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表观遗传学创新实验 [复制链接]

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发表于 2010-9-2 18:23 |只看该作者 |倒序浏览 |打印
5’-氮胞苷处理水稻幼苗对基因组DNA甲基化的影响
$ G( E) N& b( l5 k6 S. T+ _庞劲松    刘宝
) f! l  U- c  |% o  j: `* X5 v. C  O3 s
( v7 O5 ]1 g% |  J+ a4 h* A
文本内容预览:- V, ]: ~4 E. s# {8 z
表观遗传学与DNA甲基化2 g5 x1 Q+ c) w, C& f- P
DNA甲基化作用0 h, E2 E- ]! |2 v: Q# O0 a
DNA的甲基化及其方式" Y& Z) k1 t( `
DNA甲基化的生物学意义
- Z! D- B, G5 I" {, V) k  uDNA胞嘧啶甲基化的种类和形成
: U+ h" p- I* ]DNA胞嘧啶甲基化检测
7 v7 f+ K6 `1 d6 R. ]# J% x检测方法:MSAP,bisulfite sequencing
' p: @, L( t( n! s0 K" y2 o5’氮胞苷处理对水稻DNA甲基化的影响: e* ?# g# y5 p3 W3 F# K
实验目的0 I+ V: Y9 u( ]+ E" n! u
实验材料# ?1 o! w/ E3 U0 W6 g% c5 ]
仪器
. S0 W6 M# b, O$ r3 j) ]6 z' F) w试剂
' H) B) a+ \3 b. c- n实验方法! V' Z4 q- [6 R% ?) U
5’-氮胞苷处理水稻幼苗
+ a$ V, F0 p; S. q植物基因组DNA的提取与纯化+ d( y) S' [" P$ h8 h, R; b
基因组DNA酶切-连接接头# Z' i8 e9 a! m# U3 B# x
PCR扩增:预扩增,选择性扩增
% S6 l7 |3 Z1 w0 u" h6 Q5 I7 bPAGE电泳1 g( A4 d; I. w+ S+ ~& V! Z7 y. x
预期实验结果
4 i% w2 m, y% k/ g/ m* ]1 T注意事项与建议4 e# x& f: v0 H, f, k
思考题
/ d* J$ p# `* w参考文献
" s; A* B+ E+ n' ?. w' @1 j, @. o. E8 S  _/ K- L) f+ B
表观遗传学:
% X* f0 M% X/ I2 q; c+ Z不需要基因序列改变而产生的可遗传的基因表达改变;主要包括DNA的甲基化修饰和组蛋白氨基酸的末端修饰。/ y$ x) e3 L6 T1 A) ~
表观遗传变异包括: X-染色体失活、转基因沉默、核仁显性和基因组印记等方面。
. Q& f( V3 p/ D7 g表观遗传变异的原因:是由于表观遗传密码的改变,如DNA甲基化、组蛋白的公家修饰改变等。
1 Y  t6 J) J# m4 t( G5 J' @, cDNA甲基化:3 k. r( T  _4 ?1 d
   在DNA 复制后,经DNA甲基转移酶(DMT)催化,将S-腺苷酰-L-甲硫氨酸(SAM)上的甲基基团连接到DNA 分子腺嘌呤碱基或胞嘧啶碱基上,进行DNA修饰的过程。
$ h) k8 }$ n! ?0 x% e; ~3 d3 f
* f( s; e' I/ e+ c; d9 g  DDNA甲基化的方式
2 N/ C0 K9 m0 ~, `/ Q, V2 w5 t胞嘧啶甲基化/ P+ V: U8 @! a1 a% j9 ^9 G! }; x
" Q# m$ V- p( r  v

) [7 ^1 e8 [' s
4 b" N: w5 W5 _8 S) h' H0 F' l腺嘌呤甲基化
- F) U5 g; G& d) E, H/ ~3 f' W0 l! p# q
DNA甲基化的生物学意义7 w& `/ H- S7 v! `$ E8 q
影响基因表达状态:通过该表基因调控区DNA甲基化程度调控基因转录4 z3 N, |8 S; v" g% o9 z

