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标题: 造血干细胞流式检测结果分析 [打印本页]

作者: SKC-SFC    时间: 2015-6-3 16:23     标题: 造血干细胞流式检测结果分析

各位大侠,我们实验室目前在做造血干细胞的鉴定。采用流式细胞仪检测,选择的标志物是CD34+CD45+CD133.2 b3 d# n9 S8 B% p) O
方法是:标记去红后,用CD45/SSC画R1门,圈定白细胞-画CD34/SSC双参数图,显示R1门,画R2,-建立CD45/SSC双参数图,显示R2门,画R3门-建立FSC/SSC散点图,显示R3画R4门-回到R1门所在图,选择CD45阳性最强和SSC最大的位置画R5门-重新确立R4门的位置-画CD34/CD45&CD45+CD133双参数的十字门,确定R1门的临界位置来重新确定R3的位置。
3 b2 |& K; p! T$ h# q# ]不明白的地方:
, W# _# w+ ^: D6 i& ?0 ]1.CD133的必要性
# C6 Z( W2 h. X' e2.最终造血干细胞的统计学数据是R3还是R4的统计学数据?
* E% A5 J6 v3 T/ @0 |, D" L% j3.通过R5门来重新确定R4门作用在哪里?
. @9 K7 P& d% b: z4 V1 R% D4.我的这个实验思路无问题
& ?$ [) p3 B4 U8 e求各位大侠指点,谢谢!
( h% E- p0 c! Q8 X* l1 z   
作者: SKC-SFC    时间: 2015-6-3 16:31

顶起
作者: nailute1985    时间: 2015-6-4 08:58

1、cd133必要性不是很强,造血干的特异性标记就是cd34+ 所以用双标就可以了。
- E; o. f& ~& m  C* |$ r2、你用的是十字门吧?但是我们做造血干的标记的话是用的逻辑门,大体上是这样的:首先ssc/cd45设门圈有核R1,然后R1里面做cd34+/ssc 圈cd34强阳为R2,然后R2里面做cd45/ssc 圈弱阳cd45为r3,然后r3里面做fsc/ssc 圈弱ssc那部分为r4,r4就是结果。' s+ e, n) S$ A2 h& \
3、楼主选的是强阳性的cd45吗?我觉得应该在cd34+细胞群中找到弱cd45的 那才是真正的造血干,并且在ssc/fsc中也要找出ssc弱的那部分。
作者: SKC-SFC    时间: 2015-6-4 09:43

回复 nailute1985 的帖子
2 [, m: @9 U3 ^( U4 q% Q; v0 ~
3 E4 k: c# w7 u+ c首先要谢谢您的回复。
" K0 z) V$ {4 ~0 J) m. {8 T, q1.选择CD133是老板的意思,因为国外不少文献说,CD34-的那部分细胞也具有造血功能,而且不少国外文献有把CD133加入和协助鉴定造血干细胞。
' b! j$ a5 ]! x/ S( P, I8 O7 Q: y2.我们这边也是把CD34+中找CD45弱阳性的那群。/ T3 ]/ f, l7 z( ^) J  I/ \1 [* K
3.您说您觉得R4就是结果,我一直觉得R3是结果。因为R4不是为了验证这群细胞是否落在幼稚的淋巴群中,只是为了验证?
9 r1 W' L' t, P: C( _; a' g4.建立FSC/SSC双参数图的真正意义在哪里?; s9 i' ?2 w. p/ `& u4 m) B* y* A
5.设立十字门的目的又对整个结果起啥作用。从实验设计来看,设立CD34+CD45的双参数十字门是为调整R3的位置来设置的哦。; a/ D/ Q3 T% S
6.关于R5门的画定,有时候左边的杂细胞群挺多,R5的位置不是那么好花,很担心是把单核细胞群画进去了。
作者: nailute1985    时间: 2015-6-4 09:57

