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OCT4分OCT4A,OCT4B和OCT4B1三种,另外OCT4有6个假基因。一般文献中的引物使用的引物大部分都没有区分出OCT4A, OCT4B,OCT4B1和假基因。只有OCT4A和干细胞的多能性相关,而很多细胞中都可以检测到OCT4B和OCT4B1,所以你检测到OCT4并不奇怪。关键要看你的引物设计的位置在哪里。OCT4中之用OCT4A含有第一个外显子,所以OCT4A特意性的引物一定要跨第一个外显子。另外,即使你可以区分OCT4A和其他异构体,但很难彻底避免PCR会扩增出非特异性条带,因为OCT4假基因和OCT4A的序列同源性至少大于97%。唯一可靠的是功能实验,因为OCT4A是转录因子,在核里,OCT4B不起转录因子的作用(在细胞质里),假基因没有蛋白产物。
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