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楼主: xyklmu
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Cell stem cell最新文章:Highly Efficient miRNA-Mediated Reprogramming     [复制链接]

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发表于 2011-4-13 10:52 |只看该作者
我个人感觉这篇文章做的很不错,包括了很多方面,不光是简单的重复,希望那篇文章能给我们些启发
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发表于 2011-4-13 12:59 |只看该作者
本帖最后由 临床干细胞 于 2011-4-13 13:00 编辑 $ g- N2 M. G- d+ \0 D8 T3 Y

* i6 X1 ^1 ^+ ~( q. ?3 H) UmicroRNA用来代替转录因子的想法,我们查一下本BBS去年的贴子,就有多位站友提出过类似的想法了,这篇文章可以说就是这么做的,8 }. \; k& n8 C; t: _# |

5 }/ Y0 U, ~$ {$ D% S* h0 T至于是不是造假,没有证据不好评说,但是,如果一个方法一个技术没有可重复性,那它的真实性必然受到质疑,当初韩国的黄禹锡在science上的造假,不是有人揭发他,而是其他人用他的方法做不出来,大家都在质疑,后来实在瞒不住才承认是造假了% u: n7 s% h3 d5 k$ T

0 p- }6 v6 e& q3 F. i3 O' M所以说,造不造假与是否发在牛刊是否是牛人并没有必然关系,任何一名科研工作者,如果能从中找出让人怀疑的地方,大家讨论也有助真相被揭开
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发表于 2011-4-13 14:16 |只看该作者
是不是造假,裴端卿组的人一试不就知道了。如果结果真实的话,那实验的关键就在于诱导条件中加入VPA的操作了,相信用裴端卿组的iCD1 medium应该效率再高个数量级
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发表于 2011-4-16 01:44 |只看该作者
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本帖最后由 snokey 于 2011-4-16 01:47 编辑 & ]: z0 W5 _9 E4 }; `5 K4 x& [' Q: Z
, \2 f0 t( c; ^, O; D& [" d
回复 cicadacjk 的帖子
0 A% ?5 o: j7 Y- P7 o9 K0 M4 ?1 l+ K; s$ d! P3 s, X" e
兄弟消息很准嘛。Deepa的文章出来了。难道是YM兄?哈哈

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发表于 2011-4-16 20:04 |只看该作者
回复 snokey 的帖子( X' P9 u& D$ b( E! v( {/ G

' G0 j$ R+ ^* S# s3 n* D: a当时我看到Dlk1文章时就有同样的直觉了,当然希望不是如此,毕竟这样还是给别人留下不好的名声,何况得罪的是hochelinger和jaenisch这一派的人。# _+ z; o& U6 L- N+ l$ y
  o# @! [/ ?9 N+ p6 N  a- I
呵呵,你肯定不认识我的,我还在国内的,只是恰巧认识Blelloch实验室的人。不过消息还有点不准确,之前有篇EMBO J的miRNA的文章,那个实验室也做了302 family的
* j) Q; A. [8 z  n# g6 Y  ~, q$ {
有时候逆转录病毒做不出来,不能说慢病毒就没希望,但这么高的效率,总应该有点苗头。最严格的重复,应该等拿到那实验室的质粒再说了。然后,他们的鉴定从客观来说还是比较少的,比如四因子的插入,细胞的品系都没有鉴定,也就是说无法排除污染,所以……通讯作者还是比较安全的。
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发表于 2011-4-20 10:52 |只看该作者
回复 cicadacjk 的帖子
' f1 S  ~/ e$ [; x* i5 K" c% Q5 r9 E& f0 V3 H/ g
说的是!ips领域圈地运动愈演愈烈啊。好在现在华人圈子也占据一席之地了。$ Z. K5 `. c" a$ U5 C1 W! h. ~' N

4 n$ B) u7 `) C  X另:hochelinger和jaenisch是不是已经分道扬镳了?: l. \0 I- j& y* r, Y: A1 i- B$ m) b# M
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发表于 2011-5-6 17:05 |只看该作者
可怜的我,同一篇文章放在不同的帖子中,被我下了两遍,然后发现自己已经下过的。弱弱的问句,能不能把我的包包加回来呀。
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发表于 2011-5-18 09:59 |只看该作者
回复 xyklmu 的帖子
2 k( d" Y1 v/ }4 @) J8 S3 j. d6 x4 [0 W% i! P2 t
别人已经用miRNA-302abcd诱导人的毛囊细胞形成ips cell.现在又添加一个miRNA-367,有新意吗?为什么还发在cell -stem cell?
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发表于 2011-5-18 11:36 |只看该作者
本帖最后由 gxmwzy 于 2011-5-18 11:38 编辑
. j; h, H% c( N) y
5 W% s2 R( C2 t; N" M大家好,我是一个初学者,没做过细胞重编程方面的实验,也就看了几篇文献。看了这篇文章之后,不敢说有什么意见,不过有一些疑问,主要是关于VPA的。
, e) B3 g9 Y2 Y6 g' s, {1.文章中提到在MEF中,miRNA302/367在VPA存在的条件下才能诱导重编程,效率比4F高两个数量级。并且引用了哈佛的2008年《Induction of pluripotent stem cells by defined factors is greatly improved by small-molecule compounds》这篇文献,说4F的诱导效率是0.2-0.8%。但是这篇文献我看过,其中说4F的诱导效率是0.03±0.02%,并且用的逆转录病毒。不知道两者的矛盾怎么解释。更重要的是,这篇文章中说VPA能提高4F的诱导效率超过100倍,但其本身不能诱导。但是本文却说miRNA302/367在VPA存在时下才能诱导重编程,唯一的解释是和4F相比,miRNA302/367具有独特作用,但更可能是解释是两者中其中有假。
7 [; s% p6 T$ v$ g3 J5 y2.本文说在人的成纤维细胞中,miRNA302/367可单独诱导重编程,并且VPA不能提高诱导效率,由于人细胞中本身缺乏VPA的靶点--HDAC2。作者在讨论中对两者的差异解释为细胞系之间的差异性。而《Induction of pluripotent stem cells by defined factors is greatly improved by small-molecule compounds》中表明,至少在MEF中(虽然不是人的细胞),VPA除了HDAC的抑制作用,还通过上调ES-特异的基因并下调MEF特异的基因来发挥其作用。
4 g4 C; }" \8 {/ x. c0 d3.由1和2得出,假定两篇文章都是对的,只能说由于细胞间差异,miRNA302/367在VPA存在时的诱导效率比4F高两个数量级,而这样高的效率很可能是因为VPA而不是miRNA302/367。但无论如何,个人总感觉两文之间有一些是冲突的。0 W! S( H4 I( K! Y3 S( d9 C' {' v0 ~! q
请高手指教。
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发表于 2011-5-22 19:37 |只看该作者
有上传哈佛那篇文章的没
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