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本帖最后由 细胞海洋 于 2014-1-20 00:56 编辑
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关闭“衰老基因”! R. H0 s4 z5 S- P
2014-01-15 1 来源:生命科学研究快报 作者:王耀
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在酵母实验、蠕虫、苍蝇和猴子,乃至人类中的实验发现限制卡路里的消耗能够延长寿命,但不清楚其中的机制。以色列特拉维夫大学 Blavatnik 计算科学学院 Eytan Ruppin 教授实验室的博士生 Keren Yizhak 及其同事开发了一套计算机算法,以预测哪些基因能够创造类似限制卡路里消耗的抗衰老效应。这项发现发表在《Nature Communications》期刊上,或可以引导人们开发新的药物应对衰老。0 J" r4 C8 K# N. }4 \ S
研究人员表示,许多算法都是设法找到杀死细胞的药物靶点来治疗癌症或细菌感染,该算法寻找将细胞从疾病状态转向健康状态的药物靶点。 Ruppin 教授的实验室是基因组规模代谢建模( GSMMs )领域的领导者。研究人员通过 GSMMs 描述细胞的代谢以及维持生命的过程。一旦建立了系统,单个模型作为数字实验室就能够允许人们通过点击鼠标进行大容量的测试计算。 Yizhak 的算法被称作“代谢转化算法”( MTA ),该算法能够获得任意两个代谢状态的信息,预测状态改变是由基因改变或环境变化导致。4 v' @$ E: y! Y5 u
本项研究中, Yizhak 使用 MTA 系统来检测衰老基因。基于实验室过去的发现, Yizhak 继续使用 MTA 预测哪些基因的关闭能够导致老年酵母看起来像年轻酵母。许多 MTA 系统确认的基因都是已知关闭就能够延长酵母生命的基因。将发现的其他 7 个基因转移到 Bar-Ilan 大学实验室进行测试,研究人员发现关闭其中的两个基因 GRE3 和 ADH2 能够在现实中显著增长酵母的寿命。 MTA 显示出关闭这两种基因增加氧化应激水平,可能会引起类似限制卡路里消耗的效应。 Yizhak 使用 MTA 系统来测试人类代谢信息, MTA 系统通过 4 个不同实验的结果能够找到一组特别的基因,该组基因能够在年老的细胞和年轻的细胞之间产生 40%~70% 的差异。尽管现在没有任何手段能够在人体实验中证明这些结果,但是已有证据证实这些基因能够延长酵母、蠕虫和小鼠的寿命。
; v, k$ s7 p, R$ P( a# g/ h8 Z: u未来, Yizhak 将研究关闭 MTA 预测的基因是否能够延长基因工程鼠的寿命。
, o8 H! M3 s9 J0 @! i( r原文检索:
+ v1 x3 @1 O2 j- r- r" u# f: uKeren Yizhak, Orshay Gabay, Haim Cohen, Eytan Ruppin. Model-based identification of drug targets that revert disrupted metabolism and its application to ageing. Nature Communications, 24 October 2013; 4 DOI: 10.1038/ncomms3632) N, J" d- j7 w: p# b
- D6 p! ^9 M! V2 E( \. ^8 {
2楼原文 感谢tianzhang 提供 |
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