中科院广州生物院开发RICK技术首次分离RNA结合蛋白

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中科院广州生物院开发RICK技术首次分离RNA结合蛋白
+ E3 M  O) n, E' e来源：科学网   发布者：ailsa   日期：2018-02-13
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RICK技术原理图。8 U% @+ @5 p& W/ @" R: n" U4 [# v0 ^
科学网广州2月13日讯 记者从中国科学院广州生物医药与健康研究院获悉，该院研究员米格尔•埃斯特班、张必良和副研究员鲍习琛领衔的科研团队开发RICK技术首次分离RNA结合蛋白。该技术是全面分析细胞内的RNA－蛋白相互作用的重要工具，有助于揭开基因组中的“暗物质”－非编码RNA的未知功能。相关研究2月13日在线发表在《自然-方法学》。
/ ]! f3 w( S$ a$ |# h$ o* y) c有数以百计的蛋白质可以与RNA结合，其中很多涉及神经退行性病变、自身免疫缺陷和癌症等疾病。那么，如何系统地分离RNA结合蛋白的问题变得引人注目。前期科学家们系统地分离了细胞内mRNA结合蛋白，这只是众多转录本中的一部分，细胞还包含了很多非polyA RNA。* y; m( U7 g, R  @( Q
研究人员设计了RICK（Newly Transcribed RNA interactome using click chemistry）技术，利用核酸标记技术，巧妙地将新合成的RNA标记上生物素，通过链霉亲和素偶联的磁珠，分离得到相应被标记RNA分子和与其相结合的蛋白分子。通过这一技术，研究人员系统地分离了包括非polyA尾RNA和新生RNA在内的一系列RNA分子及其结合蛋白。
* L1 C9 P. c/ K  e进一步分析发现，细胞分裂调控因子作为新的RNA结合蛋白，存在结合非polyA尾RNA的潜能。研究人员缩短标记的时间，成功地在细胞中分离了新生RNA结合蛋白。这些蛋白与新生RNA的转录及后续的加工、剪切等调控密切相关。这一技术的应用将有助于深入地剖析RNA结合蛋白的作用机制，也是细胞命运转变过程中分析RNA蛋白相互作用的重要工具。: M0 j& d- {+ @  E$ G
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