分子生物学——让人欢喜让我忧（随笔）

mckf111

伴随一首老歌，思绪一如往常飘飞起来，难耐。# `# V+ x/ m" m# u; K

5 N8 b3 i" {* S: ?0 w# B5 @9 M! E合上书，闭上眼，脑海里乱麻渐渐消弭，一个于我老生常谈的问题再次浮现：为什么当我下意识除去分子层面的积累后，脑海中对于生物学的认识几乎空无一物，连进化都变得so molecular？
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" n8 I7 Q% j: H分子这个，分子那个，这个分子和那个分子怎么OOXX，大家如何一起OOXX（谓之network），如何从房间外转换至房间内（谓之transmembrane）等等，弄完了男猪脚、女猪脚们，还要去看看哪个分子当导演，哪个分子是编剧，哪个又是剧务，潜规则又是如何，诸如此类，就这样，在身体各处数不清的大片不断上映时，你看到的是我正在写这篇日志。（读者自行决定是否自我河蟹）
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此时，我想到本科有门课，名曰：生物信息学。似乎这些先驱们已有部分认识到，纯粹的分子层面的研究终究不能诠释何为生命。然，悲哉，当今的生物信息学或称之系统生物学还是基本处于分子生物学的统领下，另有极小一部分乐观分子认为有朝一日，还是可以通过极度丰富的分子信息依靠数学运算和逻辑推理，还原出个生命，原因既有历史遗留，也有人类思维的劣根性，唉。( x5 w9 u3 Q' ?. v$ ]

# e. N3 p% b* K" M- o, m往小点说，我最想探秘的肿瘤，明明是组织学层面乃至细胞学层面的问题，很多关键生物学行为尚未在此层面弄清，却过早的被分子生物学拖入了更细化的层次，结果问题被越做越细，资料是层出不穷，眼界也是越发模糊，好像什么都挺主要，但好像什么都不重要。人们原以为细致不是坏事，等一切弄清之时，那便是肿瘤攻克之时，听上去此话极富逻辑，可不料却陷入了人类思维的一个大圈套之中——还原论，这点暂不展开，咱们只看成效吧，自30年前肿瘤研究迈入分子领域以来，人们对其基础了解不可谓不深刻，积累的资料不可谓不多，称即将突破瓶颈的进展不可谓不诱人，而结果却是，肿瘤的主流治疗方法依旧是老三套，虽有部分改善，但无质的突破，而所谓的生物治疗，算是分子肿瘤学最直接的clinical product了，却是千疮百孔，拆了东墙补西墙，突然想到大话西游-月光宝盒里二当家一句台词：大腿插一刀，身上全是洞，搞什么嘛。此话是忧而非悲，希望有些莘莘学子不要上纲上线。
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/ q" f% p" K0 l5 {8 N# C- E( `多姿多彩的生命，却在人类最高智商代表的科研工作者脑海中被幻化成一幅幅由分子堆砌或编织的图景，更令人担忧的是，大多数却还不自知，还在脑海中继续勾勒着这幅“美景”。我猜想，终有一日，他们盼来的不是问题的解决，却是发现更多分子层面的问题需要再更细化的层面上去解释，那时，“质子/电子”生物学来临了...
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/ P% d# X( D& _1 ], f做生物的，别跟天斗，别跟地斗，别跟分子斗，我貌似犯了忌，普天下大势所趋的东西，很多人还是不得不从，这鄙人能够理解，可我希望各位战友们，能否在看那些分子们快乐的OOXX之余，从中跳出来，花点心思去看看这些灵动的生命呢，当然，这也是对我的一种鞭策。Furthermore，很多的大家嘴里的idea一是来自于实验过程中的by-product，二则来自于这些高空的思考啊. W8 p6 e1 l* M
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其实 大多数人都待在地面 只看得清周围一亩三分地 而让思维换个载体 腾飞后俯瞰大地 这才恍然大悟 原来如此 上帝的笑也会收敛了
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mckf111

哈哈

chenyuemily

赞同啊，挺不好学的

tainlangxing

回复 8# mckf111 , d( B6 ]( p% f( `2 z

$ E) D* v0 h9 @$ P; \, U    研究纸板的物质分子是无法还原万花筒的图案（哪怕是一面的图案），但是研究清楚水的分子对于流体学来说可是基础哦，这就是我所说的跟生物分子类比有点牵强的原因；我知道你是在担心研究生物的分子基础对于研究生命大的宏观事物是无意义的~，我对此倒是不担心得，担心得是何时建立起网络化、系统化、点线面相结合的立体生物分子学！因为许多科学家专家可能都要被迫专业和失业了！^_^
3 h; f, A4 C- B( Z% T9 z    因为你现在研究的生物体是水立方的一个面上一条线的一个点，就好比盲人摸象一样，你仅仅是在局部的一点做研究，你怎么可能会描述解释正确什么是大象？什么是生命，什么是肿瘤那？所以我也说困惑混乱是不可避免的~，所以宏观上把握好，所以要把生物分子当做语言，把基因当做程序语言。
( D$ d0 o& j, \7 ^. \5 M不过有想法，有思考，有自己的见解和看法，还是挺不错的哈~~比一味蛮干要好得多！

