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楼主: dmmwhb
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[请教] Trizol提取RNA比值偏低   [复制链接]

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11楼
发表于 2011-11-6 14:23 |只看该作者
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回复 dmmwhb 的帖子3 P8 }+ X, w! y9 A2 u$ v4 F
9 N& `0 f) U+ B+ d
这么短的时间是不会的,我经常这样,测出来的A260/A280不会超过2,大概1.8左右吧!
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12楼
发表于 2011-11-6 18:04 |只看该作者
回复 dmmwhb 的帖子8 c# H0 Y/ D/ {7 V5 S# N
) t2 u' B) S2 i& F
那就取决于你RNA的浓度了!把它稀释到你测量仪器的范围内就可以了,我一般会稀释稀释过50倍、100倍、200倍,然后终浓度在10ug/ml左右比较好!但主要还是看你测量仪器的精确范围了!太浓了会使操作时的误差增大,而且损失样品,太稀了测不准,受杂志影响很大!
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13楼
发表于 2011-11-8 17:12 |只看该作者
我认为比值低应该还是污染,吸上清时不仅要注意不要吸到中间层,而且尽量不要重复吸,只吸一次就可。+ n4 f' e+ G' B! s( w; s* U
另外,干燥时间较短,我一般都20分钟左右,加DEPC水后,不需要等太长时间
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14楼
发表于 2011-11-10 03:22 |只看该作者
75% 乙醇那步没做好, 比值才会那么低, 回溶的步骤我建议在4度10mins
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15楼
发表于 2011-11-10 10:49 |只看该作者
回复 dmmwhb 的帖子  x4 P+ Q7 s+ t# J* i
* e$ T# m5 E# n( }% K! v
乙醇洗涤后挥发的时间太短了吧,没挥发干净会影响RNA质量的。我们一般都是尽量吸净乙醇残液,甚至用干净的吸水纸吸干,觅一个僻静之地室温挥发15min左右。溶解RNA时60-70°水浴助溶。
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16楼
发表于 2011-11-17 14:52 |只看该作者
回复 xiaoyurly 的帖子& P- s# v  U: v4 r- ^2 d
5 c- m$ ~( r; M1 X; N; [7 J6 q
先谢谢你的回复,说明书上说的只晾5-10min,久了不容易溶解,还有就是在室温久了容易降解啊,不过我没试过这个,下次还是试试晾干久一点
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17楼
发表于 2011-11-17 20:48 |只看该作者
同意dahui 的建议。大概3点建议:
7 a. a1 x$ S; N& K9 L- p( X- G1. 可以用75%乙醇洗两次,量用的大一些,上下颠倒几次,目的是把残留在管壁和RNA沉淀表面的盐去掉。最后一步去掉75%乙醇后,稍加离心,用10ul枪头吸去微量残液,室温晾干时切忌量得太干,否则及难容,观察到确实没有液体了,从最边缘开始有开始变白的迹象就加水溶解。
  ?" U& g& x0 u5 s' ~8 X, L$ K8 W2.换一批Trizol,氯仿和异丙醇试试,可以先从其他有成功经验的实验室借,用来做对比试验,一次替换一个对比元素,这样容易找原因。  `4 M2 K& H' o4 p4 G& V8 G
3.跑个电泳看RNA是否降解。
) k: W0 D$ L! v% H% _9 f, y祝你很快解决这个问题。
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18楼
发表于 2011-11-18 10:04 |只看该作者
回复 ilovelife 的帖子: M3 @3 S9 n8 ?9 o4 r
! t. O5 t0 k# ], j. a1 V
非常感谢ilove的建议
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