Cell Reports：林春华/韩鹏/吕伟等揭示 miRNA-eccDNA 驱动肾癌进展的重要机制

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Cell Reports：林春华/韩鹏/吕伟等揭示 miRNA-eccDNA 驱动肾癌进展的重要机制
2 U  T% g8 M  t' w来源：iNature 2025-12-13 16:400 O1 h) h" `/ T& E& Q# {
该研究通过 Circle-Seq、WGS、RNA-seq 等多维技术，首次明确了“小型 eccDNA 携带 miRNA 基因（MIReccDNA）并发挥功能性肿瘤驱动作用”的现象。
3 w5 `. L1 U/ p! ^7 z/ S$ Y近年来，随着高通量测序与环状 DNA 捕获技术的发展，extrachromosomal DNA（ecDNA/eccDNA）逐渐成为肿瘤基因组学领域备受关注的研究焦点。过去的研究主要聚焦于大型 ecDNA 携带经典癌基因并以异常拷贝数放大形式驱动肿瘤[1]，但对于更加普遍存在、大小范围从数百到数千碱基不等的小型 extrachromosomal circular DNA（eccDNA），其在肿瘤发生中的真正生物学作用长期未被充分理解。尤其是 eccDNA 是否具有主动的致癌功能，还是仅仅是基因组不稳定性的“副产品”，一直存在较大争议。而肿瘤中广泛存在的 microRNA（miRNA）异常表达，本身就是癌症发生的重要调控机制，但 miRNA 是否可能以环状 DNA 的形式存在，并作为一种独立的扩增单元推动癌症表型，目前尚缺乏系统性的证据。因此，阐明“miRNA 基因是否能够被环状 DNA 捕获并作为功能性分子推动肿瘤进展”，成为理解 eccDNA 生物学意义的重要科学问题。0 s0 o8 r2 }, _; h5 M
在此背景下，青岛大学附属烟台毓璜顶医院林春华教授、中山大学附属第七医院韩鹏博士、中国科学院杭州医学所吕伟博士联合团队开展了系统性的肾癌 eccDNA 研究，并于 2025 年在 Cell Reports 发表题为《Extrachromosomal circular miRNA-gene amplifications contribute to the renal cancer phenotype》的最新成果[2]。该研究通过 Circle-Seq、WGS、RNA-seq 等多维技术，对 122 例肾癌及邻近组织样本进行了全面的环状 DNA 图谱描绘，首次明确了“小型 eccDNA 携带 miRNA 基因（MIReccDNA）并发挥功能性肿瘤驱动作用”的现象。研究发现，肾癌组织中 eccDNA 的数量远高于正常组织，并随肿瘤分期显著升高；多种 miRNA 基因以 eccDNA 形式呈现出高度复现的扩增事件，且在正常组织中几乎不出现，提示这些结构性单位可能受到肿瘤选择性压力的推动。# ?" Q# W- X) x3 V6 G4 \3 ?( Q- v* W
团队进一步利用合成的 MIReccDNA 进行功能验证，发现这些环状 DNA 可在肿瘤细胞中被稳定转录，并显著促进肾癌细胞增殖与恶性表型。这一发现首次提供了直接证据，表明小型 eccDNA 并非被动产物，而是可以携带特定 miRNA 基因并主动增强肿瘤进展，是肿瘤基因组学领域的重要机制突破。该研究不仅拓宽了人们对 eccDNA 的功能认知，也为肾癌精准治疗提供了全新的潜在靶点和生物标志物。
$ `/ `- N" n! x6 R原文链接：( c$ Z: w) i3 k. L1 y# W1 B' M& t% C
https://doi.org/10.1016/j.celrep.2025.116660, N6 X% t0 L; }2 P
参考文献：
2 @( `( G2 y9 I0 {1.Lv, W., et al., Spatial–Temporal Diversity of Extrachromosomal DNA Shapes Urothelial Carcinoma Evolution and the Tumor Immune Microenvironment. Cancer Discovery, 2025. 15(6): p. 1225–1246.4 j5 z/ R5 r) C8 a7 ?8 Z  F
2.Han, P., et al., Extrachromosomal circular miRNA-gene amplifications contribute to the renal cancer phenotype. Cell Reports, 2025. 44(12): p. 116660.+ [5 j6 O4 M4 P8 ]/ \, B
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