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[原创] 关于核酸 DNA/RNA抽提时候注意事项经验之谈 [复制链接]

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优秀会员 金话筒

楼主
发表于 2012-3-2 19:53 |只看该作者 |倒序浏览 |打印
1.关于A260/A280 这个只要符合区间规定就可以了,没必要弄的很高。另外,水/TE做溶剂时候这个值也是有差别的,我的经验是水的话这个值偏低,TE的话偏高
7 _1 E- v$ P/ j: W* A; A! p& o/ D5 n
2.用水还是用TE?很多人会问这个问题。我可以回答:绝对是水!抽提的DNA要酶切,连接,转化,或者DNA测序。TE中的EDTA会干扰这些过程用的金属离子浓度,造成消化不良% j1 _- t( u# p
+ W0 X/ V+ @& I8 R( }
3.如果是做realtime,要用反转录试剂盒里面提供的水。
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沙发
发表于 2012-3-2 22:21 |只看该作者
第二个问题:用水还是用TE。我一直用TE,如质粒需长期保存,我用1×TE,如做酶切则用0.1×TE。在TE里面质粒较水稳定,适合保存。另外,提出的质粒浓度都不低,酶切所取体积都不太多,是否干扰酶切值得商榷。
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藤椅
发表于 2012-3-3 07:58 |只看该作者
回复 holywater 的帖子0 a; @  p, d3 F) ], i; `8 @& g# x* ~4 A

) L7 }7 M6 U, Q0 O4 t! `在提取基因组DNA的时候遇到这样的现象,加苯酚:氯仿抽提离心后,最上面那层出现冻状物,在吸取的时候很容易就把中间蛋白层吸起来了。
7 _0 I/ n& P. L请教一下,为什么会出现粘糊糊的冻状物,是糖分吗?大侠有没碰到过这样的现象?
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板凳
发表于 2012-3-4 17:07 |只看该作者
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现在试剂盒里的洗脱液都只是tris溶液,我们自己做的时候用那个也不错,0.1×的TE也很好,DNA在纯水里容易不稳定,最好还是保存在缓冲液里。长期保存的话,抽成干粉最好,或者抽提后,用乙醇析出时,直接连乙醇冻-20,固态的DNA总比在溶液中稳定。; K* [& u5 ]& [0 U6 I* U4 B2 V
感觉那个黏糊糊的会不会是基因组DNA?细胞太浓了?
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报纸
发表于 2012-3-4 23:15 |只看该作者
我提一直用的是TE,第一次看到是用水的,算是开眼界了,但是TE干扰酶切,楼主有依据吗,做过对照实验吗?
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地板
发表于 2012-3-5 10:45 |只看该作者
中间的糊状物不仅仅是糖分  还有蛋白
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发表于 2012-3-5 11:28 |只看该作者
我做RAN的时候,也是一直用的是TE,而DNA则一般用水。我也有相同疑问,TE干扰酶切吗?依据是什么?是否做过有过这样的经验?
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