有什么软件可以预测与顺式作用元件相互作用的转录因子

runsong

我想预测一个基因受哪些转录因子的调控，用软件及数据库的话应该怎样做。
  p# K, f- [5 H& r+ F/ T; G" ]+ c! V! h希望各位前辈给以指点。

tonyp0720

http://www.cbil.upenn.edu/cgi-bin/tess/tess" S" n2 U* H/ ~: v, _( X6 a
宾夕法尼亚大学的转录因子搜索系统  这个网址个人觉得比较有用。

fguw

Try this website , http://www.cbrc.jp/research/db/TFSEARCH.html- U# g& u0 H4 ], v$ }" L
it could provide some information, but  not perfect5 K3 Y$ m0 g+ ^8 G6 W
While I tried other websites, it looks only this one works% Z* Z3 \& p+ Y) a  g

kosmos.y

http://www.geneontology.org/到这里吧，GO很强大。包含数据库和工具。很多生物信息学分析都是用它的，蛋白的pathway分析什么的，它很好用

tanguixiang

顶一楼 ，TESS很不错的

runsong

回复 tonyp0720 的帖子
0 G3 p" ^- {% R0 z. V4 \8 {# H. c- z
十分感谢你提供的信息，但我不知何使用，能发给我使用方法吗？谢谢！

tonyp0720

runsong 发表于 2011-9-3 13:31 ; I1 N* a4 A3 f
回复 tonyp0720 的帖子7 A) {7 o( ^" V/ P) s
" N9 C4 z: p! H* o
十分感谢你提供的信息，但我不知何使用，能发给我使用方法吗？谢谢！

5 l5 o/ U5 ^* n: i* n4 H你点击 site searches ,进入它的页面，在DNA sequence 里面拷贝你的序列，其他的一般不需要改动，点击submit即可。也可以看下面的每条提供的解释，根据你试验来选择。这样说不知道你明白不。