回复 SKC-SFC 的帖子* \: E- k# H1 r& `* g
7 m, G; f/ H. k7 S
1、你们是研究,我们是临床,所以肯定成本我们会考虑进去,cd133成本会高很多。其实绝大部分的造血干都会表达cd34,剩下的只是极小一部分
) Q7 I9 i- d& D1 \' o! ]6 W3、R3可以基本确定,R4的用意确实是为了验证这群细胞是否在淋巴群里,但是我觉得r4是很有必要的,因为如果你看r4的流式图的话,会发现r4的范围很宽,所以最后圈r4还是有必要的。不能全圈上,不太准。5 E" }3 d1 ]7 B" q# ]# p" A
4、fsc/ssc这个是必须的,无论做哪个标记。这个就是最直观的看三系分区的状态的。1 c  J; r: W1 F# l" w
5、其实十字门也不是不可以,但是对于逻辑门来说更合适,十字门分区并不是很准确,会有压线那种情况,不好区分。
* b1 c7 h/ Q$ ^. J2 ]/ j! {6、这个是比较常见的状态,因为这跟你去红去的干净不干净,或者血液本身的质量有很大关系。
作者: SKC-SFC    时间: 2015-6-4 10:10

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/ w* a+ ^- z* C* v( s( i9 @5 v4 w
2 Z! X2 p8 b& G, m1.我们也是临床,只是老板希望我们先累计CD133的数据,通过将CD34+和CD133+的数据进行统计学的分析,若无差异的话,就可以采取CD34+CD45直接进行标记检测并分析。
# M: G6 u5 V4 l& u) L" x4 T2.从您表达的意思来看,造血干细胞应该具备以下几个条件:CD34+,CD45弱阳性,这群细胞是位于幼稚淋巴细胞群里?
7 w) ]1 }2 q+ _: T) l! x& g3.我们画R4门,就是在FSC/SSC的散点图中画的。
& H3 a9 j% `9 r6 u2 E4.关于十字门我赞同您的意见。但文献都这么做,不知道是为什么?
" ]# `) p, A' }# F2 z6 ?' J5.我们去红还算是非常的干净,有时候做出的我图和文献上一致,结果也好分析,有时候回有左侧拖尾的情况,我们一般是通过调大阈值来去除干扰。因为我们的设备不需要调电压。; V/ G% G1 H' w& w$ @  f
6.最后咨询一下CD34+CD45+CD133做同型对照的实验设计.
6 @( K1 }9 c& o; r' p4 X/ O谢谢!
作者: nailute1985    时间: 2015-6-4 10:26

2、并不是cd34+和cd45弱阳,而是cd34+与cd45+的那一群圈出来之后,相对再找出cd45弱阳的那些。对,位于幼淋那片2 Y: `1 h; `  X' |7 j2 Z# R
4、十字门在文献中很直观,直接就能看出来双阳或其他的,不像逻辑门,还得一步步分析,文献中是没办法解释的。* m0 }3 Z. U6 z
6、isotype的话,很简单,不就是要去除非特异性的么,所以只要把cd34和cd133换成同性对照就ok了。cd45依然做阳性管9 S/ P; r, X. `$ K

作者: fm100200    时间: 2015-6-4 13:29

学习了
作者: SKC-SFC    时间: 2015-6-4 14:30

回复 nailute1985 的帖子' C9 a9 O% D1 g+ l

4 g$ N2 N) Y3 A谢谢.
作者: yuanyecat    时间: 2015-6-5 15:56

上图啊没图没真相啊
作者: SKC-SFC    时间: 2015-6-7 10:31

回复 nailute1985 的帖子7 Z3 i2 m) _& d
5 p' B( g! |8 A  ~% w2 Y
您好?关于造血干的同型对照实验,我还不是很明白。希望您可以在百忙之中帮我解答一下,万分感谢。我们现在是做CD34+CD45+CD133,请问这三种标志物的同型对照实验怎么设计。然后分析方法呢?我们用的是Accuria C6
作者: nailute1985    时间: 2015-6-7 11:39

