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[讨论] 请教一个双酶切的问题     [复制链接]

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楼主
发表于 2010-10-19 10:15 |只看该作者 |正序浏览 |打印
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2个不同的质粒双酶切再进行连接的时候,如果2个酶切位点内的基因的顺序和启动子方向相反会不会对表达有影响?
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16楼
发表于 2010-10-22 08:36 |只看该作者
选的酶不同应该是不会顺序相反的,质粒构建完成后,需要鉴定,测序什么的应该可以避免你这种问题的。
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15楼
发表于 2010-10-21 22:00 |只看该作者
反正就2种结果,方向相反和不相反,我先接上看会不会表达再说,如果不会就是反了,再从新接。8 m, v7 X1 U0 ?4 S/ N" C
谢谢大家的热心帮助!
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14楼
发表于 2010-10-21 21:41 |只看该作者
回复 11# 深海寂寞鱼
: C$ m4 B- d! u9 [
! _2 M+ k3 |- d  i( d3 _6 S* b! _& u; o* J7 O3 w9 f9 R
    能把你的联系方式如QQ告诉我吗?我想以后请教就方便了!

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13楼
发表于 2010-10-21 21:33 |只看该作者
回复 11# 深海寂寞鱼
. r0 s# j8 j4 X% j; e& D; y' l; D# K0 X6 B' ?+ r5 b

" C  c" t% X+ X; l    太感谢你了!想不到你这么热情,我很感动!

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12楼
发表于 2010-10-19 20:02 |只看该作者
如果有起始密码,反向表达的多肽序列也是无意义的。。。
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11楼
发表于 2010-10-19 13:21 |只看该作者
本帖最后由 深海寂寞鱼 于 2010-10-19 13:23 编辑 ; {- s! b! u" g# l* o/ L

2 K* Z4 C. i0 i. hto sidalin301:+ q, @. A. A9 e0 G0 l2 }2 d2 ?. C3 ^2 D
' a9 p3 R/ T( a- J7 {" H( w
   你的问题描述的并不是太清楚。大致的意思是把目的基因从pUC57质粒上切下来,插入到pNL质粒中。但是因为没有pNL的质粒图谱,所以你担心可能会把序列反向插入,从而使目的基因不能表达。
0 b& Y. F4 }2 g# D1 Y) `" t5 Y( N# o$ l4 `+ c/ W
  1. 解决这个问题的关键在于找到pNL质粒的图谱,如果没有图谱,一切都是在猜测之中。
# K4 |# C$ ~$ i    1 g& B, X1 @8 a
      我试着帮你找了找,在Addgene的网站一共找到了4个相关的质粒。(见下图)
: B7 f. E" Z( P: e7 V6 b8 [6 |      不知道你的质粒具体是其中哪一个?
$ e, |# s6 l+ m       1.jpg / C& Q$ W9 W1 x. F0 C& S4 p! z* ]
8 s8 Z1 s( p( m$ N& k+ f2 U
  2. 我把这4个质粒的图谱都看了一下,其中并没有你说的同时存在BamH I和Nhe I的情况,倒是有同时存在BamH I 和 Nde I的情况。
" ^; C% x% W& E, k* c$ w" B      希望你再核对一下你的质粒名称,以及酶切位点。* b7 B4 b" w  R" s/ H0 |0 ~
5 l. j! `2 l. A4 H# ?
  3. 如果你之前提供的信息是对的,那么当你插入你的目的基因后,它一定不会按照你想要的方式表达你的目的基因。目的基因的序列必须和启动子的方向一致,才能得以表达。! H. O4 G& g% C) K7 U; U, X5 v( F
( `8 o( i. Z1 f9 a, ?8 q# W$ Y  V
      如果是这样的话,我能想到的一个简单的解决方法,就是用一平一粘的方法把你的目的基因插入pNL质粒。8 \' [; _) S( L* q- n3 i$ z/ ~. ^7 K

5 a/ @2 j  l5 @' _/ a      具体的步骤是:, v* ~( S& @2 x

, {/ ^" n6 D0 d. a8 }: c      a.用合适的酶把pUC57质粒和pNL质粒分别线性化; b.用klenow酶把切开的质粒进行平末端化;c. 用BamH I把平末端化好的质粒酶切,产生粘性末端;
0 C6 H9 F0 Z5 L+ B8 U% b
- J% @( y$ l# ]) ~$ W      d.然后分别回收你想要的片段进行连接。
2 L* t+ k2 y2 i1 ]0 L- t2 q
$ f+ z; t8 E6 z9 ?     这样就可以把目的基因正向插入到pNL载体中了。
' C! }6 Y3 G. d# y3 y7 R% z! A0 T3 @$ b! f# t1 _
    这只是我自己的一点想法,希望别的战友也能一起帮帮忙。
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10楼
发表于 2010-10-19 11:45 |只看该作者
回复 8# ghfvcat
) l8 c$ [* W6 n! E3 Q% ?1 g) G/ w- M' s9 ^

, C& S; i5 C0 ~  t    谢谢

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9楼
发表于 2010-10-19 11:45 |只看该作者
谢谢了

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8楼
发表于 2010-10-19 11:29 |只看该作者
回复 7# sidalin301
: U, i& P, a* w9 ?0 ]( k- ?
: i7 X; Q& B% {. F6 S1 t* ]/ g( p; O* c( f! a
    这样你就必须检查了,方向反的话是不可能正确表达的,不是有没有影响,是完全没表达,去查一下你用的载体的序列,
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