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[请教] 巢式PCR出现非特异性扩增条带 [复制链接]

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楼主
发表于 2011-4-9 16:41 |只看该作者 |倒序浏览 |打印
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巢式PCR按理说应该是特异性比较好的,我之前做的很多阳性结果目的条带非常好,而且没有扎带,这次做的怎么大部分标本跑出了非特异性的条带呢(但没有目的条带),比我的目的条带要大一倍。但是阳性对照还是非常干净的,目的条带除了,亮度也不错,难不成是与模板有关吗?还是说调整反应条件就可以解决的?请赐教!谢谢
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沙发
发表于 2011-4-9 19:00 |只看该作者
回复 shine0224 的帖子
, r, x6 u+ D+ ~* g+ q8 p' x1 T! w/ X' D5 j) i0 g/ p6 F% c
你是只出现了一次这种情况,还是最近这批样品重复出现这种情况?如果只是一次,那么可以再重复重复。如果你的pcr全部条件都没有变,而反复重复都没有出现目标条带,估计就是样本dna的问题了,你检查一下dna的浓度和纯度,还有就是目标序列在该样本中的丰度。
7 L5 I# {/ B1 g1 c! b$ ]! B! y/ K槽式我做的不多,一般都用touchdown,效果很好,如果实在扩不出来你可以试试这个方法。
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藤椅
发表于 2011-4-9 21:35 |只看该作者
我建议你试试Touchdown PCR,这是避免非特异的极好方法!
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