请问如何在NCBI上查找小鼠28srRNA序列？

koda

如题，谢谢！

koda

找到28s的了，想再问问5s的怎么找？ 貌似没有5s的呢。。。

86964109

我也没找到，不然你用人和小鼠的先试试http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NR_030686.1   http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/36084   好像是一样的，我以前查大鼠18S也很奇怪，最开始查出来过，保存了，过了半年再搜就变成别的名称了，不过用人和小鼠18S的引物可以扩增

86964109

我也没找到，不然你用人和小鼠的先试试http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NR_030686.1   http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/36084   好像是一样的，我以前查大鼠18S也很奇怪，最开始查出来过，保存了，过了半年再搜就变成别的名称了，不过用人和小鼠18S的引物可以扩增

koda

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) V( U  U. N; _& l! l2 a9 w7 x, k. b5 L7 ~4 n5 J1 c* e" D
请问http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NR_030686.1是怎么搜出来的呢？

86964109

回复 koda 的帖子% N1 J6 j* X( q8 C

4 f2 M: V6 j/ K, J( ~8 _NCBI主页-gene栏-输入5S-搜索-侧边栏Top Organisms  [Tree] 选Homo sapiens 或点击more后选Mus musculus  

koda

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( B% Q. n9 L1 @1 W
/ K7 {+ u! [7 O; {; L! J谢谢，我还想问问，http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/M31319.1
1 G( K7 {) U3 ehttp://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NR_030686.1这两个序列都是小鼠的5s rrna序列，但是比对结果不是100%一样呢？

86964109

回复 koda 的帖子2 F# `- O8 }9 i6 o9 G

7 r. z* k& W! v/ j1 f比了一下，http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NR_030686.1的小鼠和人的是一样的，和http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/M31319.1/的小鼠差了几个碱基，我也不知道怎么回事，可能是不同实验组测序的结果有误差，应该不要紧，设计引物避开突变的位点好了

koda

好的，谢谢！