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' B* Y" }+ C4 h  H4 d6 ^' A: J' K% u# z6 s5 I: x% _
你阳性管实验怎么设计的,对照组就把阳性管加的抗体换乘阴性管就行了。cd45不用换
作者: nailute1985    时间: 2015-6-7 11:40

回复 SKC-SFC 的帖子: z- `0 V4 r8 t( |
  _1 |  o8 }! d" M2 ^3 V  R6 {
比如你阳性管加的是cd34 cd45 cd133的三样 对照组就加cd34跟cd133的同型对照 cd45不变
作者: SKC-SFC    时间: 2015-6-8 10:14

CD45同型对照不加吗?那CD45的检测值不需要减去CD45的阴对值吗?
作者: SKC-SFC    时间: 2015-6-8 10:15

按您的涉及方案 调荧光补偿怎么调呢?
作者: 细胞海洋    时间: 2015-6-9 09:12

回复 SKC-SFC 的帖子) x5 Z2 j* F/ B1 E: O

9 H% Q, A( X( F% N' l8 i" c# \/ L你回复谁 就点击对方回复帖子中的回复按钮 然后输入内容 像我这样
8 C: _/ |# b- E+ s
: o4 v% |$ ]5 b: E8 R否则他会看不到& d. H! _) L$ U* Y# ^) H

作者: SKC-SFC    时间: 2015-6-9 09:27

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; ^: U( U9 H; x7 t+ b* P! O; k3 d1 u, C. T: h
CD45同型对照不加吗?那CD45的检测值不需要减去CD45的阴对值吗?& a9 j3 B9 A4 ]3 A7 X
按您的涉及方案 调荧光补偿怎么调呢?
5 N. }. c& j4 `! n: G+ E您若把实验设计发给我,我万分感激。谢谢哈
作者: nailute1985    时间: 2015-6-9 10:13

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/ J4 Z0 S. i7 N3 @9 |$ p* {' U6 \* R8 z
cd45的可以不用加了。因为你去红之后留下的基本都是有核了,cd45的非特异性染色没有必要做,因为不可能出现cd45非特异性染色之后cd34还是阳性的情况了。实验方案这个应该是个商业性的东西了,不好发给你,望谅解。但是我可以告诉你的是cd45的isotype不用做滴。
作者: nailute1985    时间: 2015-6-9 10:14

回复 SKC-SFC 的帖子4 d, y2 h; B2 W: k
' p! E: F. w) B# k/ s+ c
难道你的阳性管没有调补偿就直接做了?如果已经调完了 对照是不需要调的 如果你调了,连实验平行性都破坏了,还叫做阴性对照不?
作者: SKC-SFC    时间: 2015-6-9 10:45

回复 nailute1985 的帖子: Y$ e  i5 t  k" O. x
' W% N0 h- p( e7 O8 [$ K
我们是调完补偿后检测,样品管和阴对管分别分析,然后结果是是检测管的值减去阴对管的值就是了。问题是我们的几个通道都远。只有一个需要调补偿。通道间隔远的,比如第一和第四的话都没有调的必要了吧.
作者: SKC-SFC    时间: 2015-6-9 10:54

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1 D& n) A7 d) K2 O- x
9 J/ S& ]. x; r* M9 P这个地方我有点糊涂了。我们以前做表达量高的时候,基本就不做补偿,直接做空白的细胞对照。现在这个造血干细胞因为表达量极低,必须做补偿。我看文献上都说是用同型对照(阴性对照)去调补偿之后,再测定单个的项目?
作者: nailute1985    时间: 2015-6-9 13:41

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1 x/ l4 g2 r  K6 q! |6 A! @$ o% [& S. V  S0 X( ^
对 你是fitc跟pe吗?那你第四个不用调 123都需要
作者: nailute1985    时间: 2015-6-9 13:42

