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[请教] 5'RACE的方法主要有哪几种? [复制链接]

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包包
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楼主
发表于 2011-11-23 22:19 |只看该作者 |倒序浏览 |打印
我看到的是TAKARA的去帽然后加接头方法。; {5 `* V, @$ W8 l- J
请问还有哪些比较经典的方法?比如SMART的用的是什么方法?谢谢。
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沙发
发表于 2011-11-24 12:33 |只看该作者
回复 heiguzi1988 的帖子
. o1 a# t3 _: P, s$ K+ P! ?! B% c1 \5 ?6 i% E* s4 Q) Y
据我所知,TAKARA Smart方法就算是比较经典也比较广泛使用的方法了,因为它用的反转录具有末端转移酶的功能,所以,反转录到头后会加三个GGG,然后和反转录时加入的带有3C的oligo配对,继续反转,这样就在第一条连后加入了一段oligo,后面就剩下PCR了,我感觉效果还是很好的,而且价格比较便宜!其实不同方法间的区别就在于所用反转录酶的不同,以及反转录方法的不同,具体有多少种就不知道了,反正你要用商业试剂盒,你可以去各个公司查一下,好像promega和invitrogen都有相关的试剂盒!
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藤椅
发表于 2011-11-24 14:42 |只看该作者
回复 langziforever 的帖子
% N- ^. a7 b' N& I9 B1 v
. C9 Y; j: S2 Z& u& l我看的一种方法应该叫做去帽加连接接头的方法吧。不是从POLYA 开始反转出第一条CDNA,而是从5‘端反转出第一条CDNA。
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板凳
发表于 2011-11-26 22:48 |只看该作者
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回复 heiguzi1988 的帖子" B9 g- l) y4 X! l
8 Y+ H9 Z& m8 i" D3 ^& I
也有先把RNA的帽子去掉,然后加一个RNA adaptor,但是,反转肯定是要从polyA或3‘段特异性引物开始的,合成第一条cDNA,因为这个是所用酶催化DNA合成的方向决定的!1 l6 B3 D, e5 G( @
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