Cell：北大学者发布突破性单细胞基因组检测技术（附原文）

yinfuhua

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Cell：北大学者发布突破性单细胞基因组检测技术. \( `, A  V+ o: b1 J
2013-12-20 来源：北京大学 作者：koo
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近日，北京大学的科学家们完成了对单个卵细胞的高精度全基因组测序，这是一项里程碑式的工作。该项研究由北京大学第三医院乔杰教授、生物动态光学成像中心汤富酬教授和谢晓亮教授所领导的三个研究小组共同完成，谢晓亮同时也是哈佛大学的教授。: `' ?8 f# ?; `, ^* J' X
人类的遗传信息存在于每个细胞的DNA中，DNA是由四种不同的核苷酸组成的长链。这些核苷酸的组合和序列组成了遗传的基本功能单位——基因。无论在基础研究还是临床应用上，对细胞中所有基因序列（全基因组）的测定都是极其重要的。但是，由于单个细胞中仅含有每个基因的两个拷贝，因此对单个细胞进行全基因测序是非常困难的。2012年，谢晓亮课题组实现了对单个细胞全基因组的高精度测序，随后，该技术被应用到多项研究工作中去。体外受精技术（IVF）是辅助生命个体在体外从单个细胞开始发育的技术，因此，单个卵细胞的全基因组测序是辅助生殖领域的研究人员梦寐以求的研究课题。而北大团队的这项工作实现了该领域的一项重大飞跃。, U1 d% ?3 q. x

% J& O3 ~1 Q5 e# h& z0 o( t$ \- j在《细胞》杂志的这篇报道中，北大团队巧妙地利用了卵细胞成熟、受精过程出现的独特的结构——极体，它是卵细胞分裂的副产物，并且不参与卵细胞后续的正常发育过程。该团队研究人员发现了一个新的方法，通过对极体的全基因组测序推断出在受精卵中母源基因组的情况，从而选择出一个正常的胚胎进行移植。
0 X9 O; k1 r: f! j: S除了在基础研究中的重要意义，这项工作对于临床上严重遗传疾病的诊断和预防方面也有重要意义。这一方法能够帮助医生诊断出来自母亲卵子或者父亲精子的遗传病。乔杰教授解释说：“今年是人类辅助生殖成功应用35周年，35年来IVF技术给无数家庭带来了福音。不孕不育问题困扰着高达10%-15%的育龄夫妇，而IVF技术是解决不孕不育问题的重要方法之一。我们正在采用极体单细胞基因组测序技术去提高IVF的成功率，特别是对于高龄以及反复流产的妇女。”
7 _/ o0 \6 [5 U8 f. s3 }6 C汤富酬教授进一步解释说：“我们利用这一技术一箭双雕地实现了两个目标，既能够检测染色体异常也能够检测与遗传疾病有关的DNA序列变异。这项技术有可能将试管婴儿的活产成功率从目前的30%提高到60%。”
5 p# s2 o' J+ ~0 X7 t7 X目前，北大团队仍在全力探索这项技术在基础研究和临床试验中的应用潜力。2 X5 [* g( h  g: L
通讯作者：汤富酬，北京大学生物动态光学成像中心；谢晓亮，北京大学生物动态光学成像中心和哈佛大学化学和生物化学系；乔杰，北京大学第三医院
( y9 R! c: Z- V7 `+ K; {原文检索：6 ?+ J; n  b9 c1 z5 F
Yu Hou, Wei Fan, Liying Yan, Rong Li, Ying Lian, Jin Huang, Jinsen Li, Liya Xu, Fuchou Tang, X. Sunney Xie, Jie Qiao. Genome Analyses of Single Human Oocytes. Cell, 19 December 2013; DOI: 10.1016/j.cell.2013.11.040" b- O1 E" F0 v0 Q$ ~' G

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5 A1 `4 s8 b9 U0 h0 q& l8 s7 D2 j; ^+ ]2楼原文 感谢芦苇浅 提供

芦苇浅

- c1 X4 {3 o0 o3 @4 S# x
好牛啊，都上新闻联播了！

yinfuhua

回复 芦苇浅 的帖子3 O% g: V& W! f# W, H$ E% R. x

+ H1 M! T1 R6 H% L/ O" g谢谢！

tpwang

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% K' Q4 G& W; S% z祝贺，很了不起的发明。) [; B, `2 X5 M. k

* F" ^: C' B6 ]5 z) S& n"这一方法能够帮助医生诊断出来自母亲卵子或者父亲精子的遗传病。"* V* J3 x! L2 L( h) Z

- n7 z1 M( S) W* B, i这篇文章是针对卵子也就是母亲的吧。However the disadvantages for polar body biopsy are that it cannot detect the aneuploidies and mutations inherited from the father and cannot detect the aneuploidies and de novo mutations arising from mitosis.8 W  }( J+ Q% M: X7 G! {$ K

9 q  ]2 D) w! x" i原则上也可以用于父系遗传疾病的诊断：The same method in principle can be applied to blastocysts, considering that the severe genetic variation is either from the father or the mother. 4 j  G: \) h" I! q; H5 F
0 y4 {8 B& s7 ]7 ]( j
可能不久也要发表了吧？4 @8 A: K- O" h- Z

/ j- G/ ~$ h8 K0 T0 {. ROur MALBAC sequencing offers improved resolution and accuracy of simultaneous detection of chromosome abnormality and heterozygous SNVs associated with Mendelian diseases.6 J# z! i% d% j: _  J& G
3 c. d9 W4 ?9 }1 m
赞。

yinfuhua

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5 S$ V8 \; Q: R8 u谢谢！