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[讨论] 关于microRNA引物设计的问题 [复制链接]

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包包
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优秀会员

楼主
发表于 2012-3-29 12:57 |只看该作者 |倒序浏览 |打印
本人想针对某一个小RNA进行设计引物,可是一查此小RNA还区分种属(人/小鼠/大鼠等),因为小RNA序列短,我查看这几种种属RNA的碱基序列相差也不大,请问能不能通过某种手段设计通用型引物,而不是仅仅针对某一种属。
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沙发
发表于 2012-3-29 13:12 |只看该作者
我做过的一个n-mir,人的和小鼠的序列完全相同,大鼠比小鼠的少末尾的一个碱基,设计的引物三个种属的都可以用。
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藤椅
发表于 2012-5-6 14:31 |只看该作者
回复 如来的观音 的帖子
5 f6 s6 H$ Q# u5 u! }1 T4 g# e' m3 q/ m) `' [
检测不多的引物可以在公司合成,也不贵。
) r5 A1 ]) ]4 [2 u' D7 F7 S) \! g你们检测miRNA表达量的时候会不会一会上调一会下调,重复数据不稳定?
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优秀会员 金话筒

板凳
发表于 2012-5-18 05:00 |只看该作者
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回复 如来的观音 的帖子
/ x+ S: a+ F( ?
8 `- r% A8 ^3 Z2 s老老实实地分开做吧,本来就不好做,要保证引物的特异性只能这样了,而且你也没有必要同时做几个物种吧?还有有些miRNA还有不同的亚型,这个时候也不能偷懒啦,得一个一个地区弄.好运!
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