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[请教] imagej 的荧光分析 [复制链接]

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优秀会员 金话筒

楼主
发表于 2011-4-28 06:28 |显示全部帖子
我做过imageJ的荧光强度分析,可以探讨一下。( E4 X( F( f! o/ s) j5 ^
需要将图片转换成黑白形式(8bit or 16 bit等),然后选中细胞区域(设定阈值、用魔术棒选择即可),然后用ROI管理你选中的细胞或细胞团,设置你所需要的measure的参数然后,measure就可以得到你所需参数。不懂在问吧。
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沙发
发表于 2011-4-28 06:30 |显示全部帖子
注意,在不同细胞图像之间,要用统一的参数,在设定阈值是,使细胞区域都能在这个范围之上(会变颜色的),然后用魔术棒一点,即能全部选择,用ROI再次选择区域即可了。非常简单,当然还有自动化处理的,这个比较麻烦。需要插件,
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藤椅
发表于 2011-7-20 11:48 |显示全部帖子
可以通过调整阈值,观察是否包含细胞区域,这样分析多张代表性的图像后,初步确定这个阈值。注意:不可能包含所有细胞,只要大部分细胞都包含在内(80%以上吧)就可以了。因为细胞荧光的差异性很大。
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