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环状RNA(circular RNA, circRNA)是一类存在几乎所有生物中的环形的RNA分子。目前,已经在人等模式生物中已经鉴定了成千上万的circRNA。研究发现,circRNA能够成为miRNA或RNA结合蛋白的海绵分子,可能在生理和疾病过程中发挥重要的功能。以下是circRNA相关的数据库列表,希望对大家的研究有所帮助。
7 `! s7 q4 w; f4 o u# J1. deepBase , 包含了大约15万的circRNA基因(人、鼠、果蝇、线虫等),构建了最全面的circRNA的表达图谱 。; B( [, r% B/ B8 Q. l# B+ [3 k2 Y
最新版本发布时间:2015年11月 。网址:http://deepbase.sysu.edu.cn/$ k2 L5 w0 U0 \! B- s& X
2. circRNABase , 整合已发表的circRNA数据,构建miRNA与circRNA以及circRNA与RNA结合蛋白(RBP)的互作网络。
5 H" |3 f% r; X! V/ [5 r* ^1 ]2 g最新版本发布时间:2013年12月 。 网址:http://starbase.sysu.edu.cn/mirCircRNA.php
: R* i" x% n% A1 |. g4. circBase , 收集和整合已经发布的circRNA数据构建的数据库。最新版本发布时间:2014年1月 。 网址:http://www.circbase.org/2 Q* B7 V U: E# V8 g1 a" \
4. Circ2Traits ,是一个收集与疾病或性状相关的circRNA数据库。最新版本发布时间:2013年12月 。 网址:http://gyanxet-beta.com/circdb/' M7 X4 ] H3 r, Y% u
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