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大家包装的慢病毒滴度是多少(不包括浓缩)   [复制链接]

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楼主
发表于 2012-3-7 20:33 |显示全部帖子
干细胞之家微信公众号
我差不多是10的6左右,浓缩之后基本达到10的8,凑合用~9 j4 B- s- O' H
转录本里面要是有miRNA什么的,会导致包装效率下降,因为有一些本来可以包到病毒里的RNA被裁减碎掉。如果没有会被剪掉的元件的RNA的话,要是比较小的插入片段,估计应该有10的7左右吧。
/ S1 L9 x9 m7 R7 i: m- H# p$ a
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沙发
发表于 2012-3-24 23:19 |显示全部帖子
回复 sj03572001 的帖子
; H! H' e- Q! Q" g5 e9 I+ l9 e# Z$ G8 }
我是VSVG, delta-R8.91 和pGIPZ三质粒系统。我不知道是不是invitrogen的,因为是从我们实验室别人那里要的体系。protocol不方便给你原版,因为是别人整理的。但我可以说个大概。就是,用10cm dish 满的293T一盘传4盘(10ml培液),这4盘都不加双抗,培养24小时,大概达到50-80%覆盖率。这时候做个类似于lipo2000的转染,按标准的lipo的protocol转。就是一只管子加optiMEM和lipo,一只管子加potiMEM和质粒(VSVG:R8.91:pGIPZ=1ug:3ug:4ug,对于10cm大盘),之后混合,放置15分钟,再滴加到细胞里。12小时后换液换成有双抗的培液(DMEM加10%血清),之后36小时收一次病毒,再换液,再24小时后收一次。大致流程就这样。我觉得最关键的就是转染效率,建议你用个GFP的质粒先摸转染条件,主要就是lipo加多少,质粒加多少。效率要90%以上GFP阳性才行。
. J. P# j2 `+ f如果你包装的是shRNA或者miRNA的序列,这种病毒滴度本来就不容易做的高,因为有些RNA自己会被切断,而没法包装成病毒。只有幸存的RNA才会包到病毒里。6 N# [& o- w. E$ j2 Y) E
祝顺利!
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藤椅
发表于 2012-3-25 14:52 |显示全部帖子
回复 huangcong1988 的帖子( n" ]& k8 q3 f" f# d" E

. Q" e6 P4 }0 _) F9 S) q9 Y/ ^浓缩后加的培养基可以是你转染的对象细胞的培养基呀。如果你足够猛,就直接把这种浓缩过的东东当作培养液加到吸走培液的细胞里,那就浓到了极限了吧~
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板凳
发表于 2012-3-28 14:50 |显示全部帖子
回复 huangcong1988 的帖子
8 B) T7 s' {& U' \4 N& g. Y( t+ [1 E; X
按这样说来,确实是被稀释了。
. h3 z0 H; s6 x; R) C6 O不过,通常我是这样认为的:' D  b! X1 H: l! P6 q
一开始没浓缩时,假设体积是100毫升,, ?' M) u% `; d& G$ o! U
浓缩后,变成一个坨坨,
- s* y/ y3 R, x, g3 i把这个坨坨用1毫升的溶液给溶解了,
. b% S7 F5 D& d1 c- R6 e假设病毒没有损失率,那么就算是“浓缩”了100倍。因此用我的观点看,是“浓缩”了。
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报纸
发表于 2012-3-28 14:52 |显示全部帖子
回复 salomemao 的帖子
/ Z8 a& {7 B$ k- T; ~4 o
7 M1 @( J# w% [; ?/ x( R$ N8 u0 Z转染三质粒的时候,我们实验室的protocol是不加双抗的,据说双抗会影响我们的体系的转染效率。原因我也不知道。之后十二小时后我们认为质粒已经进到细胞里面了,所以再加上双抗防止污染。
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地板
发表于 2012-3-28 20:57 |显示全部帖子
回复 salomemao 的帖子
! k3 |# Y; x, r1 |3 E/ V" m6 T
  o' v& p* b. @( _2 P是啊,让你见笑了 :)

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7
发表于 2012-3-29 12:32 |显示全部帖子
回复 huangcong1988 的帖子2 @5 j! H4 X  Z( q5 v

% }# s& o1 s- t* {1 g$ @我是用50毫升离心管,PEG6000和浓NaCl来浓缩,低速离心。一次可以离35ml,最后溶在400微升里面,扣除损失,估计浓缩应该在80倍左右。我还用超速离心法浓缩过,那个方法得到的坨坨很少,因为坨坨主要是血清里的蛋白,超离的时候很少下来。超离我是37毫升最后可以溶在大概200微升甚至更少。
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发表于 2012-3-30 21:25 |显示全部帖子
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8 m6 _7 L; e1 m* |9 c) X& R( b2 Q% @. P

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发表于 2012-6-5 13:28 |显示全部帖子
回复 huangcong1988 的帖子
7 _6 x/ `# i! S# F, i6 j& S
% o2 j+ N. e4 k6 u6 ]是的。
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