# M, y8 m$ y3 _8 U9 o, \& o2 G6 d  j7 w! ]1 i( u
                                  图3  甲基化与基因沉默
: W) m& Q) Q4 S; Z. d参与基因组防御:通过高度甲基化而使外源DNA(如转座子)处于沉默状态+ Q9 g, Q$ U" f! j6 v
提高环境适应能力:在不改变基因型的情况下产生可遗传的新表型. t8 l) G, q0 f- S

1 P6 o3 h* ~+ h3 X4 v& \2 K7 eDNA胞嘧啶甲基化的种类和形成3 L* H/ v) M7 E4 N0 J. q. C
* E4 f: j+ {4 d1 a8 f% k0 ~
从头甲基化 (de novo methylation)
- _2 I/ l0 }8 [8 P5 z: u  dDNMT3a,DNMT3b
  i1 B& }, A1 k: Z6 ^7 `在完全没有甲基化的DNA上加上甲基。3 U0 x. k9 k1 `  a, u. S) x7 o' \

6 y4 U, d$ o7 @4 o8 A维持甲基化 (maintenance methylation) % M( [/ x: }1 D
Met1,DNMT1
9 L3 F. S1 G7 G+ Z较特异地识别半甲基化状态的DNA,负责
4 ]9 R: ~4 M0 z% D    在细胞分裂过程中依据DNA母链的甲基化
- ~( h& R# t: V- g    状态给新合成的DNA链上加上甲基。
# }/ I  S* T6 s8 ?$ D& t
. A. o5 r6 r! c! Z* Q- U                DNA胞嘧啶甲基化检测方法3 q7 [! I* j. E) i

8 @* Y, R+ e, c) u5 w8 F1 w使用对胞嘧啶5’-甲基化状态敏感的限制性内切酶进行酶切处理,然后检测多态性:0 J" E0 P# C& t1 ]9 ?# z' {  v
甲基化敏感扩增多态性 (MSAP, Methylation Sensitive Amplification Polymorphism)
; e# S3 o1 u& q" a: i  D胞嘧啶转化为其它碱基,然后对比测序:0 q& ~1 R. \# F; ]. q- j# }& k
重亚硫酸盐测序 (Bisulfite sequencing)
1 G% m8 g) A- L   GCmTACT   重亚硫酸钠   GCmTATT# d9 R. m' w; h  E0 V
         测序                            测序
. ?- m" r( ^- u1 q: Q' s! K! R4 Q. d, d此外,还有单核苷酸法,甲基化接受力的检测法,CpG岛分离法和基因活性测量法,基因芯片法等 5 ^7 ~. L( z: Z' h
. F; C8 A% N8 k' E4 X: `. C8 N" T
MSAP4 ?1 G4 k) D) G; \8 P7 H
用途:" S! T, G( d0 o6 p8 @) h: m7 b
最常用的大规模检测基因组甲基化变异水平和位点的手段
- u2 z; s2 s  y2 z7 _& }  K原理:* S0 ~1 j6 b1 U
利用对DNA甲基化敏感性不同的同裂酶分别切割DNA,产生不同的酶切产物,同时将酶切产物添加接头,然后进行PCR扩增、PAGE电泳、银染,产生可见的具有不同酶切型式的谱带,即可得知DNA甲基化信息。7 e8 O3 ~* z; t/ {, d
甲基化状态分析:
2 P. a9 Q, t# m在不同泳道相对应的位置上,如果Msp I酶切产物有扩增带、而Hpa II酶切产物没有扩增带的,说明此处的序列是CCmGG;若都有扩增带,说明此处是CCGG。还可以进一步对差异条带进行切胶回收、克隆、测序,以便得知发生甲基化变化的胞嘧啶的具体位置。! S" y1 g5 z9 {8 ?" H% x' N/ T$ N
( S/ z" q6 |& H  A( O
表1  甲基化敏感酶对不同甲基化状态DNA的切割结果
- d/ \& F# `% ~. |/ g+ y" C- n- I8 R
0 u9 E( t4 O( }1 S. A% G6 gMSAP流程:, q: c: ^8 ^. z* K
* c2 e8 }6 {; d

