想跟大家请教关于circRNA分析的问题

thinktank

如题，小弟关于circRNA的数据已经回来了，想找公司分析数据，论坛里有分析过circRNA数据的人吗，我想请教大家除了那些常规的分析包括差异分析，与miRNA互作之类的还有什么能够分析吗？？( g. ^1 T% r% y" I4 s
谢谢大家！

jddakui

环状RNA(circular RNA, circRNA)是一类存在几乎所有生物中的环形的RNA分子。目前，已经在人等模式生物中已经鉴定了成千上万的circRNA。研究发现，circRNA能够成为miRNA或RNA结合蛋白的海绵分子，可能在生理和疾病过程中发挥重要的功能。以下是circRNA相关的数据库列表，希望对大家的研究有所帮助。; G& L. P* U1 l. n
1. deepBase , 包含了大约15万的circRNA基因（人、鼠、果蝇、线虫等），构建了最全面的circRNA的表达图谱 。8 B6 I6 h, C: Y- r. p3 u
最新版本发布时间：2015年11月 。网址：http://deepbase.sysu.edu.cn/
0 k1 l1 M8 o( Q6 n* d2 g2. circRNABase , 整合已发表的circRNA数据，构建miRNA与circRNA以及circRNA与RNA结合蛋白（RBP)的互作网络。
" Y9 n9 ^% F% W7 e1 D6 H& r( y4 a最新版本发布时间：2013年12月 。 网址：http://starbase.sysu.edu.cn/mirCircRNA.php4 x0 s( d( F: o& E
4. circBase ， 收集和整合已经发布的circRNA数据构建的数据库。最新版本发布时间：2014年1月 。 网址：http://www.circbase.org/
5 ~5 T* a. q6 h' b; h& h8 J0 h4. Circ2Traits ，是一个收集与疾病或性状相关的circRNA数据库。最新版本发布时间：2013年12月 。 网址：http://gyanxet-beta.com/circdb/! B* H7 q/ ]4 H. n& i
希望对你有帮助

thinktank

回复 jddakui 的帖子
9 n/ S& T* h) p( u, M2 R) r' V7 u
/ T+ x0 Y% e. P& N* \十分感谢啊！