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[请教] 想跟大家请教关于circRNA分析的问题 [复制链接]

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楼主
发表于 2016-3-14 08:58 |只看该作者 |倒序浏览 |打印
如题,小弟关于circRNA的数据已经回来了,想找公司分析数据,论坛里有分析过circRNA数据的人吗,我想请教大家除了那些常规的分析包括差异分析,与miRNA互作之类的还有什么能够分析吗??
, M0 Y) R. C- B1 h" N$ f7 w, P谢谢大家!
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沙发
发表于 2016-3-16 13:13 |只看该作者
环状RNA(circular RNA, circRNA)是一类存在几乎所有生物中的环形的RNA分子。目前,已经在人等模式生物中已经鉴定了成千上万的circRNA。研究发现,circRNA能够成为miRNA或RNA结合蛋白的海绵分子,可能在生理和疾病过程中发挥重要的功能。以下是circRNA相关的数据库列表,希望对大家的研究有所帮助。
7 `! s7 q4 w; f4 o  u# J1. deepBase , 包含了大约15万的circRNA基因(人、鼠、果蝇、线虫等),构建了最全面的circRNA的表达图谱 。; B( [, r% B/ B8 Q. l# B+ [3 k2 Y
最新版本发布时间:2015年11月 。网址:http://deepbase.sysu.edu.cn/$ k2 L5 w0 U0 \! B- s& X
2. circRNABase , 整合已发表的circRNA数据,构建miRNA与circRNA以及circRNA与RNA结合蛋白(RBP)的互作网络。
5 H" |3 f% r; X! V/ [5 r* ^1 ]2 g最新版本发布时间:2013年12月 。 网址:http://starbase.sysu.edu.cn/mirCircRNA.php
: R* i" x% n% A1 |. g4. circBase , 收集和整合已经发布的circRNA数据构建的数据库。最新版本发布时间:2014年1月 。 网址:http://www.circbase.org/2 Q* B7 V  U: E# V8 g1 a" \
4. Circ2Traits ,是一个收集与疾病或性状相关的circRNA数据库。最新版本发布时间:2013年12月 。 网址:http://gyanxet-beta.com/circdb/' M7 X4 ]  H3 r, Y% u
希望对你有帮助
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藤椅
发表于 2016-3-21 15:18 |只看该作者
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$ D: `2 I: |' _7 {: A4 x% j+ w; c# d4 G" O" m3 j
十分感谢啊!
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