7 c! q- l8 ?; ~( q( d1 u                                                       提取基因组DNA
% K- l, F' `/ w/ ]7 b& ~( H                                                             (注意发育时期和成长状态相同)
1 k: p# K9 d* I. @7 j2 s2 c/ v                            ………ATCCGGTGGCTTGCCmGGAC……
& J& O, G; S2 A- k4 X+ G  I                            ………TAGGCCACCGAACGG   CCTG……
2 j6 q8 J2 ~% ]( A                      Msp I 酶切+接头                                   Hap II酶切+接头
7 \  P" ^! L* Y4 \ATCC  GGTGGCTTGCCm  GGAC                 ATCC  GGTGGCTTGCCmGGAC
' r0 L- a$ C! g, CTAGG  CCACCGAACGG    CCTG                 TAGG  CCACCGAACGG  CCTG3 s/ v+ U+ V7 `* H

, P$ ~3 W( C$ U" x7 t7 c# v% a                           PCR                                   PCR
2 Y+ N' ]$ y5 \% e) k
& V, F0 U" L# v4 p4 Y                          PAGE电泳                               PAGE电泳5 e% i, V1 D. o0 J4 ]
6 Y7 W% s3 t# M
重亚硫酸盐测序
7 |7 p; W; G9 O7 d
! ?5 @6 G5 f  ^7 W, s. _* q实验目的# e, b6 m% }5 A; w. h$ q* j+ W
使用不同浓度的5’氮胞苷溶液,处理生长早期的水稻幼苗,使其基因组DNA胞嘧啶甲基化水平发生显著的可遗传改变,使用MSAP方法检测DNA胞嘧啶甲基化水平的改变;水稻幼苗因DNA甲基化水平改变而影响基因表达水平,产生明显的表观遗传表型。6 C1 p. l4 z- w% ], ~0 o2 z; L

* S! _; `# g; R' Y实验材料
$ U+ x. z: U' S5 J" N; f. z水稻:日本晴 (Oryza sativa var japonica, nipponbare)
) U- P/ h: i. _! g
, `0 ~" |: i& K6 p( ]% R        5’氮胞苷如何影响基因组DNA甲基化水平: 5’氮胞苷可以与DNA甲基转移酶(DMT)结合从而抑制其活性,在DNA复制过程中抑制维持甲基化作用,使复制后的DNA甲基化水平降低。# }# E+ P1 B- Q2 Q$ C! l% q
所需仪器
# Y- P, u: u9 }' z7 }- Y离心机          PCR仪         气浴摇床        水浴摇床       植物生长箱
$ V( S% ?1 z) c# e& i+ r9 @0 v! x( A1 o4 x9 m: i

