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楼主: sidalin301
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[讨论] 请教一个双酶切的问题     [复制链接]

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专家 优秀会员 金话筒 新闻小组成员

11楼
发表于 2010-10-19 13:21 |只看该作者
干细胞之家微信公众号
本帖最后由 深海寂寞鱼 于 2010-10-19 13:23 编辑
- o* W0 u0 v: P
7 P) ^2 P5 V9 I# |to sidalin301:
5 C: c1 G& B& D7 X* J, u
0 P/ q( I" c* F   你的问题描述的并不是太清楚。大致的意思是把目的基因从pUC57质粒上切下来,插入到pNL质粒中。但是因为没有pNL的质粒图谱,所以你担心可能会把序列反向插入,从而使目的基因不能表达。$ _8 P2 Z: y; P7 f6 p) O' E
$ H  ~) m3 P, K5 q6 y- R1 ?* q
  1. 解决这个问题的关键在于找到pNL质粒的图谱,如果没有图谱,一切都是在猜测之中。( k" Z( f$ l1 ~- p% n) J7 _9 W
   
3 `8 z' l# Z0 m) k" k      我试着帮你找了找,在Addgene的网站一共找到了4个相关的质粒。(见下图). L% k1 E( I9 U0 _
      不知道你的质粒具体是其中哪一个?
. A% S* z' G+ i2 e. {! H       1.jpg , J6 b+ H, ?. ~6 x$ G! f. o4 g
/ D3 S; W; V0 |+ n# b7 t
  2. 我把这4个质粒的图谱都看了一下,其中并没有你说的同时存在BamH I和Nhe I的情况,倒是有同时存在BamH I 和 Nde I的情况。
; ~% t& }8 z( b* A) J. ?* m* x* u      希望你再核对一下你的质粒名称,以及酶切位点。: ~1 I! |/ k$ {& y0 |& U

) p, F9 p$ q& u2 F) I/ W! Y0 X  3. 如果你之前提供的信息是对的,那么当你插入你的目的基因后,它一定不会按照你想要的方式表达你的目的基因。目的基因的序列必须和启动子的方向一致,才能得以表达。
% g( J. `, a" V& s1 t% {
9 O, j" P9 [0 V, o6 [      如果是这样的话,我能想到的一个简单的解决方法,就是用一平一粘的方法把你的目的基因插入pNL质粒。
/ P% g+ P- P( U! L6 D' @
$ Z4 _/ v3 _1 j4 v  D      具体的步骤是:
9 ^5 X0 g9 \9 b  p0 U5 V+ V
3 V: n8 t8 ]& J) Y3 t' [1 m  j      a.用合适的酶把pUC57质粒和pNL质粒分别线性化; b.用klenow酶把切开的质粒进行平末端化;c. 用BamH I把平末端化好的质粒酶切,产生粘性末端;+ M# T' I' H" {
* ~& B& l& o. ~4 ?. ?
      d.然后分别回收你想要的片段进行连接。; r! w: Z4 \4 K) t$ }

! }( X1 H$ _& b; j$ c     这样就可以把目的基因正向插入到pNL载体中了。
3 k; z4 n; w2 F3 G
& `. |( z! N# g* w3 K9 j6 I4 X' R    这只是我自己的一点想法,希望别的战友也能一起帮帮忙。
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12楼
发表于 2010-10-19 20:02 |只看该作者
如果有起始密码,反向表达的多肽序列也是无意义的。。。
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13楼
发表于 2010-10-21 21:33 |只看该作者
回复 11# 深海寂寞鱼 & [/ S5 ~7 ]* ^8 r3 ]: k
  u& H" }/ ^1 T! i
6 G/ G8 m$ ]3 C& V! ^
    太感谢你了!想不到你这么热情,我很感动!

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14楼
发表于 2010-10-21 21:41 |只看该作者
回复 11# 深海寂寞鱼 9 `  P% y7 J% \  R

# f; p5 m- r8 G# b3 J
% E& t+ Y  Q9 f; T4 e4 h    能把你的联系方式如QQ告诉我吗?我想以后请教就方便了!

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15楼
发表于 2010-10-21 22:00 |只看该作者
反正就2种结果,方向相反和不相反,我先接上看会不会表达再说,如果不会就是反了,再从新接。
5 F2 y6 M+ W8 B$ D) ^# N谢谢大家的热心帮助!
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16楼
发表于 2010-10-22 08:36 |只看该作者
选的酶不同应该是不会顺序相反的,质粒构建完成后,需要鉴定,测序什么的应该可以避免你这种问题的。
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