干细胞之家 - 中国干细胞行业门户第一站

 

 

搜索
朗日生物

免疫细胞治疗专区

欢迎关注干细胞微信公众号

  
查看: 25722|回复: 5
go

[请教] 请教有关real-time PCR批次间差异过大的问题 [复制链接]

Rank: 2

积分
104 
威望
104  
包包
104  
楼主
发表于 2010-6-5 16:48 |只看该作者 |倒序浏览 |打印
请教各位老师一个有关real-time PCR的问题
! R$ n& `" x" s" n, l9 f) g! L. Z, Y  c( R  W/ a
我做了几个月的real-time PCR了, I4 H- k( D" H) L
7 A- c+ Z$ O) M; P
发现批次间结果差异很大, K; d9 [5 a1 n
5 q2 S# A! b; f& M2 h
虽然趋势都是一样的,可是每次CT值差异很大9 t3 g2 X0 z: d/ z, |
6 C: p! q5 t6 Y3 A5 M& T: y- f
比如说我有4个组,可能某一次扩出来后,四个组的某基因表达比例为1:3:5:77 z% P/ q  d+ D: ^- H6 O
5 B9 @3 t  t% ~* D2 O! F$ R
下一次再做,可能就变成1:5:9:13了。。。。8 L( U" z/ K& w2 c

3 I" A& q/ A" z3 s. t5 @虽然说递增是对的、也是理想状态,可是这增加的幅度也太大了点吧。。。! F. [% M  `( i$ a

7 N% x5 `% o) t7 u2 E8 P7 i- O% ~而且批次间增加的幅度都不一样!8 Y$ q4 U/ d! n$ Z
! S+ Z1 @  }5 q# @' Z- `- f) r7 c
是不是跟细胞有关系呢?' l' k6 g" `: k: u% b" Y: g. {: x
# [2 s3 }; J+ Q6 w8 B
我每次做Real time用的细胞都是原代细胞,会不会是细胞的批次间差异导致的呢?
) d) N" k9 Y# G+ _# \% O  t  Q  f. i+ u4 e2 t$ s" T
非常郁闷,希望各位老师能给予点拨哈
- r8 i% y5 V  s- G" m; Z1 l0 ^. J/ `- t, |* z) u- {
小弟在此先行谢过!
已有 1 人评分威望 包包 收起 理由
细胞海洋 + 5 + 10 欢迎参与讨论

总评分: 威望 + 5  包包 + 10   查看全部评分

Rank: 2

积分
104 
威望
104  
包包
104  
沙发
发表于 2010-6-10 12:17 |只看该作者
顶起,继续求助~·

Rank: 4

积分
1266 
威望
1266  
包包
2111  

金话筒 优秀会员

藤椅
发表于 2010-6-10 12:58 |只看该作者
做三次 以上统计 ,单次,单次  的比 没有任何意义 。2 w) ?) F+ Q3 c$ T

) G9 u$ D+ X, {/ e* k只有统计了才有意义
已有 1 人评分威望 包包 收起 理由
细胞海洋 + 2 + 5 欢迎参与讨论

总评分: 威望 + 2  包包 + 5   查看全部评分

Rank: 4

积分
1006 
威望
1006  
包包
3851  

金话筒 优秀会员

板凳
发表于 2010-6-11 22:01 |只看该作者
干细胞之家微信公众号
不同批次细胞状态的确是不一样的,RT-PCR一般是相对定量,所以内参显得非常重要。看你举例的数据之间的差异都是一样的,只不过一组是2,一组是4。我估计这可能是在处理数据相对定量时内参发生理变化所致。估计你应该做了重复了,不同时间的实验结果肯定会有出入的,解决的办法就是如楼上所说,不确定的话就多重复几次,重复的结果才比较可信。
已有 1 人评分威望 包包 收起 理由
细胞海洋 + 5 + 10 欢迎参与讨论

总评分: 威望 + 5  包包 + 10   查看全部评分

Rank: 4

积分
1266 
威望
1266  
包包
2111  

金话筒 优秀会员

报纸
发表于 2010-6-12 10:53 |只看该作者
做 real -time  没有统计图 等于没有做 。. B9 |) ?7 F, u/ z
6 l) y6 A0 v) S  h6 K2 X
我还没有开始做,但是现在看文献是 这样的 。
已有 1 人评分威望 包包 收起 理由
细胞海洋 + 2 + 5 欢迎参与讨论

总评分: 威望 + 2  包包 + 5   查看全部评分

Rank: 2

积分
223 
威望
223  
包包
375  

优秀会员 金话筒 热心会员 积极份子

地板
发表于 2010-7-10 10:29 |只看该作者
不知道你注意过仪器温度没,我们也遇到过类似的情况,怀疑是环境温度过高,对仪器产生影响
已有 1 人评分威望 包包 收起 理由
细胞海洋 + 2 + 5 欢迎参与讨论

总评分: 威望 + 2  包包 + 5   查看全部评分

‹ 上一主题|下一主题
你需要登录后才可以回帖 登录 | 注册
验证问答 换一个

Archiver|干细胞之家 ( 吉ICP备2021004615号-3 )

GMT+8, 2025-6-9 11:34

Powered by Discuz! X1.5

© 2001-2010 Comsenz Inc.