0 @2 _3 c, j) `+ {6 r
, N+ f9 w' a/ D, N: q9 i, M4 z+ L* h% X% r0 y% d
  Z, V# z6 N3 i, T
  电泳仪        电泳槽        微量移液器         紫外分析仪   分析天平
: T' ]$ L5 C' y. c  S3 f9 K0 e
- T4 m# e% a% F$ L+ a试剂" K0 M' f; t: K' @
植物基因组DNA改良CTAB提取液:4 W8 q# r3 r4 m* `$ f4 Q* c
buffer A: 0.35mol/L Sorbitol,0.1mol/L Tris-HCl pH7.5,0.5mmol/L EDTA;
. K* ?: S+ n7 t" Ybuffer B: 0.2mol/L Tris-HCl pH7.5,0.05mol/L EDTA,2mol/L NaCl,2%CTAB;
" X+ [' F; Q1 [& N$ G8 Zbuffer C: 5%N-lauroylsarcosine
' I" g) D1 T3 |1 _PCR试剂:Takara rTaq,10X PCR buffer,ddH2O,
( s; c# b" j$ Y: [/ IPCR引物
: q! {' \7 g" C9 A$ Q; ]预扩增引物:
5 z, m+ d2 Q2 q4 @: G/ G: {5 x                        H/M+0: (5´-GACTGCGTACCAATTCA-3´)
7 E- d4 P2 @$ H" j" s+ h4 A  W2 _                        EcoRI+0: (5´-ATCATGAGTCCTGCTCGG-3´)
+ C' X) |/ a6 [/ e- X( B选择性扩增引物:
3 @# I% |/ @4 V3 x                        H/M+AN: 5´-GACTGCGTACCAATTCAA(T, C, G)-3´$ X0 w6 u" A9 p" M! c, n
                        EcoRI+AN: 5´-ATCATGAGTCCTGCTCGGA(T, C, G)-3´。
5 G1 q6 G8 \  U8 c& b9 [酶切-连接试剂:EcoRI (NEB),Hap II (NEB),Msp I (NEB),T4 DNA ligase,T4 10 x reaction buffer# K% u' H* i9 A2 k
接头:EcoRI adapter: 5’-CTCGTAGACTGCGTACC-3’      - p8 R7 `% q7 O% P
                                                  CATCTGACGCATGGTTAA
# p: F) t# K2 h0 m5 e                        HapII/MspI adapter: 5-‘GATCATGAGTCCTGCT-3’; K- ^/ K  _2 x. O3 L+ R
                                           AGTACTCAGGACGAGC* H! d5 F6 n) z5 ]9 H) T/ s( z
PAGE试剂:聚丙烯酰胺,尿素,AgNO3,Na2CO3,溴酚蓝, 0 P7 m2 M5 h3 _) N& H
# p0 q: V0 ?% ]! f9 ~
银染固定/终止液  (10%冰乙酸),染色液 (2升双蒸水预冷,用时加2克硝酸银,3ml 37%甲醛),显影液 (2升双蒸水中溶解60克碳酸钠,冷却至10-12ºC ,用时,加入3ml 37%甲醛,400ul硫代硫酸钠(10mg/ml))。
5 s5 T- Y* N2 n( {, C. q: C; b其它试剂:5’-氮胞苷(100mg/mL),蒸馏水,PVP (20%),氯仿:异戊醇(24:1),异丙醇,70%乙醇,RNA酶A (DNase-free),TE,TAE,琼脂糖,EB,未酶切的λ DNA, 1xTBE (0.089M Tris-borate, 0.089 M Boric Acid, 0.002 M EDTA) , 3x loading buffer (300 mM NaOH, 97% formamide, 0.2% bromophenol blue)。
7 C3 N4 e. Q; z/ P; R实验方法
5 P, w$ B5 Q% w" @5 \8 z! j5’-氮胞苷处理水稻幼苗:26℃,暗培养 % u6 L9 J$ t9 o, Y
(1) 取水稻Nipponbare种子10粒X 4组,分别置于90mm培养皿内的双层滤纸上,加入15mL蒸馏水浸种24h;(第一天)
3 L! J! p1 D$ e3 j  k& J(2) 分为三个实验组和一个对照组,实验组分别用25mg/mL, 50mg/mL, 100mg/mL5’-氮胞苷溶液处理,对照组用蒸馏水培养,共处理10天,每天换处理液1次;(第二~十一天)
% ^. ]0 u' Q- {6 h' f. |& d& C% g7 Y$ d  u! B% P
