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[请教] 基因表达载体构建的引物设计问题 [复制链接]

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包包
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楼主
发表于 2013-1-24 23:43 |只看该作者 |倒序浏览 |打印
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基因表达载体构建的引物设计# ~% V& M# T1 Z; j  j% ~) ~
为什么如果目的蛋白融合在N端,编码区第一个密码子必须为atg,3’端不应有终止子?
! ]% w. E" q& B  s4 k' R" T3 b0 _' x) }为什么目的蛋白融合在C端,可以不考虑起始密码,但3’端必须加终止密码?6 P% s' ^1 m# B  j

2 ^% V4 \9 w- C% s2 _
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沙发
发表于 2013-1-25 09:03 |只看该作者
同求高手指教!是否目的蛋白融合在N端,3’端有终止子,就终止了目的蛋白的表达,即达不到融合目的?  T+ D; d, ^* V; W, j, ~
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金话筒 优秀会员

藤椅
发表于 2013-1-25 11:39 |只看该作者
回复 zhangtcm 的帖子
, j$ o' _  s2 Z! o$ O7 Y% e& A" k6 X% K3 ^( q
目的蛋白在N端,则转录从识别目的蛋白ATG开始,一直到标签蛋白才结束,则需要去掉目的蛋白的终止子,使标签蛋白的转录能继续,到遇到标签蛋白终止密码结束。除非标签蛋白前有独立的启动子,则可以不考虑。
: b. Y1 {4 N# [! e' y8 c+ T' u而目的蛋白在C端,则标签蛋白在前起始转录,只要保证目的蛋白不移码,即可顺延转录,无需起始密码子,但必须保留终止密码,因为这次的转录截止在目的蛋白
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板凳
发表于 2013-1-25 21:57 |只看该作者
主要是看gene和tag的位置。如果是tag-gene,则gene上可以没有ATG,比如构建的是一个基因的部分序列,但是如果是一个基因的完整CDS,最好保留起始密码子ATG,这样才能保证gene的氨基酸不变。如果是gene-tag,因为是融合表达,所以gene上需要有ATG,因为启动子是从ATG开始其实翻译,而gene的终止密码子也要去掉,这样才能gene和tag都表达。在构建的时候特别需要注意读码框的问题。
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报纸
发表于 2013-1-25 22:30 |只看该作者
回复 86964109 的帖子! }# W2 Z/ {# c0 F! n* o+ [- Q* |
/ c' J& s( b( M) R  M4 M4 g" N
谢了

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地板
发表于 2013-1-25 22:30 |只看该作者
回复 mzaq2006 的帖子7 b6 a/ I& K% C' `" `

5 D; j3 M' {/ m7 }+ N+ ?谢了
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