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Nature:STAP干细胞兴衰始末,如何瞒天过海 [复制链接]

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发表于 2014-7-8 08:59 |只看该作者 |倒序浏览 |打印
绝大多数杂志使用CrossCheck来检测是否存在剽窃,它可以在大约四千万已发表的文章中进行比对。Nature的编辑们也采用了这样的技术,但遭到剽窃的段落出自In Vitro Cellular & Developmental Biology — Animal,这本杂志当时并未录入CrossCheck。此外,就算CrossCheck时出现了匹配也不一定论文就不能发表,只要注明出处,许多复制文段并不会构成剽窃。- i7 L$ m8 g1 B3 q

* F# Q, A1 o2 X不过,剽窃并不是STAP最大的问题,图片处理才是致命伤。小保方晴子将不同实验的电泳图拼接起来,并且使用了自己博士论文用过的畸胎瘤细胞图像。; h' X- |( l) E' u! t
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图片处理也是可以检测出来的,现在各大杂志也在加紧这方面的核查。EMBO旗下的杂志,会对每篇文章中的图片进行分析,通过改变对比度、颜色等属性让人为操作现出原形。据EMBO统计,大约有20%的来稿存在图片处理的痕迹。而Journal of Cell Biology杂志也在筛查中得出了类似的比例。当然,图片处理并不会直接被打成作假,例如有时拼接图片是为了更简明地呈现数据,或者说让图片“更漂亮”。
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与此相比,重复使用不同来源的图片就比较难发现。交叉比对文献中的图片,需要高性能的搜索算法,甚至可能要用到超级计算机。这一技术已经被讨论了很多年,但一直没有什么进展。
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) m+ c: [' w+ s* B7 c: y0 W对于文章中的图片,Nature及其子刊采取的是随机抽查策略。Nature发言人称,因为资源有限无法核查每一张图片,而STAP论文的图片就没有经过检查。据悉,Nature正打算增加抽查的数量。
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对于非同寻常的成果,图片和内容检查显然是不够的,还需要独立的遗传学分析。2007年,Nature就在发表Mitalipov的成果之前进行过这样的分析。然而这一过程“拖了好几个月,” Mitalipov说,于是他后来的文章就选择到Cell去发表。
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共同作者们怎么了
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Nature并没有披露编辑和作者之间的交流,不过主编Philip Campbell指出,两篇STAP文章涉及了四个独立的团队,“我们理解为这项工作已经得到了独立性的重复”。而且在受到质疑的初期,共同作者们也都声称看到了重复性的结果。
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" a9 t2 q( h' q8 o* PSasai说自己的实验室目睹了STAP细胞的生成。但实际上他只要求小保方晴子重复了STAP过程的第一部分,Oct4蛋白的表达。他声称自己当时没有考虑到“这些细胞与STAP干细胞之间的差距。”(Nature新闻:日本干细胞研究深陷造假疑云)
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Wakayama曾说自己“独立”制备了STAP干细胞。一开始,他在发给Nature新闻团队的e-mail中写道,“在RIKEN我独立获得了(STAP细胞的)成功,我知道结果是绝对真实的。”但后来他意识到,自己的重复并不完全独立,小保方晴子参与了整个实验“监控每一步”。他因为到山梨大学就任新职位,并没有验证细胞,也无法排除细胞被调换或污染的可能性。
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# R# C  ^. i6 b- D. Z, d+ R1 R在共同作者中,最令人困惑的是Vacanti。就在STAP论文发表后的一周内,他给New Scientist杂志发去了自称是人类STAP细胞的图片。鉴于STAP未能被重复,二月中旬他告诉Nature新闻团队:“不应该有任何困难。我能做到,其他人也应该能做到。”三月中心,他在网络上发布了制备STAP细胞的一系列小窍门,称这一技术“无视所用的细胞类型”。然而,到目前为止他再未提出任何STAP细胞的新证据。七月二日他发表声明指出,他因为文章中存在错误同意撤稿,但他相信STAP的“核心理念”将会得到验证。
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反思与警醒
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" Y) \. j+ q* R& O( `* B/ p6 b对于许多干细胞研究者来说,最令人震惊的事莫过于Niwa、Sasai和Wakayama居然参与了如此混乱的工作。身为共同作者他们本应确定这项研究的可重复性,因此他们理当在STAP事件中承担相应的责任。也有人对这些共同作者表示同情, 科研工作中应当有足够的信任,不然就整个系统都站不住脚,你总不能每一步都盯着别人吧。
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7 ~8 r) `, M0 C- c也有研究者指责Nature审查不严,没有进行验证就急匆匆地将结果发表。但主编Campbell回应道,“Nature并未降低自己的监管标准”。' Q; k, w- I3 I8 l
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对于干细胞研究者们来说,STAP细胞已经成为了黄禹锡之后的又一则警世故事。Scripps研究所的干细胞生物学家Jeanne Loring说,这一事件提醒自己做好实验记录的重要性,另外与人展开合作时也要更加谨慎。
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/ N; B* ?0 `  `) f: |4 [“在科研领域名誉就是一切,”加州再生医学研究所的主席Alan Trounson指出,“名誉的丧失是极难挽回的。”$ Y+ e/ q. d5 c  L; ~  }( a  l

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生物通编辑:叶予
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沙发
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The rise and fall of STAP

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藤椅
发表于 2014-7-8 09:21 |只看该作者
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$ Q- o% K9 O( r  q( n2 I5 EThe rise and fall of STAP
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