结直肠癌靶向测序揭示APC基因的潜在预后功能

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结直肠癌靶向测序揭示APC基因的潜在预后功能
2 m% q5 h8 p* z+ K( I4 ~0 v来源：测序中国 / 作者： / 2016-06-21; B2 T1 X  p. O$ m5 {, K$ |
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近期，发表在Nature Communications 上的一项新研究结果揭示，多种基因突变将会影响结直肠癌患者的生存与预后。5 s  d+ M% B- P
莫非特癌症研究中心、吉布斯癌症中心等机构的研究人员对500份结直肠癌样本进行靶向panel测序，重点关注1300多个已知或者疑似具有致癌性的基因，进一步结合病人的生存信息后，鉴定出17个潜在致癌基因，这些基因突变的频率与癌症基因组图谱（TCCA）报道的结直肠癌（CRC）肿瘤突变频率接近。
5 v9 J7 ~1 s9 I7 C8 t$ v其中，APC基因突变对结直肠癌的预后作用尤其明显。研究人员根据突变模式，提出了应用于CRC的APC分类系统，其中包含了5种突变类型。
% W' i" e: c! \作者在文章写道：“我们已经开发出一套应用于CRC预后的五类多基因突变分类系统，其中APC基因起到了关键作用。我们认为除了已知的用于癌症分类预测的BRAF、KRAS和TP53基因外，APC基因突变评估在常规的临床癌症预测中也非常有用。而且最终将帮助我们通过识别高风险与低风险群体，提升选取合适治疗方案的效率。”& V0 V$ d; b) c
该研究通过深圳华大的SureSelect靶向捕获和Illumina GAIIx测序，从468个CRC样本的1321个基因中搜寻相关的预后突变信息。同时按照Bethesda panel指南对样本进行微卫星不稳定性（MSI）分析。- N8 L/ ]! K" G: m
该研究发现对高不稳定性（MSI-high）的肿瘤组织而言预后一般会较好，13%的样本符合分析结果。这一发现与已有研究结果一致。但如果高不稳定性的肿瘤中同时含有BRAF突变，会导致存活率降低。0 _/ K: v+ f: i# F# L8 J  j
在微卫星稳定的肿瘤组织（MSS）中，研究人员发现了3个基因与癌症转移显著相关：APC、TP53和KRAS。同时含有这三种基因突变的肿瘤一般都属于恶性肿瘤。该研究中，超过1/5的CRC样本都发生了转移。如果病人同时含有2个APC突变，KRAS基因突变和TP53基因突变，那么一般很难获得较好的治疗。另外，研究人员还表示，对仅含有一个APC突变的肿瘤病人而言，无论是APC突变单独存在还是和KRAS或者TP53基因突变同时存在，会比不含有APC基因突变的病人存活时间更长。- }0 [6 ?* N' L0 I
作者表示：“我们认识到APC基因的预后功能，将帮助我们进行更加详细的突变分析以及更大样本规模的研究。”: y. p8 t  b$ V1 S" U' b, f- o
参考文献：A multigene mutation classification of 468 colorectal cancers reveals a prognostic role for APC. Nature
! {' c1 U8 G, E0 m! I# YCommunications 7, Article number:11743 doi:10.1038/ncomms11743.
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