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逆转录病毒的包装   [复制链接]

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楼主
发表于 2011-11-17 08:04 |只看该作者 |倒序浏览 |打印
1.我有一个含目的基因的逆转录病毒质粒,想将该质粒包装成病毒后再感染细胞。由于之前从未做过病毒包装,我想请教一下群里的各位朋友,包装病毒的过程以及测病毒滴度难不难啊?是自己做好呢还是交给公司做? ) A0 Y; Z& {5 F& T: e$ |
2.如果这个逆转录病毒质粒不包装成病毒,可以直接拿来转染细胞嘛?
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沙发
发表于 2011-11-17 09:10 |只看该作者
包装病毒并不难,一般用293T或293FT做转染,生产病毒,再感染目的细胞,我给你上传一份慢病毒和逆转录病毒的protocol,你看看,很简单。测滴度也不难,病毒感染293T细胞后的48h测,步骤如下: ①. 15万293T细胞48h即可刚好长至90-100%满,此时即可固定细胞,计数确定病毒滴度。& O6 Y% |: Z/ W) |) a7 w
②. 将培养基用真空泵吸去部分,务必不要将其吸净,由于293T细胞易飘,固定及DAPI染色整个过程请务必保持293T细胞处于液面之下。用PBS涮3次。加入4% PFA室温固定30min, 24孔板每孔200ul。
" w% i1 J1 v- x7 T7 D③.用PBT洗2次,每次3分钟。
" U6 W# X6 l) f. ]④.PBS将DAPI 1000倍稀释,每孔加入200ul,避光室温静置5min。
' K6 e3 G! p7 z/ t9 u2 C⑤.PBS洗2次,每次5分钟,即可在荧光显微镜下计数,取2-3处取平均值。
0 p+ ]  S1 @3 }9 q& O9 y⑥.病毒滴度(IU/mL)=荧光细胞占总细胞数的百分比÷加入的病毒上清体积×1.5×10*5×10*3
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藤椅
发表于 2011-11-17 09:10 |只看该作者
Retrovirus / lentivirus infection protocol" W- v; R' x4 q/ b
D1: Seed HEK293T cells in 10cm dish (cell density should be ~80% confluency right before transfection)
  t, P+ P# p. B: K5 S8 h% L*** Handle HEK293T cells gently to avoid detaching from dishes
: c1 |2 a' z* E1 m) P& iD2: After O/N incubation, transfect the following vectors with proper reagents (Fugene 6, Lipofectamine 2000, polyjet et al) following their instruction
! ]% x! T) K9 ]$ \2 VFor retrovirus: 12ug of gene of interest, 6ug of Gag/pol, 1.5ug of VSVG
  u. }4 \+ G0 k2 MFor Lentivirus: 12ug of gene of interest, 6ug of Δ8.9, 1.5ug of VSVG
8 _! S$ D1 R. X- a*** ~6 hours after transfection, change medium to fresh DMEM with 1% FBS supplied with P/S, and incubate at 37°C for ~48hs (two overnights)% M. x7 ]' @6 i3 f' S. P# ], R# r
D3: Seed target cells for infection in 6-well plate (60~80% confluency before infection)
/ k4 f6 V  ^" r- DD4: Collect viral supernatant from HEK293T cells into 15ml tubes
2 ~' W9 ?6 P2 M' {5 R! m↓ spin down at 2000RPM for 3mins to remove cell debris# U, Q' q0 |* r
↓ pass the viral supernatant through 0.2um or 0.44um filter (called D1 virus)
* W) R+ X% C! L↓ Wash cell in 6-well plate with 1XPBS
# g; Q5 K, k) s& `. L↓ Add 1.5ml of filtered viral supernatant to target cells in 6-well plate, then add 8ug/ml of polybrene (by adding 1.5ul of 8mg/ml stock) 9 J1 L% T2 _$ E% n1 U" l, }
↓ Incubate the cells in 6-well plate at 37°C for ~6hrs! R5 D. ~$ e' w
↓Add FBS or complete cell culture medium to make final FBS concentration close to ~10%+ l* M8 Z) s  L6 {) E
↓ Incubate at 37°C for overnight
3 i  u2 }6 u: L* W*** After collecting D1 virus, you can add more DMEM with 1%FBS into HEK293T cells and collect D2 virus after incubating overnight. But the D2 virus usually has lower viral concentration.8 _  N. S6 y8 g# k
*** For retrovirus, you may need to repeat the infection for three times; for lentivirus, one time infection is enough in most of the cases.
( R6 _' u  C5 g  a*** The leftover of the viral supernatant can be stored at -80°C.; O" t' M0 h/ S  L
D5: You may start selection with antibiotics if your cells don’t need further infection; a! X2 A. _' i
*** You need to titrate the antibiotic concentration for selection in your cells ahead
2 d2 u+ c" O7 }! f( v; p/ ^$ |
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板凳
发表于 2011-11-17 09:57 |只看该作者
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回复 zhangtang 的帖子
0 x8 H5 `$ j/ v9 t) A' y. E: r& B) G$ c* @
1如果有齐全的质粒,自己做病毒肯定没问题。. }! e; c$ F/ n* O. O. O
2,质粒本身就可以用来转染,效率没有病毒高
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报纸
发表于 2011-11-17 10:38 |只看该作者
回复 momocy 的帖子
' N5 s9 h3 V5 F7 a3 ?
* `9 V  p. f. T3 c你好,谢谢你给我的回答。我这个逆转录病毒质粒不含荧光,那如何在荧光镜下计数来测病毒滴度呀?
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地板
发表于 2011-11-17 10:47 |只看该作者
回复 momocy 的帖子; M2 E2 A: R2 Y& i& f7 N
' c2 {* }4 ^) m5 ~
如果逆转录病毒质粒不含荧光,如何在荧光镜下计数来测病毒滴度?

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发表于 2011-11-17 21:42 |只看该作者
回复 zhangtang 的帖子4 ^* ]/ m* L* Q( b  J  G- }
1 b: g1 q8 q1 z" T! ^
你增加一个GFP的对照,通过GFP的来估算其他质粒
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发表于 2011-11-17 21:47 |只看该作者
回复 momocy 的帖子0 ]( u( m# Q! }  S0 M- l

+ X/ M3 u5 H$ w- c0 u7 _你好,你说增加一个GFP对照的话,是不是空白质粒flag也要包装啊?还GFP组就可以作为空白质粒对照组?
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发表于 2011-11-18 09:11 |只看该作者
回复 zhangtang 的帖子6 D7 Z0 `# J, o0 T" G
4 n; K% ~! m. k2 [
你转染的时候,多转染一个GFP,也就是GFP和质粒同时做,算出GFP的滴度,然后你质粒的病毒和GFP加的量一样多,这样不就行了么
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发表于 2011-12-13 08:47 |只看该作者
我的就是这个样子的,本身质粒没荧光,加一个GFP作对照!可是问题是我的包装细胞状态总是不好,包出来的病毒去感染293t荧光很不亮 而且很少 可以告诉我怎么个情况吗?谢谢啦!5 `- x7 u$ x9 t" z
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