shRNA 测序问题求助？

christone

最近构建了能够表达shRNA的慢病毒载体，用上有测序引物进行测序时，测序结果总是在插入位点之后就开始出现双峰（排除多克隆的可能），是不是发卡结构不能测序啊？
. ?8 T+ h: g5 T% ]. H/ N1 v请做过的高人赐教啊，谢谢大家了。

64627675

可以测序的，没有什么问题，我们一直都有做这个，只是测序难度大一些，有时候也要看测序公司水平的，不知道你在哪里测序的，我们在华大基因测的，大部分时候测序还是满好的，偶尔会出问题

christone

回复 64627675 的帖子6 q6 M8 [& d5 [% N9 ], U4 V% @1 f
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好的，谢谢！我在华大还有桑尼都测过，结果测序的几个都是那样的。打算重新设计测序引物，测序引物是不是离插入位点稍微远一点好啊？

zhenhua

"测序引物是不是离插入位点稍微远一点好". a3 P! l" \" i2 }( T$ E
没试过，应该会好一点。0 \5 w* X* ~3 p/ S) u$ \# Z
高级结构会有影响，不过可以测出来，还是重设引物测吧