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[请教] 请教有关real-time PCR批次间差异过大的问题 [复制链接]

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楼主
发表于 2010-6-5 16:48 |只看该作者 |正序浏览 |打印
请教各位老师一个有关real-time PCR的问题
- T7 K9 [  b, k- B, J$ W/ d' {  P* `+ w" E
我做了几个月的real-time PCR了
# n8 H# G! L; M: y( ]
2 }8 K+ z9 J1 f/ o; b发现批次间结果差异很大
# g* W% B& m  @0 R0 P/ ~
9 ?( x( o8 H) l8 j& v+ v虽然趋势都是一样的,可是每次CT值差异很大4 t7 N1 i: [* i) t3 ]9 N! }
/ @: B% k+ p/ ]' J4 B- q1 f
比如说我有4个组,可能某一次扩出来后,四个组的某基因表达比例为1:3:5:7% u/ u& W. E* u, |

& N3 G, W! q6 }下一次再做,可能就变成1:5:9:13了。。。。& b4 p2 }4 Y1 i/ r  ^

0 [9 o# h2 j3 d1 q8 ~* B0 l  d7 ]虽然说递增是对的、也是理想状态,可是这增加的幅度也太大了点吧。。。
7 M3 b: V( l. N9 Z7 j
) A3 Z# [% {3 R而且批次间增加的幅度都不一样!
' m& \) k! V2 l) i
3 ?8 ]1 [7 ?! t. m, l是不是跟细胞有关系呢?! ~, }6 q  e0 d( u

$ n9 Y% R9 v4 b/ A$ X  t" n我每次做Real time用的细胞都是原代细胞,会不会是细胞的批次间差异导致的呢?
! r" N8 P: h: h! x8 w5 R  g: {3 [- [0 V" q
非常郁闷,希望各位老师能给予点拨哈
/ C4 U8 x! r, U: h$ s( f- @
+ W5 g; s% y5 X! m小弟在此先行谢过!
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地板
发表于 2010-7-10 10:29 |只看该作者
不知道你注意过仪器温度没,我们也遇到过类似的情况,怀疑是环境温度过高,对仪器产生影响
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报纸
发表于 2010-6-12 10:53 |只看该作者
做 real -time  没有统计图 等于没有做 。
. `; M! {$ E0 K& w5 O) |$ R7 @# X! P
我还没有开始做,但是现在看文献是 这样的 。
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板凳
发表于 2010-6-11 22:01 |只看该作者
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不同批次细胞状态的确是不一样的,RT-PCR一般是相对定量,所以内参显得非常重要。看你举例的数据之间的差异都是一样的,只不过一组是2,一组是4。我估计这可能是在处理数据相对定量时内参发生理变化所致。估计你应该做了重复了,不同时间的实验结果肯定会有出入的,解决的办法就是如楼上所说,不确定的话就多重复几次,重复的结果才比较可信。
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藤椅
发表于 2010-6-10 12:58 |只看该作者
做三次 以上统计 ,单次,单次  的比 没有任何意义 。
& |+ z+ o6 n& S
$ M5 R) l9 q1 ?只有统计了才有意义
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沙发
发表于 2010-6-10 12:17 |只看该作者
顶起,继续求助~·
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