关于 重亚硫酸盐测序

Damon-Salvatore

看到08-10年的文章经常用到重亚硫酸盐测序（bisulfite sequencing）技术，简单查了一下得知Bisulfite处理能够将基因组中未发生甲基化的C碱基转换成U，进行PCR扩增后变成T，与原本具有甲基化修饰的C碱基区分开来，再结合高通量测序技术，可绘制单碱基分辨率的全基因组DNA甲基化图谱。' x9 @# L/ n$ S9 q0 x
但是10年后的文章没怎么见到过，是有更好的技术将之取代了么？还请指点。) Q1 X3 l; }2 z
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490096812

主要是10年后，5hmc,5fmc逐渐变得火热，5mc这中测序技术就不能区分5hmc，5fmc，5mc，这是他的弊端。同时这项技术也在发展，发展出来了氧化重亚硫酸盐测序，这样可以区分5hmc，5mc。这是新的热点之一。个人理解喔

Damon-Salvatore

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  f$ |0 G  b" p# R# i8 q( \1 _; {5hmc，5-羟甲基胞嘧啶
$ ]5 Y7 u6 t2 O8 b/ Q5mc， 5-甲基胞嘧啶" @# a( X2 F' I! X* L. E2 h$ x
5fmc是什么？4 n6 R$ `3 ]9 m
谢谢指点！
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芦苇浅

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5fmc是5-甲酰胞嘧啶，还能被氧化形成5caC(5-羧基胞嘧啶)，都是DNA去甲基化机制中的一些中间产物。

Damon-Salvatore

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- q& {) X$ f0 q7 k多谢指点！