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环状RNA(circular RNA, circRNA)是一类存在几乎所有生物中的环形的RNA分子。目前,已经在人等模式生物中已经鉴定了成千上万的circRNA。研究发现,circRNA能够成为miRNA或RNA结合蛋白的海绵分子,可能在生理和疾病过程中发挥重要的功能。以下是circRNA相关的数据库列表,希望对大家的研究有所帮助。 D& k, m9 U7 X3 R
1. deepBase , 包含了大约15万的circRNA基因(人、鼠、果蝇、线虫等),构建了最全面的circRNA的表达图谱 。
9 {. M1 r& q7 A* o+ s最新版本发布时间:2015年11月 。网址:http://deepbase.sysu.edu.cn/ k2 J% z4 i: [& w, ?. g. {
2. circRNABase , 整合已发表的circRNA数据,构建miRNA与circRNA以及circRNA与RNA结合蛋白(RBP)的互作网络。
1 F/ s! K# A0 |1 i) Q* `" {最新版本发布时间:2013年12月 。 网址:http://starbase.sysu.edu.cn/mirCircRNA.php3 b1 G% x! d# [; I. H7 m- [
4. circBase , 收集和整合已经发布的circRNA数据构建的数据库。最新版本发布时间:2014年1月 。 网址:http://www.circbase.org/6 D( S Z4 e0 b( q7 L$ I
4. Circ2Traits ,是一个收集与疾病或性状相关的circRNA数据库。最新版本发布时间:2013年12月 。 网址:http://gyanxet-beta.com/circdb/3 P8 @! {# V _7 t5 k% e+ ^
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