植物基因组DNA的提取与纯化+ ~3 }. x9 s; X; M) e0 c
改良CTAB法(Kidwell and Osborn, 1992)
. m; s) R4 [( q1 k5 ~4 v) U        不同处理的叶片1g6 Z4 P5 x" c; T% K, }3 Q1 {
                        液氮中研磨成粉
1 \2 F0 C" d8 k' M" l4 Z) M        转入50ml离心管  \6 C8 b: q1 G) [0 f
                        加入等体积DNA提取缓冲液(A:B:C=1:1:0.4混合,加1%PVP于B液)$ Y$ N2 _; f. r9 B
                         65℃恒温水浴摇床,40-50rpm振摇90分钟
4 b+ p  y$ Q- I# m# B6 V. L+ P                        加入等体积的氯仿:异戊醇(24:1),轻轻上下颠倒10-15分钟
6 e" Z6 v: x* r3 K/ `- p                        4℃3000rpm离心10-15分钟  B2 H1 g4 q& N. k1 C
                    上层水相
+ W- Z7 R" d& k. H  K1 x                        加入2/3体积的预冷异丙醇,上下颠倒5分钟并置4℃冰箱内10min
1 A# J' D* l% x7 }. n; G2 W( _                        DNA沉淀后于4℃3000rpm离心收集DNA于管底( F$ @9 V7 q, D" W5 N2 m& s
                        DNA于70%乙醇中过夜。
; D! M! h8 d1 f. Q- w7 O' L                    DNA沉淀* F4 w  q0 e3 W" @1 l' b
                                                                 (第十二天)
6 _* E1 I3 ~3 F# |, J5 r0 r* V5 ~! x
% |7 _- b, X" v2 j                        风干DNA
3 |& A9 B$ k) z; r% {& y$ i                Genomic DNA. A% C9 {2 M) e$ J
                        2ml Eppendorf中加1ml TE溶解沉淀6 P' n4 Z( h, `/ z
                        待DNA完全溶解后,加入5μl不含DNA酶的RNA酶,37℃保温30                        分钟以除去DNA中的RNA。
7 Y" x) Y$ v! F$ P3 P; u0 I                        加入等量氯仿:异戊醇(24:1) 纯化DNA,轻轻上下颠倒10-15分钟
* l! c0 E  f- w* K( G' D* c1 L                        4℃3000rpm离心10-15分钟" E3 Q5 j) P  ]/ t4 A
                   DNA沉淀
& _+ X1 p: {7 @6 @# A                        70%乙醇过夜洗涤DNA
  j. a) A: p2 E                        溶于DNA于200-500μl TE中( a8 U- K, `$ Y. K% O6 }
                Genomic DNA溶液
7 O! S0 N8 r2 h  E                        0.8%琼脂糖凝胶电泳,检查DNA的质量并据已知的DNA Marker                        (未酶切的λDNA)估计其浓度。6 Q! Z! X6 S, h# i
                        调整DNA浓度,置於-20℃备用。 4 m7 ^3 A/ u7 r* Q) I. \
/ T- s$ j4 N" y- m! l6 I
基因组DNA酶切-连接接头
3 `2 n- K# o+ d% X2 W甲基化分析采用两种甲基化敏感酶HapⅡ和MspⅠ(NEB)。在限制性酶切和连接前,先把两个单链的接头复性为双链结构(序列见试剂部分),即100℃变性5分钟, 缓慢冷却至室温,-20℃冷冻保存备用。5 X- n4 ~( q- c0 q& a  i
水稻MSAP限制性酶切和连接体系如下:
6 z/ p8 s8 ]$ z* y$ |- v
5 {0 I3 M0 ^: V6 S. ~PCR扩增
- Q& K2 Y0 O7 M1 r6 Z预扩增:水稻AFLP预扩增体系如右表(预扩增引物PCR引物部分): , }2 h3 E. Y& ^- ^* H+ t
混匀体系,按下列参数进行PCR扩增反应:
/ c) g! w. U6 H6 X- {0 [  `0 k: k4 W& F
; g& L0 E: R; F0 z

