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[请教] 请教有关real-time PCR批次间差异过大的问题 [复制链接]

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楼主
发表于 2010-6-5 16:48 |只看该作者 |正序浏览 |打印
干细胞之家微信公众号
请教各位老师一个有关real-time PCR的问题
' t4 A* a5 A+ b9 O  l
* Q6 `, R4 Y8 }我做了几个月的real-time PCR了
3 d) C; |( @/ `6 @+ k5 d; m9 k
) z9 o0 {3 x- j发现批次间结果差异很大
8 u+ u* E& m" ~2 L4 ?) d( u' a0 b7 u; b3 |
虽然趋势都是一样的,可是每次CT值差异很大
9 v8 a1 I7 n" k5 U4 M
7 ^( F4 U  d( ~+ `比如说我有4个组,可能某一次扩出来后,四个组的某基因表达比例为1:3:5:7
  Y& \4 h. ~; ?5 N/ G3 H- x/ l  R, a& \5 c, e9 z
下一次再做,可能就变成1:5:9:13了。。。。5 ?9 _* {' O2 F, Q. G* |8 c7 {; G! j
, A% q* P4 A$ E# X# I6 R  P, f
虽然说递增是对的、也是理想状态,可是这增加的幅度也太大了点吧。。。
; A: @, [% g- {
$ |+ R$ R3 s6 x/ t' j: H0 R; D而且批次间增加的幅度都不一样!
5 O: n8 F" R6 `9 e. e" J: X% ]( m8 c- `
是不是跟细胞有关系呢?+ `+ D" y4 Y* V
. o4 p' h. |% d/ D, w; ]
我每次做Real time用的细胞都是原代细胞,会不会是细胞的批次间差异导致的呢?
) s: y/ P& u6 U! [4 L/ t) M6 m4 L, ~1 H7 H" X/ b
非常郁闷,希望各位老师能给予点拨哈
6 a5 y7 N- s0 @, x$ K1 D) }+ `  x: d8 h, D  _" g# x
小弟在此先行谢过!
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地板
发表于 2010-7-10 10:29 |只看该作者
不知道你注意过仪器温度没,我们也遇到过类似的情况,怀疑是环境温度过高,对仪器产生影响
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报纸
发表于 2010-6-12 10:53 |只看该作者
做 real -time  没有统计图 等于没有做 。4 x9 _* b7 M7 E8 a
) U' n; e' D* B6 h! Y1 |
我还没有开始做,但是现在看文献是 这样的 。
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板凳
发表于 2010-6-11 22:01 |只看该作者
不同批次细胞状态的确是不一样的,RT-PCR一般是相对定量,所以内参显得非常重要。看你举例的数据之间的差异都是一样的,只不过一组是2,一组是4。我估计这可能是在处理数据相对定量时内参发生理变化所致。估计你应该做了重复了,不同时间的实验结果肯定会有出入的,解决的办法就是如楼上所说,不确定的话就多重复几次,重复的结果才比较可信。
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藤椅
发表于 2010-6-10 12:58 |只看该作者
做三次 以上统计 ,单次,单次  的比 没有任何意义 。3 I2 E/ Q, `! S" N0 k/ Y

9 k& k2 J4 s: c9 _" ]7 C只有统计了才有意义
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沙发
发表于 2010-6-10 12:17 |只看该作者
顶起,继续求助~·
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