imagej 的荧光分析

future007

请教一下各位同学，怎样利用imagej来分析细胞平均的荧光强度呢？

luoziwei

我也想知道

osterix

我做过imageJ的荧光强度分析，可以探讨一下。; @) ], I# K# a* _, W
需要将图片转换成黑白形式(8bit or 16 bit等)，然后选中细胞区域（设定阈值、用魔术棒选择即可），然后用ROI管理你选中的细胞或细胞团，设置你所需要的measure的参数然后，measure就可以得到你所需参数。不懂在问吧。

osterix

注意，在不同细胞图像之间，要用统一的参数，在设定阈值是，使细胞区域都能在这个范围之上(会变颜色的)，然后用魔术棒一点，即能全部选择，用ROI再次选择区域即可了。非常简单，当然还有自动化处理的，这个比较麻烦。需要插件，

future007

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你好，我想问一下，阈值怎么设定，这个我不太懂，谢谢啊

osterix

可以通过调整阈值，观察是否包含细胞区域，这样分析多张代表性的图像后，初步确定这个阈值。注意：不可能包含所有细胞，只要大部分细胞都包含在内（80%以上吧）就可以了。因为细胞荧光的差异性很大。

james_0619

http://rsb.info.nih.gov/ij/docs/index.html，这个网址里面有比较多的介绍

james_0619

imagej这款软件挺好用的