7 X) G! G% j/ Q$ w9 m: E' ?1 `$ h" v' l9 E' A
+ `# G$ n7 |$ Z( y% m
1 I0 s( E0 H2 n6 D  Q

% A, T8 A. G3 M# x7 L0 R$ w3 ]5 v# g0 c% m, U$ x9 Q- ?4 @% ]1 g
) n' j% X) b- r5 C8 H4 v6 S- I

. z' l1 Z! Q* h  \PCR程序:94℃ 预变性2min, 94℃变性30秒,56℃复性30秒,72℃延伸60秒, 共进行30个循环,最后72℃延伸10分钟。0 v% ]; U( N$ ?0 ~. I& [' x+ S
根据检测结果,用0.1x TE buffer稀释预扩增产物1/10~1/40,作为PCR选择性扩增的DNA模板。
8 J+ `4 L, y- W+ \# U7 T+ i$ o$ w2 \7 s2 O
水稻AFLP选择性扩增体系如下: * z" ]0 Y$ x: ~$ y4 B4 S) [( u+ w
, c4 C! A6 o% ]

9 d0 v- {2 L$ Q, l
+ B) \( z+ O/ X  B3 k5 b' S1 F) T& D7 J7 X1 T3 L$ N
! ~. o! c( d. [( d- p- u
4 s! b8 c# Q/ t, S+ ?
" F( p2 G' B) o4 ^8 \. O- B! W9 J
按以下参数进行PCR扩增反应: ! }+ V$ i  Z$ j! f. T) u: u
        94℃ 预变性2分钟, 94℃变性30秒,65℃复性30秒,72℃延伸80秒,以后每轮循环温度递减1℃,扩增10轮。接着94℃变性30秒,  55℃复性30秒,  72℃延伸80秒,共进行40个循环,最后72℃延伸10分钟。                    (第十七天)
& T8 h5 p$ \  b- z* V4 B
# s: v$ k  ^. E4 V" Q1 `* UPAGE电泳
, v3 o  V" ]0 D- i电泳装置图
# f! P4 W, v1 v" Y, T
& o0 o& f+ X1 z/ W- a0 m; C( @1 A5 n: |玻璃板分为大板和小板(上部凹形) 。
/ ?$ U# q" n# t) V% |& u        自来水清洗
9 o/ e. ^' p, m7 u) o' R& I" t# O2 Q; f
        95%酒精擦两遍
5 R1 s$ c  Y) k2 b; W2 O: h; K0 T# V0 K, R
        硅化:均匀擦涂亲和硅化试剂于大板的一面,剥离硅化试剂于小板的一面' \1 ~5 j, y8 g

. j' q/ i% C$ b6 ?4 q0 H        5分钟后,95%酒精再擦两遍,) T6 c# {1 o  X7 @; v" _3 G" _9 r
8 E2 a' m4 K$ N% J
                     装板3 ?" C7 r& _3 B9 `

- h8 t! N/ s6 b# E1 a/ H( u# l                     灌胶
% U) P% N& i( U  V+ f  x6 P/ F& }8 ]* P% m+ B9 }  E, P
尿素-PAGE胶配制
6 S: A) `: {1 n( ^8 q$ n+ l! u, w' d7 B1 C$ o
$ L) r2 D- G# \1 h( R

, Y% J& C, `& P8 w4 i& J; ?  t8 q4 [* }) f
        灌胶前,加入四甲基乙二胺(TEMED)30μL,10%过硫酸铵(APS)160μl,混匀,立即灌胶。灌胶时玻璃板倾斜15度。胶聚合1小时以上才可以电泳。( O, P2 r6 a- s, q
电泳:电泳仪采用北京市六一仪器厂DYY-10C型。电泳装置使用北京君意东方电泳设备有限司测序装置新JY-CX2B型。电泳缓冲液为1xTBE ,85W预电泳1小时,胶板的温度达到55˚C。点样前,DNA样品95˚C变性5分钟,立即冰浴,加3x loading buffer, 混匀,瞬时离心,点样量16μL, 恒功率55W电泳到指定位置,即可卸板染色。
. X: r+ f/ I+ x: l* b0 N
' w, f9 O; W( n7 ~2 A  Y5 Z/ H1 v银染操作& C7 j) y7 c9 I
电泳结束后,轻轻分离两块玻璃板,将
7 I; g) m; t7 {: V+ @        附着胶的大板置于固定/终止液中,轻摇1 {) G- a" @  u1 L3 Q5 j$ y) ]
        20分钟,直至指示染料消失。
! L3 o+ X) `' v凝胶洗涤,回收固定/终止液,用双蒸水* s6 Z# R6 i" ~
        洗涤凝胶3次,每次至少2分钟,凝胶板, t! M3 L: ]- C7 Q0 G
        从水中取出后,竖起空水15秒。" B, Z. {+ ~( A' N! c. I
染色,将胶板移至染色液中,轻摇30分钟。
+ V4 |! F! i9 y! P$ E凝胶显影,将染色后的胶板放入双蒸水中5-10秒,迅速取出并竖起控水,随后把胶板放入预冷的一半显影液中,充分摇动,当出现第一批条带后,倒入另一半显影液,轻摇至条带全部出现。(注意:从放入水中到放入显影液中,时间不应超过10秒。). n" ^7 w9 P/ w, O+ G6 O. f# v
终止显影,在显影液中直接添加等体积的固定/终止液(第一步中用过的),停止显影并固定影像。3 T# p0 y: O4 l3 k( J  [
固定完全后,即醋酸和碳酸钠反应完全(溶液不再有二氧化碳产生),用双蒸水洗涤凝胶2次,每次至少2分钟,凝胶板从水中取出后,竖起控水凉干备用。                          (第十九天)5 P, g( F7 u& M" q) E
6 e3 [6 d* X5 _6 v- U
预期实验结果
$ v$ u# X& [7 {5 K& Y/ C; F0 E同一位置处不同样品电泳条带的不同,显示此处胞嘧啶甲基化状态不同。                                        (第二十天)" ~5 q* |3 c4 |7 m

