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[讨论] 请教一个双酶切的问题     [复制链接]

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楼主
发表于 2010-10-19 10:15 |只看该作者 |正序浏览 |打印
2个不同的质粒双酶切再进行连接的时候,如果2个酶切位点内的基因的顺序和启动子方向相反会不会对表达有影响?
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发表于 2010-10-22 08:36 |只看该作者
选的酶不同应该是不会顺序相反的,质粒构建完成后,需要鉴定,测序什么的应该可以避免你这种问题的。
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发表于 2010-10-21 22:00 |只看该作者
反正就2种结果,方向相反和不相反,我先接上看会不会表达再说,如果不会就是反了,再从新接。* d, R; `" o+ f$ c3 c
谢谢大家的热心帮助!
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发表于 2010-10-21 21:41 |只看该作者
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回复 11# 深海寂寞鱼
: z, r) q3 O! I. C( r2 e6 v1 W1 b3 }2 S6 N& d+ y' O8 \) b) \9 w

, S/ O; q" w7 t  z4 x. v+ c9 I/ \    能把你的联系方式如QQ告诉我吗?我想以后请教就方便了!

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发表于 2010-10-21 21:33 |只看该作者
回复 11# 深海寂寞鱼 / Z! P  q$ }% y, s# x& ]# f

- |" U3 M5 o* J# \1 p
3 N6 q0 Y: N9 f/ y( o* u    太感谢你了!想不到你这么热情,我很感动!

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发表于 2010-10-19 20:02 |只看该作者
如果有起始密码,反向表达的多肽序列也是无意义的。。。
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发表于 2010-10-19 13:21 |只看该作者
本帖最后由 深海寂寞鱼 于 2010-10-19 13:23 编辑
) j; u  I* x  V) B$ @, m* |3 n2 v. w
0 I$ ~! o1 j% X- _( a5 i/ a. {to sidalin301:2 a& I2 f8 ]. i9 O6 {

$ z& N9 u9 V0 n. _; f/ I6 u" D- l   你的问题描述的并不是太清楚。大致的意思是把目的基因从pUC57质粒上切下来,插入到pNL质粒中。但是因为没有pNL的质粒图谱,所以你担心可能会把序列反向插入,从而使目的基因不能表达。
, q' q8 m. W0 |1 B  Y) ]6 ?" [7 y: `) q  |$ p5 i& [
  1. 解决这个问题的关键在于找到pNL质粒的图谱,如果没有图谱,一切都是在猜测之中。
  D1 F, h/ @" k) I8 ?: r* i2 z   
+ z1 m. x) [7 r      我试着帮你找了找,在Addgene的网站一共找到了4个相关的质粒。(见下图)1 t3 l( L; J) x' ~% ]) b$ B
      不知道你的质粒具体是其中哪一个?
' z/ P5 T6 K  V       1.jpg   F3 v/ P0 T  G0 L* t1 Q

! s9 t, T  K# C# W  2. 我把这4个质粒的图谱都看了一下,其中并没有你说的同时存在BamH I和Nhe I的情况,倒是有同时存在BamH I 和 Nde I的情况。
- s/ u7 X' A- B, D5 I      希望你再核对一下你的质粒名称,以及酶切位点。' F8 J% T+ b7 V: Q* Z

; O/ Y6 E- V: b, {6 @  3. 如果你之前提供的信息是对的,那么当你插入你的目的基因后,它一定不会按照你想要的方式表达你的目的基因。目的基因的序列必须和启动子的方向一致,才能得以表达。
) v, G0 P3 V" T. P. O: w6 m/ h% Z7 y& z9 ?7 C; i
      如果是这样的话,我能想到的一个简单的解决方法,就是用一平一粘的方法把你的目的基因插入pNL质粒。
" \' t2 g8 z8 z0 s: ~9 v2 \  h4 z, t9 T* l
      具体的步骤是:
9 ^3 U  s4 p/ h7 g: _6 v' Y
5 {# W' F9 [; d/ a7 \7 x# b      a.用合适的酶把pUC57质粒和pNL质粒分别线性化; b.用klenow酶把切开的质粒进行平末端化;c. 用BamH I把平末端化好的质粒酶切,产生粘性末端;+ ^! H. F: _$ y  n; a
' Y( {' R( r; i
      d.然后分别回收你想要的片段进行连接。7 ]6 k8 `1 A' D
" a1 @- |! T# K. }. ^
     这样就可以把目的基因正向插入到pNL载体中了。) {( O8 x/ Z$ T( D

% X! O7 ?. ?7 _    这只是我自己的一点想法,希望别的战友也能一起帮帮忙。
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发表于 2010-10-19 11:45 |只看该作者
回复 8# ghfvcat 7 a( P1 [! _) s0 Q
* L9 J- H# C  q# K1 ^
  s3 Y8 A# w, o1 I
    谢谢

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发表于 2010-10-19 11:45 |只看该作者
谢谢了

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发表于 2010-10-19 11:29 |只看该作者
回复 7# sidalin301
; a, D& l; O4 b  e/ c% g: p6 W$ q0 J, {. I  H

4 a6 u2 r: k+ w    这样你就必须检查了,方向反的话是不可能正确表达的,不是有没有影响,是完全没表达,去查一下你用的载体的序列,
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