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谁能讲讲siRNA和miRNA的差别? [复制链接]

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楼主
发表于 2010-9-12 21:37 |只看该作者 |正序浏览 |打印
看了很多关于siRNA和miRNA的定义,始终无法领悟它们真正的差别,谁能给个一针见血的回答?在此谢过!
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发表于 2014-6-2 12:12 |只看该作者
越看越觉得它们在本质上没什么区别。都是起源于配对(或部分配对)RNA,都要经过DICER酶类切割,都要形成沉默复合体,都可转录水平和转录后水平调控,。。。。。。。看来是当初研究者命名不同罢了。
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发表于 2014-3-23 14:08 |只看该作者
miRNA和siRNA有以下共同点:1.长度相同2.都是Dicer酶的产物3.都是由单链RNA分子同AGO蛋白家族结合,形成RISC,行使干扰和调控功能4.都是在转录后和翻译水平抑制靶标基因的表达;
# [- \& Z7 b) I差异则有以下几点:1.起源阶段:siRNA通常是外源的,由病毒感染、转座子或外源转入的基因诱导产生,是一种适应性应答反应的结果;而miRNA是内源性的,是机体自身基因表达模式的调控机制。2.成熟过程:siRNA直接来源是长链的完全互补配对的dsRNA;经Dicer酶切割形成双链siRNA,而且每个前体dsRNA能够被切割成不定数量的siRNA片段;miRNA在核中转录出较大的pri-miRNA,经由Drosha和pasha加工成为单链发夹状的pre-miRNA,接着在细胞质中被Dicer酶切割形成成熟的miRNA。3.功能阶段:siRNA同AGO蛋白家族的AGO2结合,形成RISC,以RNAi途径行使功能,通常用于沉默外源病毒和转座子活性;miRNA同AGO的AGO1结合形成RISC,后与靶标mRNA通常不完全互补结合,结合的位点是mRNA的3‘端非编码区,能够调节与生长发育有关的基因表达。
- b+ w* S* r" E6 x它们确实在片段大小和功能上有许多相似之处,但是主要的差异还是有的。
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发表于 2012-10-2 17:39 |只看该作者
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回复 sannia 的帖子, E, V9 t4 j( r6 H, F9 g
: v- V/ y- ]1 \# R
我觉得您讲的很对,可否赐几篇讲siRNA的综述?非常需要,非常感谢!

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发表于 2010-10-21 22:06 |只看该作者
Small interfering RNA (siRNA):是一种小RNA分子(~21-25核苷酸),由Dicer(RNAase Ⅲ家族中对双链RNA具有特异性的酶)加工而成。SiRNA是siRISC的主要成员,激发与之互补的目标mRNA的沉默。 与小分子siRNAs相比,尽管两者在分子特性、生物起源等方面是相似的,但也存在不少的差异。siRNAs是由dsDNA在Dicer酶切割下产生,而成熟miRNAs的产生要复杂一些,首先pri-miRNA在核内由一种称为Drosha酶处理后成为大约70nt的带有茎环结构的Precursor miRNAs (pre-miRNAs);这些pre-miRNAs在Exportin-5帮助下转运到细胞核外之后再由胞质Dicer酶进行处理,酶切后成为成熟的miRNAs(Lund et al., 2004; Yi et al., 2003)。两者的作用机制上也存在差别,成熟的miRNAs则是通过与miRNP核蛋白体复合物结合,识别靶mRNA,并与之发生部分互补,从而阻遏靶mRNA的翻译。在动物中,成熟的单链miRNAs与蛋白质复合物miRNP结合,引导这种复合物通过部分互补结合到mRNA的3′UTR(非编码区域),从而阻遏翻译。而在siRNA通路中,单链的siRNA结合到RISC复合物中,引导复合物与mRNA完全互补,通过其自身的解旋酶活性,解开siRNAs,通过反义siRNA链识别目的mRNA片段,通过内切酶活性切割目的片段,接着再通过细胞外切酶进一步降解目的片段。除此之外,miRNA也可以切割完全互补的mRNA,而siRNA也可以阻遏3′UTR具有短片断互补的mRNA的翻译。
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发表于 2010-9-16 14:31 |只看该作者
他们的功能是不同的.! B( c* I; u9 I$ j9 ~; [8 A) ^; ]
miRNA的功能是调节细胞内的基因表达,多数情况下是knockdown,但有报道说,培养细胞在饥饿培养后,被调节基因会出现表达的上调(upregulation).1 Z8 d; f  F9 G: W
siRNA的主要功能是维持基因组的完整性(genome integrity),将外源或入侵的基因组破坏掉。
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发表于 2010-9-16 13:13 |只看该作者
又找到一条差别,他们的前体不一样,miRNA前体是茎环结构;siRNA前体是完全互补的双链(double strand RNA, dsRNA)。都是由Dicer剪切的。

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发表于 2010-9-16 08:55 |只看该作者
我看了《cell》那篇文章,siRNA的外源似乎是指siRNA的序列是外源或siRNA本身来源于外部这两层意思:一是外源的基因与基因组进入细胞内时,细胞产生相应序列的siRNA对其进行剪切破坏;二是从细胞内注入人工合成的siRNA可以引进细胞内相应的基因沉默。
* M6 V9 g  R( ~2 u" C( S2 M% b以上是我个人理解,请指正。
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报纸
发表于 2010-9-13 21:37 |只看该作者
siRNA 不完全是外源的。
4 D$ \# R& H" ]0 ]  f0 n病毒入侵,转基因等作用导致的siRNA是外源的,一般是通过剪切mRNA起作用。6 e' Y' r) i" o$ W, B4 k3 d
内源的siRNA一般来自genome重复片段区域,反向表达并交汇的两条mRNA 等 : Y( n5 [; V# l8 B* ~% P
具体分类有:endo-siRNA, rasiRNA, tasiRNA, natsiRNA, 等# ~6 J* s& W3 F$ C( x' ]
其中endosiRNA和rasiRNA一般是通过介导DNA甲基化和Histone modification达到抑制基因表达和抑制转座子跳跃等。tasiRNA和natsiRNA有特定的target,类似于miRNA,通过剪切mRNA起作用。( q  T: d/ w  L. H" m
还有动物精细胞中的piRNA,虽然不是叫siRNA,担其作用方式和rasiRNA非常类似。
  \) w% D& ^- k8 g脉孢菌中qiRNA作用方式未知,只知道和DNA damage有关。
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板凳
发表于 2010-9-13 19:06 |只看该作者
还有,siRNA与mRNA的互补效果要好于miRNA与mRNA的互补
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