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[请教] 请教:当出现下列情况时应该怎么办? [复制链接]

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包包
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楼主
发表于 2009-9-14 08:34 |只看该作者 |倒序浏览 |打印
1、在测序结果上游找到了5‘引物时,在测序结果下游找到了3’引物时,去掉引物之后的序列即为最终结果对吧?2、在测序结果上游找到了5‘引物时,在测序结果下游找到了3’引物时,去掉引物之后的序列需要如何转换成最终目标结果?3、在测序结果上游找到了5‘引物的方向互补序列时,在测序结果的下游找到了3’引物时,去掉引物之后的序列需要如何转换成最终目标结果?4、在测序结果上游找到了3‘引物时,在测序结果下游找到了5’引物时,去掉引物之后的序列需要如何转换成最终目标结果?5、在测序结果上游找到了3‘引物时,在测序结果下游找到了5’引物时,去掉引物之后的序列需要如何转换成最终目标结果?6、在测序结果上游找到了3‘引物的方向互补序列时,在测序结果的下游找到了5’引物时,去掉引物之后的序列需要如何转换成最终目标结果?

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沙发
发表于 2010-4-13 21:11 |只看该作者
最终结果不用去掉引物序列啊。。。。。
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藤椅
发表于 2010-5-7 13:18 |只看该作者
不用这么复杂的;VENT-NTI比对就OK了,
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板凳
发表于 2010-5-10 14:09 |只看该作者
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如果测序引物是在5端的,测序出来的结果就是你要的序列。而如果是3末端引物的测序结果是互补序列的结果,需要reverse(可以用Vector NTI 软件)。
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