科学家确定DNA第7种和第8种碱基

decloud2009

这个就算第7,第8,那鸟嘌呤的甲基化状态是最常见的,怎么就没有人给它编个9\10\11碱基啊...
: Z! e0 K) L/ X6 W" ~2 v' w我觉得science那帮人也不是吃干饭的..这篇文章能上的原因应该是可以通过这个tet蛋白可以得到DNA脱甲基过程中的一个中间状态或者中间物质," Y$ U7 _& y& ?3 k# j( Q0 L  v" R
一旦这个中间状态或者物质可以跟某个肿瘤基因有什么关联的话,我们就可以通过这个中间状态或者物质来研究analog, 从而有望研治靶向药物,来达到治疗癌症的目的或者解释其他一些跟基因有关的异常现象...8 f; W0 r$ u- p- @7 V' [, {" ]

" S6 m( \7 t/ g* V9 }# Q就好像我们认识雌激素之后,研究其结构与功能,从而研制相似物来对治疗一些对雌激素高度敏感的疾病,70年代在欧洲美洲广泛使用的DES就是其相似物...

decloud2009

这个就算第7,第8,那鸟嘌呤的甲基化状态是最常见的,怎么就没有人给它编个9\10\11碱基啊..., M" V% H) a9 U: |
我觉得science那帮人也不是吃干饭的..这篇文章能上的原因应该是可以通过这个tet蛋白可以得到DNA脱甲基过程中的一个中间状态或者中间物质,
- _1 N4 ^$ `( \4 K3 c1 \5 S0 B8 M一旦这个中间状态或者物质可以跟某个肿瘤基因有什么关联的话,我们就可以通过这个中间状态或者物质来研究analog, 从而有望研治靶向药物,来达到治疗癌症的目的或者解释其他一些跟基因有关的异常现象...2 [. ?6 x+ X% ~3 Q' j
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就好像我们认识雌激素之后,研究其结构与功能,从而研制相似物来对治疗一些对雌激素高度敏感的疾病,70年代在欧洲美洲广泛使用的DES就是其相似物...

decloud2009

这个就算第7,第8,那鸟嘌呤的甲基化状态是最常见的,怎么就没有人给它编个9\10\11碱基啊...
- U0 _7 x( K: M; V0 i) q我觉得science那帮人也不是吃干饭的..这篇文章能上的原因应该是可以通过这个tet蛋白可以得到DNA脱甲基过程中的一个中间状态或者中间物质,; a7 b8 z( I8 f# Q
一旦这个中间状态或者物质可以跟某个肿瘤基因有什么关联的话,我们就可以通过这个中间状态或者物质来研究analog, 从而有望研治靶向药物,来达到治疗癌症的目的或者解释其他一些跟基因有关的异常现象...
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就好像我们认识雌激素之后,研究其结构与功能,从而研制相似物来对治疗一些对雌激素高度敏感的疾病,70年代在欧洲美洲广泛使用的DES就是其相似物...

ambassador

sunsong7 发表于 2011-7-24 13:37
. M0 x. l# g6 z& R$ W$ y5 }作者：Yi Zhang 来源：《科学》 发布时间：2011-7-23  6 v  z- w  L2 z/ p

6 \1 `! S- p+ ~1 |/ E据美国每日科学网站7月22日（北京时间）报道，美 ...

# @& B6 |! d! [9 u0 F这个文章有标题党的嫌疑啊！根本不是什么全新的碱基，加一个甲基，甲酰，就成了新的碱基？？？我觉得太不可思议了！

ambassador

ljzmy82 发表于 2011-7-25 17:51
* C; O; }/ K9 V, W6 g: Y% i  ?有深度！

8 E6 D; o; T$ B: ]* P都是四种碱基的衍生体！哗众取宠！

cicadacjk

我也有听到其他人批评张毅那篇nature的，说是同样的表现在敲除鼠上观察不到1 m# f; y$ v8 n( E9 h( w) x
我了解这个东西比较晚，2010年初才开始了解的，大paper最近都会集中出来的，从敲除周期看。DNA去甲基化本身是非常有意义的事情，现在也不能确定羟甲基化就和去甲基化相干了。其实这个领域最大的问题是区分主动去甲基化和被动去甲基化，因为细胞分裂一次，就被动去一次~

sannia

呼唤全文。
" K/ w; R7 M0 Y6 e) D" c3 i3 R- z最近这种去甲基化研究极其热门，我觉得任何小方向的研究都有可能与去甲基化相关。一个急功近利的想法就是，无论你做什么课题，都可以检测一下这个去甲基化，如果有点关联，至少可以提高paper一个档次。就跟当年小RNA一样。' P- K; e- M" n! Q9 C. ~/ }
最近我们研究所来了一个新加坡的PI，做的就是这个。面试的时候把张毅的那篇小鼠Tet1.2.3的paper说的一无是处
' S0 f+ z- l0 u+ v1 D  o! F可他自己也就发了一个 Mol Cell，据说是投了cell，被大牛们压死了。

ljzmy82

有深度！/ w' D6 A4 M2 |- Q

cicadacjk

好文章，但我觉得这个提法有问题9 }/ u( T# W% \1 ~, d
这四种都是胞嘧啶的修饰方式，迄今为止也没有主流是将它们称为四碱基外的碱基，所以科技日报这个题目有点哗众取宠了- T1 r7 ?6 W% l% Z- f, e1 U
张义的这个发现还是很厉害的，在Tet的竞争中取得了绝对优势，DNA的甲基化已经是人所共知，但脱甲基化的过程是否存在则一直有争议，在Tet之前也有不少蛋白被报告具有脱DNA甲基化的能力，羟甲基化是一个比较好的开始，因为从某个角度讲，这可以是氧化的第一步。目前已知的体内脱甲基过程多数是氧化方式的，如果最终这个甲基能变羧基，那通过脱羧反应，应该可以实现去甲基化，但我估计脱羧会有另外一个酶来行使该功能。% z  m* J) r* A8 }% {5 m
从这两个修饰在之前的层析中（2009 Science）没有被发现的事实来看，其含量应该远比羟甲基化的胞嘧啶要低，这提示几个可能性：一、从羟甲基化到甲酰化，可能是个限速步骤，Tet在这一步可能要协同其他的蛋白去行使作用，既然Tet在ChIP seq分析中结合多数CpG岛，我推断其特异性不高，可能会协同某个识别组蛋白密码的基因去完成甲酰化，从而导致特异性；二、也可能是胚胎干细胞中最终脱羧的酶含量较低，所以造成部分中间体残留。而且脱羧反应的终产物是二氧化碳，是否低氧高二氧化碳的微环境会使这个化学平衡有微妙的变化，从而抑制脱羧，这个情况值得注意。
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另外我比较关心的是Tet家族全敲后，受精后父本染色体的甲基化变化情况，因为精子的染色体在受精后是100%被重编程的，我相信如果有去甲基化发生的话，这个步骤一定是其中一个例子。