有什么软件可以预测与顺式作用元件相互作用的转录因子

runsong

我想预测一个基因受哪些转录因子的调控，用软件及数据库的话应该怎样做。$ ~2 K* ^8 W2 g! l1 V% ^; l
希望各位前辈给以指点。

tonyp0720

http://www.cbil.upenn.edu/cgi-bin/tess/tess
. z0 ]& z9 K, a5 E宾夕法尼亚大学的转录因子搜索系统  这个网址个人觉得比较有用。

fguw

Try this website , http://www.cbrc.jp/research/db/TFSEARCH.html% J4 i# v' x5 c# }: p
it could provide some information, but  not perfect+ ]% ?& u+ f: Q8 S2 C
While I tried other websites, it looks only this one works
& V4 ~" W: S" f" h4 E$ K6 U

kosmos.y

http://www.geneontology.org/到这里吧，GO很强大。包含数据库和工具。很多生物信息学分析都是用它的，蛋白的pathway分析什么的，它很好用

tanguixiang

顶一楼 ，TESS很不错的

runsong

回复 tonyp0720 的帖子
  I6 \9 s; t/ Y/ V) X. D
0 U/ g# r# F& D8 ^  d, I+ i  j. I十分感谢你提供的信息，但我不知何使用，能发给我使用方法吗？谢谢！

tonyp0720

runsong 发表于 2011-9-3 13:31 , B$ U# b( c% m+ P1 J! j7 H
回复 tonyp0720 的帖子0 a9 T2 \1 p6 t- I( i) ]* D
# J$ l+ j! B4 t5 I
十分感谢你提供的信息，但我不知何使用，能发给我使用方法吗？谢谢！

% R, U% g/ Q* |$ t0 L* }7 ]
你点击 site searches ,进入它的页面，在DNA sequence 里面拷贝你的序列，其他的一般不需要改动，点击submit即可。也可以看下面的每条提供的解释，根据你试验来选择。这样说不知道你明白不。