回复 SKC-SFC 的帖子; Z& l8 |' g& v+ ]0 ]* j/ t
) G2 m& O8 ]/ D0 |
你一开始的阴性区的阈值就是用同型对照来调的,所以阴性管你就不需要再调了对不?
作者: SKC-SFC    时间: 2015-6-9 14:41

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; T; m( a: n/ s# d; G2 ]  C. S. G3 d1 H+ p+ z9 R- i0 w7 c
好的,谢谢!您的意思就是:
' D5 O5 o/ e, Q' m( Y8 U! X1.样本品管仲加入待检细胞+CD34-PE+CD45-FITC+CD133-PerCP,对照管加入待检细胞+CD45+CD34-PE和CD133-PerCP的同型对照抗体
4 ]% K1 o6 r" f$ N. r2.测定对照管,根据检测情况调补偿和阈值。调至合理范围。通道之间无荧光干扰。% }% m5 X) ]" X( l
3.检测样品管,画3个图FL1,FL2,FL4进行分析。这个时候还需要话FL1/FL2,FL2/FL4,FL1/FL4的十字图吗?
作者: SKC-SFC    时间: 2015-6-9 15:00

回复 nailute1985 的帖子
6 p! @" _+ S  @. P. ^) ~
. X6 u1 D7 Y' o; U我想了一下应该是这样:/ f3 g* ^4 ^% v) f
1.样本品管仲加入待检细胞+CD34-PE+CD45-FITC+CD133-PerCP,2 T9 [5 @8 H9 `+ C
2.阴性对照管加入待检细胞+CD45+CD34-PE和CD133-PerCP的同型对照抗体
# i) h0 v  m1 S/ y  ~3.补偿调整管:需要3管,一管是CD34-PE+细胞+另外两种抗体的同型对照抗体,以此类推2 a6 i7 Z% F& M# d+ ^" w7 @) C$ l
4.根据检测情况调补偿,调至合理范围。通道之间无荧光干扰。
  z/ p5 [/ u6 ?1 ~5.检测样品管,并分析.
作者: nailute1985    时间: 2015-6-9 16:21

回复 SKC-SFC 的帖子9 p4 x6 ~9 M& C5 N3 l# v! F

5 q) {2 H& Z# S% M& j- M是这的没错
作者: nailute1985    时间: 2015-6-9 16:21

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* x; @& X2 v- z# x% c
5 i) H3 R+ U! U& k2 O0 ]. v$ }十字门不需要的~你这个是逻辑门,例如:只要把阳性管中FL1的名字改成isotype就行了
作者: SKC-SFC    时间: 2015-7-3 09:55

回复 nailute1985 的帖子) d5 x; D% a" f3 V
  [8 M, u( B+ Z+ l' b
您好,最近我们又做了造血干细胞的鉴定实验。有几个问题我需要咨询。" c- g- d8 ~; n! H( p# u
1.在检测同型对照的时候,是需要先划门吧?这个门怎么划?
5 D2 }0 j$ L+ l2.在调补偿的时候,为什么3和4通道的荧光没有干扰,不需要调整呢?而1和4通道反而需要做出调整呢?* @# ^4 K$ a9 e  I+ _( o( }
3.我看文献上说,逻辑门R4显示出来后,还需要去除比淋巴细胞还小的那一群。但看不出来这个是怎么划新的R4门的?
作者: SKC-SFC    时间: 2015-7-3 10:00

回复 nailute1985 的帖子
6 P4 k' E7 M% d6 Y& a
! ?- }% c, t- k. W4 i3 t6 @R4门比较宽,说是需要进一步去比淋巴细胞还要小的那部分细胞或杂质。大概方法是从SSC/CD45的散点图中选取淋巴细胞那群,然后设为R5,然后重新简历FSC/SSC散点图,把R4门复制到此图中,并显示R5,说门划到SSC最低和FSC在100的位置,这个200是左边起还是右边止呢?但得到的结果15%以上,这样的结果不对啊。另外有个样本的同型对照荧光比检测荧光还要强.
; q, D1 C9 p! ^3 V) k9 M  F, x多谢回答!
作者: nailute1985    时间: 2015-7-3 16:55

