分析图怎么读啊 [打印本页]

作者: a279915845 时间: 2014-11-5 20:59 标题: 主成分分析图怎么读啊

本帖最后由 a279915845 于 2014-11-5 21:04 编辑 7 t4 f. z. `! C1 f( H/ z* a

求助大神，

图B和C怎么看啊，求帮助，谢谢，来自于文献Reprogramming to Pluripotency through a Somatic Stem C4 P& I+ r% A) C, O* z5 k; v
Cell Intermediate 3 D; ~! S. x# }& x) v6 _3 Y4 w
Fig.2 （C）中，

作者: FreeCell 时间: 2014-11-5 23:44

B是分级聚类分析（Hierarchical clustering），C是主成分分析（principal component analysis）都是数学软件处理的结果，只用看关系远近即可

作者: dabai22222 时间: 2014-11-5 23:52

请参考附件华联公司的PCA分析描述

附件: PCA 华联.pdf (2014-11-5 23:52, 3.37 MB) / 下载次数 16
http://www.stemcell8.cn/forum.php?mod=attachment&aid=NjUyMzJ8M2U1YWYyMWR8MTc4MjY3MDkyMnww

作者: a279915845 时间: 2014-11-6 10:29

回复 dabai22222 的帖子: U6 O9 U# t, Q
" v5 |+ Z6 \6 P- Z9 s6 ?" `8 W$ f
非常感谢您的帮助，谢谢，另外D图的成对比较怎么看啊，求再指导一下，谢谢

作者: a279915845 时间: 2014-11-6 10:31

回复 FreeCell 的帖子
7 W( o) R8 D# E0 T; j8 Q1 n/ o
非常感谢您的帮助，另外再请教一下，C图和D图具体怎么看啊

作者: FreeCell 时间: 2014-11-6 13:09

C图表示主成分相似的聚在一起，可以看出iNdiPSCs与ESC多能性高度相似，重编程成功
D E F是成对散点图，表示共表达信号水平一致的落在对角线区域，1 E: R6 h/ }# o8 Z- x
D——iNdiPSCs与MEF有两个因子表达水平相当，4 H+ P( m* ^. R- p' _
E——iNdiPSCs与iNSC只有SOX2一个因子表达水平相当，
F——iNdiPSCs与ESC有四个因子表达水平相当，1 ]/ c) K' {0 l3 G) T# j

作者: FreeCell 时间: 2014-11-6 13:38

本帖最后由 FreeCell 于 2014-11-6 13:41 编辑
9 u1 s6 d" U( b
[attach]65240[/attach]9 @9 R6 f% ~( O% x5 V% [/ ^

[attach]65241[/attach]
插图怎么不显示？

作者: 开心果王 时间: 2014-11-6 15:11

回复 dabai22222 的帖子: j) p4 i5 ^- X0 Y0 G

能否将华联的数据分析介绍的几个topic 一并上传，每次看到paper中关于数据分析的图都很头大

，看到dabai22222上传的文件很不错。多谢！

作者: a279915845 时间: 2014-11-9 09:51

回复 FreeCell 的帖子

懂了，非常感谢您，谢谢

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