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柳叶刀子刊:大规模测序发现癌症风险基因/ _6 k$ E/ U# Z& V
来源:测序中国 / 作者: / 2016-08-19
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0 G! s. k2 b. b8 k- K( x近期发表在《Lancet Oncology》上的研究表明,一些已知癌基因发生生殖系突变可能增加个人对肉瘤的易感性,肉瘤是一种罕见的骨组织和软组织癌症。
: y8 O9 ]' X ~% @/ B作为国际肉瘤家族研究(ISKS)的一部分,澳大利亚研究人员领导的一个国际小组对1000多名肉瘤患者进行了靶向基因panel测序。除了已知的与肉瘤相关的基因突变外,测序数据还揭示出,与其他癌症类型相关的基因,例如TP53、ERCC2、ATR、BRCA2和ATM,出现了复发性突变。7 i3 ^& l- z& o" ^; W
研究人员发现,在这些接受检测的患者中,超过一半的人携带有至少一个癌症相关基因的突变,而且携带有多个癌症相关基因的突变的患者发生早发性肉瘤的风险会增加,这类人占了检测人群的1/5。5 Q M% B% G; H+ w3 G" Q5 R- D
文章通讯作者、Kinghorn癌症中心和Garvan医学研究所癌症部门主任DavidThomas说,“多种基因的影响相结合会增加肉瘤发生的风险,患者携带的突变越多,癌症发生就越早。”
$ D. P4 U% q, p" [* ~' e3 wThomas说,“以前我们无法判断出这些具有患病风险的人群和家庭,但是现在我们可以更好地管理这种风险,并帮助这些人在需要的时候进行治疗。”
; t" H- F1 Q! O5 ~" PThomas和他的同事重点关注了72个潜在癌症风险基因,对1162名15岁以上的肉瘤患者的血液或唾液样本提取DNA,并进行靶向基因panel测序。约3/4的人是高加索人,其中约15%的人患有多原发性癌。8 I; P% x' q* D [4 K
研究人员以来自三个大型研究(例如NHLBI的外显子组计划)的6500多名高加索人作为对照组发现,约55%的肉瘤患者出现了可疑的生殖系变异增加的情况,这些变异似乎是致病性的。突变多发生在TP53、BRCA2、ATM、ATR和ERCC2基因中。
! y$ f) C2 T' V8 S, G4 M/ B- t除了这些癌症风险的线索之外,Thomas表示,“引起癌症风险增高的这些遗传变异还可帮助我们了解,如何采用最好的方式治疗癌症。在我们的研究对象中,1/3的患者携带的基因突变给了我们重要的信息,告诉我们如何定期监测这些患者以及他们是否应该接受某种治疗。”
, c! T2 I: D6 e例如,28名肉瘤患者发生BRCA1或BRCA2生殖系突变,影响乳腺癌和卵巢癌风险。约20多名患者的ERCC2基因发生罕见的致病性突变,ERCC2基因编码的蛋白通常有助于减少化疗相关毒性。 @3 }( v2 I. G* e' J. r
该研究小组计划继续扩大当前研究结果,对具有肉瘤风险的人群的生殖系样本进行全基因组测序,目前研究已经启动。5 h& G' M W; ]/ e% N$ q( |
参考文献:Monogenic and polygenic determinants of sarcoma risk: an international genetic study. DOI: http://dx.doi.org/10.1016/S1470-2045(16)30147-4, R1 q. V" a, w" p, N4 Z: j U
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