基因组时代的科赫法则 (ZT)
目前，微生物病原快速鉴定的首选方法均以核酸序列测定为基础，通常不再依赖于细胞培养或动物模型。这使科赫法则更难直接套用，因此有必要对该法则进行修订。美国斯坦福大学医学及微生物学与免疫学教授戴维·雷尔曼（David Relman）和同事提出了基因组时代的科赫法则：（1）属于假定病原体的核酸序列应该出现在特定传染病的大多数病例中。在已知的患病器官或明显的解剖学部位，应能发现该微生物的核酸，而在与相应疾病无关的器官中则不会发现。
（2）在未患病的宿主或组织中，与病原体相关的核酸序列的拷贝数应当较少或完全检测不到。
（3）随着疾病的缓解，与病原体相关的核酸序列的拷贝数应减少或检测不到。如果临床上有复发，则应该发生相反的情况。
（4）当序列检测预示疾病将发生，或序列拷贝数与疾病的严重程度有相关性，则序列与疾病的联系极可能构成因果关系。
（5）从现有序列推断出的微生物特性应符合该生物类群的已知生物学特性。
（6）应在细胞水平探求患病组织与微生物的关系：用原位杂交来显示发生了组织病理变化的特定区域，以证明微生物的存在，或显示微生物应该存在的区域。
（7）这些以序列分析为基础获得的上述证据应当是可重复获得的。
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