iPS、胚胎干与直接转分化的“三国演义”

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我一直对“Hotspots of aberrant epigenomic reprogramming in human induced pluripotent stem cells ”同期的三篇文章是有怀疑的，老觉得实验设计不合理，他们就是在假设iPS 与ES 有差异的前提下去设计的实验，我觉得能找到差异是必然的。. D% [- F* r# @
反而我觉得最新cell stem cell 上的这篇文章“Background Mutations in Parental Cells Account for Most of the Genetic Heterogeneity of Induced Pluripotent Stem Cells” 更有意思。
& B; L3 M( T/ |7 n+ q
3 j7 f/ A; E$ w5 u1 T$ N$ G8 ]5 X根据我的想法我们应该设计一个更大的实验，一劳永逸，解决关于Mutation 的争论：
# }7 ?& B$ T$ H3 Y! B" {4 gGenome Resequencing
9 O! x4 a/ J0 ~7 t: X1. 供体细胞测序& _$ c$ F2 o% O" @# E+ V
2. 供体细胞形成的iPS 细胞系测序4 o; |" `* _' r/ b6 B4 O
3. 供体细胞培养10，20， 30代测序$ C/ C6 Q+ Y$ o9 d  i. E, [
4. 供体细胞形成的iPS 培养10, 20, 30 代测序( Y; u/ J# z. P* k$ Q; U7 `% q
5. 供体细胞形成的核移植细胞系测序
1 N$ u- A# {  A3 Z5 I- V6. 建立的ES细胞系培养10, 20, 30 代测序- g- Z6 ?: Y2 O

. O/ a4 a0 i8 U3 i1 a  ~8 b/ x( w通过这个设计可以解释的问题：
' i- Q4 K6 X- V0 g9 u4 U1. iPS Mutation来自于供体细胞还是iPS 形成过程
8 r& K- f  J4 c3 E2. 细胞培养过程是否产生Mutation7 l' U8 e2 F8 i+ P$ A) n# r
3. iPS 在培养过程中的Mutation ratio 是否比ES 或者供体细胞 要高; k7 d/ A) b5 r. p! C& \& W
4. iPS 与核移植哪种重编程方式更容易产生Mutation
- b& [% Y5 `7 v* O0 S3 K5. ES 的培养过程是否产生Mutation7 ~* m4 O; r( ]8 a5 L
et al.....