回复 SKC-SFC 的帖子# p2 N7 e) T  M9 N

  b) ~5 y  e) {& ]0 G8 v1、同型对照的门当然跟你cd34门是一样的 要不怎么叫做同性对照- E1 n% o6 p* V/ p# K% P6 {$ o
2、这个需要看你用的是什么荧光材料了……1、2、3、4四个通道的发散光谱是不一样的。3和4差的比较多那肯定就不需要补偿啊,1跟4差的少,光谱有重叠,那就需要补偿。
+ T8 K) t1 F9 B1 l3 O$ z7 n
作者: SKC-SFC    时间: 2015-7-4 08:23

回复 nailute1985 的帖子; E0 |' A  D2 Q+ V1 ^) h

) Q- ?7 [7 W% Q, J1.CD34的门?不是从FSC/SSC散点图画门后检测3个补偿管(3个抗体)进行调补偿吗?5 {: d; U1 ^0 \- ^
2.然后这个画门的位置在哪里呢?
作者: SKC-SFC    时间: 2015-7-4 08:39

[attach]70454[/attach][attach]70450[/attach][attach]70451[/attach][attach]70452[/attach][attach]70453[/attach][attach]70448[/attach]
作者: SKC-SFC    时间: 2015-7-4 08:42

回复 nailute1985 的帖子% N" k# A4 R( v+ G9 h* f

4 {7 u* k: M, N6 x[attach]70463[/attach][attach]70464[/attach][attach]70465[/attach][attach]70466[/attach][attach]70467[/attach][attach]70468[/attach]
作者: nailute1985    时间: 2015-7-4 10:25

回复 SKC-SFC 的帖子
; A" T' _1 v6 A& c8 }9 k3 z- X0 C. \
/ w2 F. ?$ x& C1、我的意思是在你做同型对照或者cd34+检测之前就得用阴性对照把补偿什么的调好了,然后你的isotype跟你的cd34+用的是同一个protocol 就不需要单独调了
: x) U/ H3 }5 n% o; o, L& G2、看你设的这些门没有啥大问题啊 你是哪个门不确定?$ d( F! ?6 L: j! G

作者: nailute1985    时间: 2015-7-4 10:27

最后cd34+ 0.8%正常啊
作者: SKC-SFC    时间: 2015-7-5 09:26

回复 nailute1985 的帖子
* m( E0 V" C+ v: o* I. P8 L
( z0 S# T3 r: j0 z1 z都用同型对照了,还有什么阴性对照呢?难不成还得用细胞做阴性对照,不是多此一举吗?
作者: SKC-SFC    时间: 2015-7-5 09:29

回复 nailute1985 的帖子# D9 Y/ g: M5 b9 T, M* q! T5 X  T. {
& Z5 l! f# q. h
我们是用调整过的R4(在FSC/SSC的散点图中,显示R5,把R4的图复制过来后,把门的左侧划到200位置)作为最终的结果,大概0.2%左右。
作者: SKC-SFC    时间: 2015-7-5 09:32

回复 nailute1985 的帖子& B/ h3 D! m# Z. u. y4 r, f" Y

% n$ U: Y. i% ?2 O2 H. w大部分门的设置没有太大的问题,有两处有疑惑,第一个在调补偿的时候,同型对照也就是阴性对照的管的划门位置(R1)怎么划合适。第二个是调整后的R4的调整位置在哪里?
作者: SKC-SFC    时间: 2015-7-5 09:34

