Cell：RAEFISH技术为研究复杂组织中的RNA活性提供了更大、更好的窗口

yinfuhua

Cell：RAEFISH技术为研究复杂组织中的RNA活性提供了更大、更好的窗口
% h5 P, m5 s7 W6 y, h' |" s来源：生物谷原创 2025-10-27 15:27
9 P0 m( @" M7 F( ]基于图像的空间转录组学技术直接对细胞和组织中的RNA分子进行成像，以绘制RNA位置和基因表达模式。8 H2 _  C' C! c- _; k0 I0 ]& d
得益于耶鲁大学研究团队创造的一项新技术，科学家们首次能够以极高的细节水平同时观察整个人类基因组范围内细胞和组织内的RNA分子。
" J3 k: L9 v  O" p8 ~  _5 D这项名为"反向挂锁扩增子编码荧光原位杂交"的技术，解决了研究人员长期被迫面对的权衡问题：细节与范围。早期的工具要求研究人员在两者之间做出选择：要么以高细节观察有限数量的基因，要么观察许多基因，但关于其转录本（RNA）的位置以及它们如何相互作用的细节水平有限。. F+ _- N, J) Q$ _. Q2 D8 A
"我们开发了一种同时满足这两种需求的技术，"耶鲁大学医学院遗传学与细胞生物学副教授Siyuan Wang说。"它解决了空间转录组学领域先前技术的关键局限性。"  W; ]5 {' Q6 s

3 r) F/ B( G4 N" Q这项新技术在一项发表于《细胞》杂志的研究中得到了描述。5 K" d9 g6 ?9 E1 m4 a
基于图像的空间转录组学技术直接对细胞和组织中的RNA分子进行成像，以绘制RNA位置和基因表达模式。0 c/ A) I6 F. K0 `
研究人员表示，RAEFISH技术代表了这一成像过程的强大进步。他们通过设计特殊的探针来创建它，这些探针附着在细胞内的RNA分子上。这些探针会复制目标RNA，并添加荧光标记，以便在显微镜下观察这些RNA。4 ?" q; _2 h7 H: Y
该方法在人类细胞以及小鼠肝脏、胎盘和淋巴结的组织中进行了测试，能够识别来自超过2万个基因的不同RNA分子。RAEFISH能够绘制细胞类型，展示细胞如何组织，并通过基因表达模式揭示不同细胞类型之间的相互作用。& Z# {  k% B+ E
研究人员表示，这不仅有助于揭示哪些基因是活跃的，还能揭示它们在细胞或组织中的哪个位置发挥作用。此外，这种扩展的视野还可能为复杂组织中的发育和衰老过程，以及许多疾病如何发生和进展提供新的见解。
& S0 n% `: T" @- U5 I
' z# G+ l; z' E( o. y5 D/ i"我们有可能发现新的治疗性生物标志物，用于治疗诸如癌症等疾病，在这些疾病中，了解癌细胞如何与周围组织微环境中的其他细胞相互作用至关重要，"Wang说。0 ~  H9 p; A9 c& W% N  w
Wang表示，如今，像RAEFISH这样的成像组学技术的突破正在推动医学研究的未来，并推动新型治疗干预措施的出现。, r+ L, @. D3 R
"我们正处在一个工具日益完备、能够应对更高复杂性的时代，"他说。"现在能够在原生组织环境的复杂性中更详细地研究基因表达和细胞相互作用，这将有助于研究一系列疾病。"（生物谷Bioon.com）
$ O9 X. v7 q0 F6 p# l1 {7 b参考文献：
6 Q% t! W( K7 a' ^' F0 z- nYubao Cheng et al, Sequencing-free whole-genome spatial transcriptomics at single-molecule resolution, Cell (2025). DOI: 10.1016/j.cell.2025.09.006.4 S7 M6 b  W  {/ ]
9 j2 N) y/ M( g6 {& Z