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楼主: sidalin301
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[讨论] 请教一个双酶切的问题     [复制链接]

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专家 优秀会员 金话筒 新闻小组成员

11楼
发表于 2010-10-19 13:21 |只看该作者
干细胞之家微信公众号
本帖最后由 深海寂寞鱼 于 2010-10-19 13:23 编辑
! \+ v- B- O; ~# I; A" N2 |: k4 O9 u
to sidalin301:* W  l4 {- P' k5 `1 {. j0 z) y8 s
" I6 S4 k  o$ E- m8 a
   你的问题描述的并不是太清楚。大致的意思是把目的基因从pUC57质粒上切下来,插入到pNL质粒中。但是因为没有pNL的质粒图谱,所以你担心可能会把序列反向插入,从而使目的基因不能表达。
2 Q6 K( `* e0 w: u* r) z
; B" c  n% z; ]* Y+ W4 a  1. 解决这个问题的关键在于找到pNL质粒的图谱,如果没有图谱,一切都是在猜测之中。
" ?$ B6 @5 p! y, r; ]$ n: i0 p   
' |. r6 H8 K" x9 {* m7 |2 |: ?      我试着帮你找了找,在Addgene的网站一共找到了4个相关的质粒。(见下图)+ J+ h, L" |4 i! n7 d8 X+ R+ F4 z
      不知道你的质粒具体是其中哪一个?& m/ m! A0 g, x
       1.jpg 0 C) i5 P  G: A  [2 y) h- D, E9 \
$ T8 W. f* l" X# ~, X7 X+ ^
  2. 我把这4个质粒的图谱都看了一下,其中并没有你说的同时存在BamH I和Nhe I的情况,倒是有同时存在BamH I 和 Nde I的情况。: p7 j5 L1 |4 B2 e
      希望你再核对一下你的质粒名称,以及酶切位点。
6 h# Y3 T$ D! S! j) h, ]! X
0 |$ b0 o$ ~9 u0 B* q1 i  3. 如果你之前提供的信息是对的,那么当你插入你的目的基因后,它一定不会按照你想要的方式表达你的目的基因。目的基因的序列必须和启动子的方向一致,才能得以表达。
# V: A# w, ^; r# o9 a
/ `; {. a3 z4 q( J. p1 k, s      如果是这样的话,我能想到的一个简单的解决方法,就是用一平一粘的方法把你的目的基因插入pNL质粒。7 B, {* p% H! a" w) Y2 B

- j! E9 @( n+ V, w; F4 Z9 @( Q# h      具体的步骤是:% p! }" o) q  Z* f

$ c+ {+ ^. \4 W0 h* i$ O      a.用合适的酶把pUC57质粒和pNL质粒分别线性化; b.用klenow酶把切开的质粒进行平末端化;c. 用BamH I把平末端化好的质粒酶切,产生粘性末端;
1 z" k$ Y& q+ @# x" D
% j. k( ]$ I) F- G2 K& f+ B: F- l      d.然后分别回收你想要的片段进行连接。
& G+ V+ a6 X* ^0 K  d# [8 U6 p' l  ?& ]
     这样就可以把目的基因正向插入到pNL载体中了。
9 \4 Y# W' q5 h
1 B0 E1 x3 W& |' T6 H    这只是我自己的一点想法,希望别的战友也能一起帮帮忙。
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12楼
发表于 2010-10-19 20:02 |只看该作者
如果有起始密码,反向表达的多肽序列也是无意义的。。。
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13楼
发表于 2010-10-21 21:33 |只看该作者
回复 11# 深海寂寞鱼
; e. ]0 P- L& n
2 g2 K8 `. Z' C* j- _3 E* c- [
7 V: E: V: G7 Z. T5 i    太感谢你了!想不到你这么热情,我很感动!

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14楼
发表于 2010-10-21 21:41 |只看该作者
回复 11# 深海寂寞鱼
. l5 x; \( ]" ?+ K* K
4 |. ^4 x, Q2 f! s  Y" T- Y  {, f. ~- A& l! @9 p( o) G+ L
    能把你的联系方式如QQ告诉我吗?我想以后请教就方便了!

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15楼
发表于 2010-10-21 22:00 |只看该作者
反正就2种结果,方向相反和不相反,我先接上看会不会表达再说,如果不会就是反了,再从新接。9 w+ T1 Z/ P! g" e
谢谢大家的热心帮助!
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16楼
发表于 2010-10-22 08:36 |只看该作者
选的酶不同应该是不会顺序相反的,质粒构建完成后,需要鉴定,测序什么的应该可以避免你这种问题的。
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