回复 nailute1985 的帖子: o* U0 s8 a7 `2 I2 }6 `% b

2 Q, F% q7 }! m4 B/ Y% v0 b我们此次是检测CD34+CD45+CD133,所以我们按三色的检测标准。2 m: z3 `- E6 i- f2 K' G+ \9 q+ Q8 v0 |
1.FITC+PerCP+APC的三个同型对照抗体加细胞
& |: k1 p4 n# Y2.FITC+PerCP+APC的补偿管,共3管6 q+ z; `& p5 a3 w
3.待测管+FITC+PerCP+APC三种抗体2 Y& I3 ^* u" R$ }
共5管
作者: nailute1985    时间: 2015-7-5 12:20

回复 SKC-SFC 的帖子9 _- }. \4 t3 J6 B& E% X

4 I# @! X. W- F# {# e晕 阴性对照不是让你调补偿的么,同型对照不是做实验的isotype么
作者: nailute1985    时间: 2015-7-5 12:22

回复 SKC-SFC 的帖子! z9 @8 N" t: ]$ T( j9 `( x

$ n  d3 f3 }- F2 N2 K3 `5管没错啊
作者: nailute1985    时间: 2015-7-5 12:23

回复 SKC-SFC 的帖子- @) r2 p2 D6 L1 x; `/ `0 Y5 G, V$ {
* M( S' F: f) h8 [: g( C' r
0.2%也正常的  cd34+细胞百分率不是很多的
作者: nailute1985    时间: 2015-7-5 12:28

回复 SKC-SFC 的帖子( Z' f( [: q* @+ n" ]& v5 d- w

( W, n% y, W6 O+ a: y, ZR1差不多就是你那个位置,可以再往左来点  觉得你的碎片比较多0 u& U. `% S: v. R. m- ?1 N
R4我觉得你的ssc选的高了,往下来点可以 但是你这个r4分了两个群了明显 倒是可以都画进来 但是ssc一定不要太高
作者: SKC-SFC    时间: 2015-7-6 12:20

回复 nailute1985 的帖子$ K& E9 t; y* |: U' Z+ K& ]' u

7 F# a: z( S' x& B6 B不是吧。调补偿有专门的补偿管。阴性对照跟调补偿毫无关系好吧。一般以前我们是光细胞做阴对只是考虑了细胞的自发荧光,没有考虑细胞与抗体Fc段结婚,所以用同型对照来排除非特异性的干扰。
作者: nailute1985    时间: 2015-7-6 14:28

回复 SKC-SFC 的帖子$ K4 U/ k  Q/ c2 D

# A( t! D/ ], r, k调补偿的叫做荧光补偿管,说白了就是一个相对于阳性的阴性管罢了,这个是在实验前就的调好了的
作者: SKC-SFC    时间: 2015-7-6 15:11

回复 nailute1985 的帖子
2 h+ |+ ^; I/ B3 O
3 d) ~5 s+ S+ {% g/ {' p0 b这个我明白,我们都是调好的,然后检测待测管,这个没有疑问。但我们的第一管是加了细胞和三种同型对照抗体,这个是作为阴性对照来使用的。用待测管的值减去同型对照的值得到最终的结果.
作者: SKC-SFC    时间: 2015-7-6 16:03

回复 nailute1985 的帖子
$ O6 O# p$ F- Q# ~; H$ g
* K: H% C% Y% q1 i我们根据您的说话,又重新分析了,发现结果高了差不多一倍。说明样品还是存在问题。我们的造血干细胞的样本里面含采集液,成分很复杂,估计有不少类似碎片东西。下次实验我们想标记前洗涤几次之后再标记,也许拖尾不会那么严重。
作者: nailute1985    时间: 2015-7-6 16:21

回复 SKC-SFC 的帖子7 l; O' e  m' a
' N$ U" `1 y5 [5 _  I- i7 B& a: x
你们的样本那么不纯的话 结果肯定不准确的。洗涤,裂红这些都需要




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