" t; _; h2 t8 ?1 w注意事项与建议
, @7 G, K0 y% ?: p9 `- ~7 E五氮胞苷(5-azacytidine;MW:244.21):粉末于-20℃保存,见光或遇热分解,使用时配母液于4℃保存,保存时间不宜超过半个月;
6 t( W- @7 j2 x, P丙烯酰胺为剧毒试剂,配制、使用时必须按有关规程做好个人防护;
/ j" B( y; e  N5 m0 I$ C思考题  h; {  @1 U8 Q
5’-氮胞苷为什么能使DNA甲基化水平降低?9 Z. X/ g  N$ R6 h; F3 L
MSAP的原理是什么?
! f4 L' G2 j" |/ `* M0 n# O如何分析MSAP电泳图?* `8 V; @1 X) ]  N( {: E
参考文献 6 B% W6 y3 {) M% p
[1] Razin A, Cedar H. DNA methylation-Biochemistry and Biological Significance. J Chromatogr, 1992, 581(1): 31-40.
4 e: I/ e+ [% {' p1 o[2] Flavell R B. Inactivation of gene expression in plants as a on sequence of specific sequence duplication. Proc. Natl. Acid. Sci. USA, 91:3490-3496.
$ c& L4 m: d* k* @[3] Ng H.H, Bird A. DNA methylation and chromatin modification. Curr Opin Genet Dev, 1999, 9(2): 158-163
' x1 V3 a. T! w4 u: _: h# d[4] Stokes T. Methylation of a different kind. Trends Plant Sci, 2001, 6(11):503-512.
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沙发
发表于 2010-9-2 19:35 |只看该作者
大家来看看,相互学习,留下简单的一笔,版块就会活跃不少,论坛也会活跃不少!o(∩_∩)o " ?8 W3 u% v2 o8 G* j. u
学海无涯,多学一些,有好处不是吗?

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藤椅
发表于 2010-9-3 15:59 |只看该作者
学习甲基化,目前表观遗传-甲基化的研究挺热门的,动物方面的更多了。

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板凳
发表于 2010-9-3 18:07 |只看该作者
干细胞之家微信公众号
回复 3# wxl87
$ T  y) G6 z2 f$ G3 n0 B8 V+ u' L6 ?2 y3 D, ?

# R+ D2 @3 k$ }    嗯嗯,我就是想不通为什么没人来讨论呢,谢谢你

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报纸
发表于 2010-9-3 18:17 |只看该作者
回复 4# exin11 ( X/ ^" X+ p" q* b( p+ D
; @1 h) n* M% T) t
6 q8 h0 y' u. `) k1 i' T
    你对甲基化了解吗?我这有篇帖子是问的关于甲基化的问题,你看看能否解答。谢谢。3 |4 {% Q; h' L* i" c
http://www.stemcell8.cn/thread-26667-1-1.html

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地板
发表于 2010-9-3 18:22 |只看该作者
回复 5# wxl87
% o- |) H7 y3 B! g  E; N2 H
" r4 [2 _# H+ _: C' s5 e# O0 Y
) R/ s; w# L2 |/ V   还行吧,相互学习咯。我看看哈

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