mckf111

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. P* R; y, e+ m. I回复 7# tainlangxing
5 \/ s7 j0 s1 E! T4 x“作为这些图案本相的基础（跟生物分子类比有点牵强），是跟他们相关的~由他们产生的” 这就是过份强调还原论的观点 整体层面的东西不会来自于对分子的充分研究 也不是把分子弄透后自然显现的 它一定是在以整体的观点和方法去研究后才能得出的东西 您所说的宏观上的把握思想还是滞留在分子层面上的综合 或者对于纷繁的研究结果予以貌似符合生命的解释 而我要说的也根本不是分子研究目前的桎梏 而是它对于整体现象的解释无能为力的定论 绝大多数的研究者无疑是接受了多年的分子生物学训练和思考 自然奉其为圣旨 很多东西不是仅仅靠无限还原那么简单的 可以预言这种思想一定会造就将来的原子生物学、夸克生物学之类 因为分子层面的很多问题来源于其组成原子的排列方式 照这个方向研究也会得出很多惊人的事实 可即便是分子生物学概念的开山之人——薛定谔也并未言及生命即是物质的某种堆砌形式 无限还原的思想有其自身无法逾越的障碍 当然 目前我在此方面也只是多为逻辑思辨 也并不强求任何人要脱离分子研究 毕竟道不同

tainlangxing

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我并不认为分子是生命的物质体现，应该是分子是生命的物质基础，有物质，并不一定就有精神（生命），虽然说你把每片纸能研究透并不一定能得到图案和事物的本相，但是，作为这些图案本相的基础（跟生物分子类比有点牵强），是跟他们相关的~由他们产生的，所以，宏观上的把握更显的尤其重要。每一片纸片的光线（面、网络）所组成的图案是一定的，当他们组合起来，角度不同混合的的图案也就变化（体积、立体网络）！+ J! n+ c! H7 O3 K0 O
而分子生物学现在的研究仅仅是牵涉到点、线上的研究而已！困惑、混乱是不可避免的！前景是光明且远比万花筒诱人的

mckf111

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回复 5# tainlangxing 1 e2 x; j, ~3 z, i1 T
分子如语言 OK “你真是个好孩子” 这句话到底表达的是什么意思 你能从字意理解出来么
% V; I! M: r9 V. C7 o" s6 X万花筒 想必是大家都熟悉的东西 完全相同的几片花纸能组合成千变万化的图案 现在我正在欣赏其中一种 如果你把每片纸的大小 厚薄 颜色 形状等等性质全研究清楚 你能告诉我我正在看的图案是什么样的吗 希望这个例子能部分说明我的观点) C- m+ S3 w9 }$ k
分子是生命的物质体现 生命还有其他的方面

tainlangxing

写的不错，很真实~~实际上，困惑的，不止你，甚至包括肿瘤研究方面的、分子生物学方面的大牛们；困惑的，不止分钟生物学，还有试图解释肿瘤的干细胞假说、癌基因假说、病毒假说、多倍体假说等等；困惑的，不止分子生物学在肿瘤方面，还有分子生物学在基因表达方面，在调控通信方面，在物种进化退化方面等等。只见尘土不见泰山。6 |) Z: M  C7 S# o$ @9 {6 z" t
我是很看好分子生物学的，也有点自己的想法：1、你可以试着不要把分子当分子，而把分子当语言；2、就好比你们在做一个水立方的一个点，要知道自己在干什么，一直追索下午不要被干扰（虽然有时很深），这样就连成线，然后要一条条的线联系来成面，一面面连起来就发现原来是个水立方呀！( ⊙ o ⊙ )！汗、很辛苦的，也不是几个人几十个人，也不是一代人所能够完成的哈！3，宏观上一定要把握好，知道自己在干什么（目的明确）！一定一条一条线得来，不能贪多哦！几条线下来，能描述半个面，你就离诺贝尔奖不远了. m8 @3 p5 J1 w% T
不知道是对是错，仅供参考吧~

LiuRoc

是，要是分子们能解决问题，估计也不会进化成细胞、组织、有机生命整体了。5 v- |" A- M0 x! P7 O$ r
西方先进的技术和理论搞了这么多年，解决不了问题；系统生物学不得不适时而生。1 S0 w8 s  s# f# M; J8 }

( Z9 M# L) m5 X2 c之前，看了中医的黄帝内经，没懂，就没继续看；后来看了看系统生物学的文章，挺容易懂的。再后来，闲的，又拿起内经看，哇，真有意思，与之相比，系统生物学那本书就是小儿科。
3 I& q, W" v  w2 V, ~我现在做分子细胞生物学层面的，很苦恼。以后还是需要多看看中医书籍提升思维和理论！

mqz_11

楼主文笔不错，，做生物哈哈有点亏才了。。。